155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1919 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1919  TrkA domain-containing protein  100 
 
 
144 aa  289  9e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1262  TrkA domain-containing protein  38.4 
 
 
141 aa  85.9  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1729  TrkA domain-containing protein  43.33 
 
 
143 aa  84.3  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000411585  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1656  TrkA domain-containing protein  42.5 
 
 
143 aa  83.6  9e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153236  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  39.32 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_26  cation transport protein, Trk system  35.9 
 
 
134 aa  70.5  0.000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0437885  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0026  TrkA domain-containing protein  35.9 
 
 
134 aa  70.5  0.000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2083  TrkA-N domain protein  33.61 
 
 
210 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0027  potassium uptake protein, putative  35.9 
 
 
134 aa  70.5  0.000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248151  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0253  TrkA-N domain protein  38.39 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  33.04 
 
 
219 aa  67  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2911  TrkA-N domain protein  32.59 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0359474  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1486  TrkA domain-containing protein  28.03 
 
 
221 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  31.82 
 
 
214 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0807  TrkA-N domain protein  35.4 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  32.14 
 
 
214 aa  63.5  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1685  TrkA domain-containing protein  28.97 
 
 
153 aa  62.8  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.124287  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1451  TrkA domain-containing protein  28.03 
 
 
221 aa  63.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0437642  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  31.25 
 
 
214 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  33.63 
 
 
347 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  29.13 
 
 
214 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2257  TrkA-N domain protein  28.47 
 
 
220 aa  61.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1323  TrkA-like  28.91 
 
 
264 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0250  TrkA-N domain protein  33.62 
 
 
219 aa  59.3  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00280  K+ transport system, NAD-binding component  33.62 
 
 
219 aa  57.4  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1642  TrkA-N domain protein  34.21 
 
 
219 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623208  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1521  TrkA-N domain protein  33.63 
 
 
220 aa  57  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.709024  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  29.01 
 
 
626 aa  57  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1634  TrkA-N domain protein  27.27 
 
 
224 aa  57  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000521907 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1347  TrkA-N  31.62 
 
 
134 aa  55.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0274494  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2473  TrkA domain-containing protein  27.34 
 
 
223 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.214066  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3927  TrkA domain-containing protein  28.06 
 
 
234 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0233751  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1928  putative potassium transporter  30.08 
 
 
224 aa  55.5  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.292607  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2903  TrkA domain-containing protein  29.2 
 
 
220 aa  55.1  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1641  TrkA domain-containing protein  26.45 
 
 
223 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270311  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1877  TrkA-N domain protein  27.69 
 
 
222 aa  53.9  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.608746  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2275  TrkA domain-containing protein  29.46 
 
 
489 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3756  TrkA-N domain protein  31.25 
 
 
236 aa  53.5  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000258956  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  28.07 
 
 
384 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  33.62 
 
 
346 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04100  K+ transport system, NAD-binding component  28.8 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.632996 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01270  K+ transport system, NAD-binding component  32.76 
 
 
219 aa  52.8  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2197  TrkA-N  28.68 
 
 
217 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1708  TrkA-N domain protein  29.36 
 
 
216 aa  51.2  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0311888  normal  0.0547174 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2243  TrkA domain-containing protein  28.68 
 
 
217 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20721  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2186  TrkA domain-containing protein  28.68 
 
 
217 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0106506 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12706  trk system potassium uptake protein ceoB  25.9 
 
 
227 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2285  TrkA-N domain-containing protein  29.2 
 
 
221 aa  50.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.311674 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1562  TrkA-N domain protein  28.81 
 
 
221 aa  50.4  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16170  K+ transport system, NAD-binding component  27.35 
 
 
221 aa  50.4  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.11506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5191  TrkA domain-containing protein  26.28 
 
 
243 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0357985  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1923  TrkA-N domain protein  28.81 
 
 
220 aa  49.7  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  27.03 
 
 
366 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  27.27 
 
 
233 aa  48.9  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4527  TrkA-N domain-containing protein  26.27 
 
 
221 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.621759 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13070  K+ transport system, NAD-binding component  27.12 
 
 
233 aa  49.3  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00265603  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  30.17 
 
 
330 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1917  TrkA-N domain protein  30 
 
 
217 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.678679  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  31.01 
 
 
218 aa  48.9  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  30.97 
 
 
332 aa  48.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  33.98 
 
 
628 aa  48.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  30.66 
 
 
220 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  30.97 
 
 
332 aa  47.8  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 
617 aa  47.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  32.71 
 
 
368 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  30.23 
 
 
221 aa  47  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  30.23 
 
 
221 aa  47  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  29.82 
 
 
450 aa  47  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1454  TrkA-N domain protein  34.09 
 
 
443 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2874  TrkA-N domain protein  27.05 
 
 
242 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493191  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  29.67 
 
 
458 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  29.67 
 
 
458 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  29.67 
 
 
458 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6759  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  30.7 
 
 
221 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  27.41 
 
 
223 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  31.87 
 
 
458 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  29.2 
 
 
330 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  29.2 
 
 
337 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  29.2 
 
 
334 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  29.2 
 
 
334 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1405  TrkA-N domain protein  27.93 
 
 
218 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.364271  normal  0.729476 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  27.47 
 
 
458 aa  45.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  29.2 
 
 
330 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  27.94 
 
 
617 aa  45.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  34.31 
 
 
399 aa  45.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  29.46 
 
 
221 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  24.22 
 
 
218 aa  45.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  29.2 
 
 
220 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  26.81 
 
 
222 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  29.46 
 
 
221 aa  45.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2875  TrkA-N domain protein  26.47 
 
 
226 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220378  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  30.7 
 
 
226 aa  44.3  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  27.13 
 
 
241 aa  44.3  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  27.91 
 
 
218 aa  44.3  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0899  TrkA domain-containing protein  24.64 
 
 
567 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  26.81 
 
 
222 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1489  hypothetical protein  28.12 
 
 
218 aa  43.9  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00984888  normal  0.0109156 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  27.47 
 
 
458 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.461523 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  27.47 
 
 
458 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  27.47 
 
 
458 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>