More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3104 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3104  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 
373 aa  760    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2603  monooxygenase FAD-binding  44.02 
 
 
377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.425135  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2102  monooxygenase FAD-binding  37.9 
 
 
340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5951  monooxygenase FAD-binding protein  41.92 
 
 
337 aa  179  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11161  oxidoreductase  42.35 
 
 
338 aa  178  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.264314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5142  monooxygenase, FAD-binding  39.14 
 
 
348 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1194  FAD dependent oxidoreductase  36.52 
 
 
340 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232264  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1088  monooxygenase, FAD-binding  34.4 
 
 
338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129242  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1061  monooxygenase, FAD-binding protein  34.11 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1077  monooxygenase, FAD-binding  34.11 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0754157 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5117  monooxygenase FAD-binding  40.26 
 
 
343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4182  monooxygenase FAD-binding  37.02 
 
 
362 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.787993  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00520  flavin-dependent dehydrogenase  35.28 
 
 
363 aa  156  5.0000000000000005e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.845908  normal  0.877711 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1158  FAD dependent oxidoreductase  39.58 
 
 
342 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.327107  hitchhiker  0.00150467 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0418  monooxygenase FAD-binding  32.34 
 
 
364 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0390  FAD-binding monooxygenase  31.72 
 
 
368 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0419  monooxygenase FAD-binding  30.47 
 
 
363 aa  96.7  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  27.27 
 
 
398 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  26.25 
 
 
376 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  27.96 
 
 
409 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  27.38 
 
 
418 aa  77  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  28 
 
 
375 aa  75.1  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  30.77 
 
 
388 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  24.06 
 
 
455 aa  73.9  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  28.3 
 
 
380 aa  73.6  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  25.78 
 
 
398 aa  73.2  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  27.78 
 
 
380 aa  72.4  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  24.55 
 
 
375 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  27.15 
 
 
362 aa  72  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  30.81 
 
 
393 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  27.38 
 
 
380 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  28.35 
 
 
380 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  25.51 
 
 
411 aa  70.9  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  30.81 
 
 
393 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  20.85 
 
 
444 aa  69.3  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  24.62 
 
 
435 aa  68.9  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0765  geranylgeranyl reductase  29.75 
 
 
406 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  22.98 
 
 
382 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10918  putative oxidoreductase  24.09 
 
 
374 aa  68.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.183929  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  30.18 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3394  hypothetical protein  26.41 
 
 
400 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10571  oxidoreductase  27.21 
 
 
408 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.649109  normal  0.274108 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3325  hypothetical protein  25.62 
 
 
400 aa  67.8  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.160312  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3227  hypothetical protein  26.41 
 
 
400 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.470901  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  22.78 
 
 
387 aa  67.8  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  24.92 
 
 
445 aa  67.8  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3214  hypothetical protein  26.41 
 
 
400 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00565491  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3292  hypothetical protein  26.41 
 
 
400 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.61616  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  23.76 
 
 
423 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3289  hypothetical protein  26.41 
 
 
400 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.672486  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1150  monooxygenase FAD-binding protein  25.52 
 
 
397 aa  66.6  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862466  normal  0.995827 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  25.31 
 
 
409 aa  66.6  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  25.23 
 
 
444 aa  66.2  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0784  geranylgeranyl reductase  29.45 
 
 
406 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  23.93 
 
 
425 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  25.42 
 
 
379 aa  66.2  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  28.09 
 
 
380 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  29.6 
 
 
358 aa  64.7  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0520333 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  29.57 
 
 
431 aa  65.5  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  24.17 
 
 
430 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  26.01 
 
 
422 aa  65.1  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  23.8 
 
 
424 aa  64.7  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0485  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  28.64 
 
 
387 aa  64.3  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000031061  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  27.57 
 
 
379 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1739  geranylgeranyl reductase  29.59 
 
 
358 aa  62.8  0.000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539865  normal  0.0147858 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3917  hypothetical protein  26.77 
 
 
400 aa  62.8  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0852662  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3796  oxidoreductase  20.72 
 
 
377 aa  62.8  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.204918 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5651  monooxygenase FAD-binding  26.75 
 
 
547 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  37.3 
 
 
423 aa  62  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  26.42 
 
 
367 aa  62.4  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0904  putative monooxygenase  28.53 
 
 
401 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1512  FAD dependent oxidoreductase  23.86 
 
 
365 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.193117  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  26.33 
 
 
384 aa  61.6  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0991  geranylgeranyl reductase  26.07 
 
 
418 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0770  geranylgeranyl reductase  26.94 
 
 
400 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  24.02 
 
 
420 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  25.73 
 
 
379 aa  61.2  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  35.19 
 
 
423 aa  61.2  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1242  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  26.89 
 
 
401 aa  60.8  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.974106  normal  0.764271 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5431  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  23.85 
 
 
407 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.0291121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 
426 aa  60.1  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  26.6 
 
 
434 aa  60.1  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  20.19 
 
 
439 aa  60.1  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  24.75 
 
 
389 aa  60.1  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  24.01 
 
 
434 aa  60.1  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  20.19 
 
 
439 aa  60.1  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  26.33 
 
 
413 aa  59.7  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  34.48 
 
 
457 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0291  FAD dependent oxidoreductase  26.86 
 
 
361 aa  59.3  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  36.03 
 
 
424 aa  58.9  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0733  hypothetical protein  27.4 
 
 
369 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  21.95 
 
 
377 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0323  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.54 
 
 
409 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.97579 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0825  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  28.31 
 
 
391 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00167325  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  24.83 
 
 
385 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  23.68 
 
 
416 aa  58.9  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1002  hypothetical protein  24.63 
 
 
369 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.132346  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  28.64 
 
 
443 aa  57.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  32.59 
 
 
416 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01232  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  22.89 
 
 
391 aa  57.8  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>