94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6664 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6664  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 518 aa  1001    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00617853  normal  0.854513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4171  NADPH-dependent glutamate synthase beta chain  40.73 
 
 		 490 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01754  putative signal peptide protein  34.32 
 
 		 497 aa  203  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.95051  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2498  FAD dependent oxidoreductase  34.08 
 
 		 500 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  hitchhiker  0.000580756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4116  FAD dependent oxidoreductase  32.6 
 
 		 476 aa  162  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3863  FAD dependent oxidoreductase  34.96 
 
 		 437 aa  156  7e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520485  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2773  FAD dependent oxidoreductase  30.32 
 
 		 447 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308714  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2787  FAD dependent oxidoreductase  29.92 
 
 		 447 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2743  FAD dependent oxidoreductase  29.92 
 
 		 447 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.211141  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0830  monooxygenase FAD-binding  26.74 
 
 		 453 aa  85.5  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1777  monooxygenase FAD-binding  27.23 
 
 		 471 aa  84.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4135  monooxygenase FAD-binding  30.45 
 
 		 460 aa  79.7  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5692  hypothetical protein  27.93 
 
 		 508 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.085115  normal  0.0485746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2099  monooxygenase FAD-binding  29.6 
 
 		 463 aa  77.8  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1135  FAD dependent oxidoreductase  29.04 
 
 		 447 aa  75.5  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1239  monooxygenase FAD-binding protein  35.59 
 
 		 484 aa  74.7  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1187  monooxygenase FAD-binding protein  29.81 
 
 		 463 aa  74.3  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2710  monooxygenase, FAD-binding  28.28 
 
 		 459 aa  73.6  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4358  monooxygenase FAD-binding  31.44 
 
 		 447 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00255024  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3995  hypothetical protein  30.56 
 
 		 460 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3479  monooxygenase FAD-binding  26.39 
 
 		 446 aa  72.4  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3971  putative phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  30.47 
 
 		 468 aa  72.8  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163754  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0829  monooxygenase FAD-binding  24.93 
 
 		 457 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6971  hypothetical protein  27.62 
 
 		 468 aa  70.1  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6384  monooxygenase FAD-binding  27.72 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00239538 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4723  hypothetical protein  27.09 
 
 		 449 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.486773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0842  hypothetical protein  27.42 
 
 		 443 aa  67.8  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1825  hypothetical protein  25.33 
 
 		 469 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1923  FAD dependent oxidoreductase  25.1 
 
 		 531 aa  64.7  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.674457 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4064  FAD dependent oxidoreductase  32.87 
 
 		 469 aa  64.3  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.218745  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4009  monooxygenase FAD-binding  27.81 
 
 		 477 aa  63.5  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1632  hypothetical protein  29.15 
 
 		 447 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1719  hypothetical protein  29.15 
 
 		 447 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129966  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4243  hypothetical protein  27.37 
 
 		 449 aa  63.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.159627  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4003  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.12 
 
 		 844 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.454074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2622  monooxygenase FAD-binding protein  31.02 
 
 		 447 aa  63.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11966  oxygenase  26.39 
 
 		 839 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.595898 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1367  hypothetical protein  30.15 
 
 		 462 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0650  monooxygenase FAD-binding  28.35 
 
 		 487 aa  62.4  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0217  hypothetical protein  29.15 
 
 		 476 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4956  monooxygenase, FAD-binding  28.26 
 
 		 443 aa  61.6  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5094  hypothetical protein  32.29 
 
 		 460 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0849389  normal  0.895154 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18660  FAD binding protein  27.44 
 
 		 468 aa  60.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.49198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1348  hypothetical protein  28.15 
 
 		 462 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.885775 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1331  hypothetical protein  28.15 
 
 		 462 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0513  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 		 472 aa  59.3  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0165805  decreased coverage  0.000000367703 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1500  monooxygenase FAD-binding  28.57 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4178  monooxygenase, FAD-binding  27.58 
 
 		 558 aa  58.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13283  hypothetical protein  30.32 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.246672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0591  hypothetical protein  31.86 
 
 		 460 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0613  hypothetical protein  31.86 
 
 		 460 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0600  hypothetical protein  31.86 
 
 		 460 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0494768  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5929  hypothetical protein  28.27 
 
 		 458 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1042  hypothetical protein  30.7 
 
 		 482 aa  55.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142247  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4305  monooxygenase FAD-binding  28.81 
 
 		 460 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3651  monooxygenase FAD-binding  29.82 
 
 		 477 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0463097 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0286  FAD dependent oxidoreductase  33.04 
 
 		 445 aa  53.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2091  monooxygenase, FAD-binding  28.25 
 
 		 436 aa  52.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4604  monooxygenase FAD-binding  26.6 
 
 		 509 aa  52.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.366392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  29.04 
 
 		 405 aa  52  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1000  hypothetical protein  28.26 
 
 		 460 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  26.35 
 
 		 378 aa  51.2  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1018  hypothetical protein  26.24 
 
 		 468 aa  50.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2441  hypothetical protein  22.5 
 
 		 440 aa  50.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109464  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1470  FAD dependent oxidoreductase  31.36 
 
 		 446 aa  50.1  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.662537  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2517  hypothetical protein  22.25 
 
 		 440 aa  49.3  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7423  monooxygenase, FAD-binding  24.43 
 
 		 490 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2702  hypothetical protein  22.25 
 
 		 440 aa  49.3  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1538  monooxygenase FAD-binding  30.3 
 
 		 471 aa  48.5  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00900279  normal  0.975685 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3170  hypothetical protein  27.1 
 
 		 406 aa  48.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2716  hypothetical protein  21.98 
 
 		 440 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000407728 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15935  predicted protein  34.64 
 
 		 463 aa  47.4  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2443  hypothetical protein  22.79 
 
 		 440 aa  47  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3016  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 		 546 aa  47  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.581254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0304  hypothetical protein  26.8 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.605002  normal  0.180027 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2587  hypothetical protein  21.98 
 
 		 440 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.064334 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1232  monooxygenase FAD-binding protein  27.58 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  28.03 
 
 		 511 aa  45.8  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0456  hypothetical protein  29.48 
 
 		 400 aa  45.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0907  Thioredoxin-disulfide reductase  63.64 
 
 		 547 aa  44.7  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000675051  normal  0.496773 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  31.28 
 
 		 412 aa  44.7  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1406  thioredoxin reductase  60.61 
 
 		 638 aa  44.7  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2768  hypothetical protein  22.25 
 
 		 440 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  46.3 
 
 		 367 aa  44.3  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1725  monooxygenase, FAD-binding  33.48 
 
 		 442 aa  44.3  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.847315  normal  0.600174 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  28.65 
 
 		 364 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3185  monooxygenase FAD-binding  30.6 
 
 		 442 aa  43.9  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304651  hitchhiker  0.000303065 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1635  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 539 aa  43.9  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000302713  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11769  hypothetical protein  27.44 
 
 		 460 aa  43.5  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196079  hitchhiker  0.00000209473 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  24.5 
 
 		 370 aa  43.5  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1366  hypothetical protein  25.63 
 
 		 418 aa  43.5  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.496364 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4405  FAD dependent oxidoreductase  28.71 
 
 		 532 aa  43.5  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.556143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  49.02 
 
 		 938 aa  43.5  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2674  FAD dependent oxidoreductase  67.74 
 
 		 443 aa  43.5  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.680206  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>