89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3479 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3479  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 446 aa  925    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0217  hypothetical protein  35.65 
 
 		 476 aa  285  9e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1632  hypothetical protein  35.65 
 
 		 447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1719  hypothetical protein  35.65 
 
 		 447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129966  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1135  FAD dependent oxidoreductase  36.94 
 
 		 447 aa  267  2.9999999999999995e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5094  hypothetical protein  37.35 
 
 		 460 aa  254  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0849389  normal  0.895154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1000  hypothetical protein  36.6 
 
 		 460 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1500  monooxygenase FAD-binding  31.89 
 
 		 441 aa  244  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4305  monooxygenase FAD-binding  35.71 
 
 		 460 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1239  monooxygenase FAD-binding protein  33.18 
 
 		 484 aa  239  6.999999999999999e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3995  hypothetical protein  31.94 
 
 		 460 aa  232  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0842  hypothetical protein  34.35 
 
 		 443 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4009  monooxygenase FAD-binding  32.74 
 
 		 477 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1187  monooxygenase FAD-binding protein  32.8 
 
 		 463 aa  225  9e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4956  monooxygenase, FAD-binding  30.8 
 
 		 443 aa  222  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6384  monooxygenase FAD-binding  32.62 
 
 		 444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00239538 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0830  monooxygenase FAD-binding  33.57 
 
 		 453 aa  220  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3971  putative phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  33.89 
 
 		 468 aa  219  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163754  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2622  monooxygenase FAD-binding protein  32.87 
 
 		 447 aa  218  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2731  hypothetical protein  30.96 
 
 		 440 aa  212  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00924641  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5929  hypothetical protein  32.15 
 
 		 458 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1825  hypothetical protein  30.26 
 
 		 469 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2716  hypothetical protein  31.03 
 
 		 440 aa  210  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000407728 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1042  hypothetical protein  32.18 
 
 		 482 aa  209  7e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142247  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4243  hypothetical protein  31.31 
 
 		 449 aa  209  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.159627  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2099  monooxygenase FAD-binding  31.93 
 
 		 463 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2441  hypothetical protein  30.47 
 
 		 440 aa  207  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109464  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2721  hypothetical protein  31.26 
 
 		 440 aa  206  5e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2710  monooxygenase, FAD-binding  31.25 
 
 		 459 aa  206  9e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2517  hypothetical protein  30.34 
 
 		 440 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2702  hypothetical protein  30.34 
 
 		 440 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2478  hypothetical protein  30.34 
 
 		 440 aa  204  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00689698  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1923  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 		 531 aa  204  3e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.674457 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1018  hypothetical protein  29.4 
 
 		 468 aa  203  5e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2443  hypothetical protein  30.57 
 
 		 440 aa  203  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6971  hypothetical protein  32.11 
 
 		 468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2587  hypothetical protein  30.55 
 
 		 440 aa  199  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.064334 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0829  monooxygenase FAD-binding  32.18 
 
 		 457 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2768  hypothetical protein  29.35 
 
 		 440 aa  195  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2091  monooxygenase, FAD-binding  30.65 
 
 		 436 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1777  monooxygenase FAD-binding  31.89 
 
 		 471 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4135  monooxygenase FAD-binding  31.54 
 
 		 460 aa  186  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3651  monooxygenase FAD-binding  31.85 
 
 		 477 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0463097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7423  monooxygenase, FAD-binding  28.92 
 
 		 490 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0286  FAD dependent oxidoreductase  36.11 
 
 		 445 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0600  hypothetical protein  31.93 
 
 		 460 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0494768  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0613  hypothetical protein  31.93 
 
 		 460 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0591  hypothetical protein  31.85 
 
 		 460 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4604  monooxygenase FAD-binding  31.55 
 
 		 509 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.366392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4178  monooxygenase, FAD-binding  30.33 
 
 		 558 aa  171  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5692  hypothetical protein  30.77 
 
 		 508 aa  171  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.085115  normal  0.0485746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0831  hypothetical protein  31.1 
 
 		 452 aa  166  8e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4723  hypothetical protein  31.22 
 
 		 449 aa  164  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.486773 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4358  monooxygenase FAD-binding  29.34 
 
 		 447 aa  163  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00255024  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18660  FAD binding protein  30.91 
 
 		 468 aa  163  7e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.49198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1348  hypothetical protein  31.07 
 
 		 462 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.885775 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1331  hypothetical protein  31.07 
 
 		 462 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1367  hypothetical protein  31.61 
 
 		 462 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0650  monooxygenase FAD-binding  33.12 
 
 		 487 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13283  hypothetical protein  30.39 
 
 		 462 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.246672 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1470  FAD dependent oxidoreductase  32.66 
 
 		 446 aa  147  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.662537  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0513  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 		 472 aa  144  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0165805  decreased coverage  0.000000367703 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4064  FAD dependent oxidoreductase  30.27 
 
 		 469 aa  137  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.218745  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1538  monooxygenase FAD-binding  30.7 
 
 		 471 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00900279  normal  0.975685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4003  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.9 
 
 		 844 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.454074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11966  oxygenase  27.32 
 
 		 839 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.595898 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4116  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 		 476 aa  92.8  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2498  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 500 aa  85.9  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  hitchhiker  0.000580756 
 
 
-
 
NC_003296  RS01754  putative signal peptide protein  27.73 
 
 		 497 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.95051  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6664  FAD dependent oxidoreductase  26.18 
 
 		 518 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00617853  normal  0.854513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4171  NADPH-dependent glutamate synthase beta chain  27.06 
 
 		 490 aa  60.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3863  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520485  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  25.47 
 
 		 480 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2773  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 447 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308714  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2787  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 447 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2743  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 447 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.211141  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4211  monooxygenase FAD-binding  28.16 
 
 		 429 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747744  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  24.38 
 
 		 418 aa  51.6  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4834  hypothetical protein  53.33 
 
 		 235 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  23.08 
 
 		 507 aa  48.5  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3959  monooxygenase FAD-binding  27.43 
 
 		 411 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2944  monooxygenase, FAD-binding protein  29.38 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  24.4 
 
 		 480 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  24.4 
 
 		 480 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  24.4 
 
 		 480 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  26.45 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  24.4 
 
 		 480 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  23.73 
 
 		 376 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  23.42 
 
 		 425 aa  43.5  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>