More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3265 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  100 
 
 		 612 aa  1218    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  56.79 
 
 		 610 aa  706    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  35.15 
 
 		 617 aa  371  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  33.98 
 
 		 630 aa  351  2e-95  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  35.82 
 
 		 626 aa  348  2e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  33 
 
 		 617 aa  343  5.999999999999999e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  31.91 
 
 		 628 aa  322  9.999999999999999e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  33.85 
 
 		 620 aa  300  6e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1446  sodium/hydrogen exchanger  34.33 
 
 		 641 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3229  sodium/hydrogen exchanger  32.71 
 
 		 652 aa  257  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0859  sodium/hydrogen exchanger  36.03 
 
 		 640 aa  257  5e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2891  sodium/hydrogen exchanger  32.71 
 
 		 652 aa  257  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2292  sodium/hydrogen exchanger  31.42 
 
 		 637 aa  242  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.042334  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0956  sodium/hydrogen exchanger  33.05 
 
 		 639 aa  238  2e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0888  sodium/hydrogen exchanger  32.29 
 
 		 628 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.043911 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2740  Sodium/hydrogen exchanger  32.41 
 
 		 629 aa  233  6e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0127  sodium/hydrogen exchanger  29.3 
 
 		 760 aa  230  7e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.302904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1211  Sodium/hydrogen exchanger  32.02 
 
 		 611 aa  227  5.0000000000000005e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3909  Na+/H+ antiporter  33.55 
 
 		 607 aa  224  4e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0220  hypothetical protein  29.38 
 
 		 598 aa  213  5.999999999999999e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04922  Na+/K+/H+ antiporter  28.84 
 
 		 597 aa  209  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0146  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  33.41 
 
 		 763 aa  208  2e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269507 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1072  sodium/hydrogen exchanger  29.12 
 
 		 601 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.558941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4152  sodium/hydrogen exchanger  29.76 
 
 		 608 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561792 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0511  sodium/hydrogen exchanger  30.52 
 
 		 622 aa  207  6e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03225  Na(+):H(+) antiporter, CPA1 family protein  30.37 
 
 		 625 aa  206  9e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0850  sodium/hydrogen exchanger  28.37 
 
 		 617 aa  206  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0156  sodium/hydrogen exchanger  32.95 
 
 		 764 aa  205  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000727  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  28.84 
 
 		 599 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2605  sodium/hydrogen exchanger  31.74 
 
 		 637 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00858761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1871  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.41 
 
 		 666 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4254  sodium/hydrogen exchanger  28.92 
 
 		 601 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1467  sodium/hydrogen exchanger  28.72 
 
 		 601 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1024  Sodium/hydrogen exchanger  30.25 
 
 		 602 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30796  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0707  sodium/hydrogen exchanger  30.65 
 
 		 651 aa  197  5.000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2400  sodium/hydrogen exchanger  31.81 
 
 		 625 aa  196  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000130765  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00461  Na+/H+ antiporter  30.22 
 
 		 569 aa  196  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16030  putative sodium/hydrogen antiporter  29.17 
 
 		 611 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.08 
 
 		 596 aa  195  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1380  putative sodium/hydrogen antiporter  28.96 
 
 		 611 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00463957  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1982  sodium/hydrogen exchanger  29.49 
 
 		 619 aa  195  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  27.08 
 
 		 596 aa  194  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2318  sodium/hydrogen exchanger  30.36 
 
 		 599 aa  194  4e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0395796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.08 
 
 		 596 aa  194  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.08 
 
 		 596 aa  194  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4667  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.89 
 
 		 596 aa  193  8e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4369  sodium/hydrogen exchanger  26.11 
 
 		 596 aa  192  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2147  sodium/hydrogen exchanger  31.44 
 
 		 670 aa  192  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251145  normal  0.368531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2224  sodium/hydrogen exchanger  31.44 
 
 		 673 aa  192  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00760493  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4436  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.89 
 
 		 596 aa  190  8e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00005477  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2537  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.84 
 
 		 669 aa  189  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4478  sodium/hydrogen exchanger  27.85 
 
 		 602 aa  189  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1861  sodium/hydrogen exchanger  33.5 
 
 		 719 aa  189  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.182882  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2324  sodium/hydrogen exchanger  30.94 
 
 		 670 aa  188  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.339898  normal  0.580137 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  29.02 
 
 		 741 aa  187  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1998  sodium/hydrogen exchanger  30.38 
 
 		 616 aa  186  8e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112153 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2394  Na+/H+ antiporter  33.93 
 
 		 593 aa  186  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00954713  hitchhiker  0.00302602 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5185  sodium/hydrogen exchanger  29.11 
 
 		 660 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0424  sodium/hydrogen exchanger  31.18 
 
 		 852 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2109  sodium/hydrogen exchanger  31.95 
 
 		 643 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2869  sodium/hydrogen exchanger  24.56 
 
 		 623 aa  183  9.000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.824474  normal  0.920346 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0477  sodium/hydrogen exchanger  30.72 
 
 		 616 aa  179  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0802705  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05361  CPA1 family Na+/H+ antiporter  30.13 
 
 		 399 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0521  Sodium/hydrogen exchanger  27.49 
 
 		 604 aa  177  6e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2308  sodium/hydrogen exchanger  30.49 
 
 		 660 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0868  Na(+):H(+) antiporter  25.05 
 
 		 606 aa  173  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2017  sodium/hydrogen exchanger  30.49 
 
 		 660 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000155921  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2321  sodium/hydrogen exchanger  30.49 
 
 		 660 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.545125  hitchhiker  0.000203679 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2065  sodium/hydrogen exchanger  30.49 
 
 		 660 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000562767  hitchhiker  0.000963897 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0472  CPA1 family Na+/H+ antiporter  29.74 
 
 		 399 aa  172  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0494569  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06781  putative Na+/H+ antiporter, CPA1 family  30.77 
 
 		 421 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2077  Na+/H+ antiporter, putative  28.41 
 
 		 595 aa  165  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04731  CPA1 family Na+/H+ antiporter  30.81 
 
 		 402 aa  163  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.281963  normal  0.831051 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04971  CPA1 family Na+/H+ antiporter  29.47 
 
 		 401 aa  160  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1732  sodium/hydrogen exchanger  29.32 
 
 		 702 aa  159  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05271  CPA1 family Na+/H+ antiporter  30.31 
 
 		 401 aa  159  2e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0377759  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0042  sodium/hydrogen exchanger  26.45 
 
 		 607 aa  155  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126585  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4282  sodium/hydrogen exchanger  27.14 
 
 		 609 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05281  CPA1 family Na+/H+ antiporter  29.44 
 
 		 414 aa  146  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0626531  normal  0.0646135 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1805  CPA1 family Na+/H+ antiporter  29.44 
 
 		 414 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1720  CPA1 family Na+/H+ antiporter  31.56 
 
 		 414 aa  144  7e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19170  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  24.95 
 
 		 640 aa  143  9e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.490991  normal  0.0684118 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  29.35 
 
 		 498 aa  142  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  31.34 
 
 		 406 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3821  sodium/hydrogen exchanger  27.72 
 
 		 407 aa  132  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0759  sodium/hydrogen exchanger  27.79 
 
 		 584 aa  128  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135673  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  29.15 
 
 		 477 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  29.22 
 
 		 414 aa  127  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  25.96 
 
 		 496 aa  122  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  28.65 
 
 		 478 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  28.88 
 
 		 481 aa  121  3.9999999999999996e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0640  CPA1 family Na+/H+ antiporter  30.42 
 
 		 421 aa  121  4.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0222  potassium/proton antiporter  28.7 
 
 		 499 aa  119  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  26.46 
 
 		 581 aa  117  8.999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  25.73 
 
 		 597 aa  116  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  27.71 
 
 		 574 aa  116  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  29.94 
 
 		 445 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1203  potassium/proton antiporter  28.65 
 
 		 486 aa  114  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.195277  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  28.79 
 
 		 605 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0583075 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0702  sodium/hydrogen exchanger  28.83 
 
 		 431 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.429987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>