More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5951 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5951  monooxygenase FAD-binding protein  100 
 
 
337 aa  634    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2102  monooxygenase FAD-binding  62.99 
 
 
340 aa  354  1e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1194  FAD dependent oxidoreductase  56.76 
 
 
340 aa  333  3e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232264  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1061  monooxygenase, FAD-binding protein  56.68 
 
 
338 aa  328  7e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1077  monooxygenase, FAD-binding  56.68 
 
 
338 aa  328  7e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0754157 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1088  monooxygenase, FAD-binding  57.57 
 
 
338 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129242  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11161  oxidoreductase  55.11 
 
 
338 aa  310  2e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.264314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5142  monooxygenase, FAD-binding  56.53 
 
 
348 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5117  monooxygenase FAD-binding  56.76 
 
 
343 aa  276  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1158  FAD dependent oxidoreductase  52.89 
 
 
342 aa  265  8.999999999999999e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.327107  hitchhiker  0.00150467 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00520  flavin-dependent dehydrogenase  48 
 
 
363 aa  235  7e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.845908  normal  0.877711 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4182  monooxygenase FAD-binding  48.86 
 
 
362 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.787993  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3104  monooxygenase, FAD-binding  38.2 
 
 
373 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2603  monooxygenase FAD-binding  40.38 
 
 
377 aa  186  5e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.425135  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0418  monooxygenase FAD-binding  46.13 
 
 
364 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0390  FAD-binding monooxygenase  46.06 
 
 
368 aa  169  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0419  monooxygenase FAD-binding  44.91 
 
 
363 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  31.5 
 
 
418 aa  98.6  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  29.43 
 
 
423 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  32.48 
 
 
445 aa  91.3  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  27.56 
 
 
425 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  33.23 
 
 
425 aa  90.1  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  27.94 
 
 
435 aa  89.4  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  26.26 
 
 
375 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  31.66 
 
 
434 aa  86.7  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  25.21 
 
 
398 aa  85.9  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  32.68 
 
 
419 aa  85.1  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  30.12 
 
 
443 aa  84.3  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10918  putative oxidoreductase  23.65 
 
 
374 aa  84  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.183929  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  30.09 
 
 
431 aa  82.8  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  27.33 
 
 
382 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  28.36 
 
 
424 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  26.37 
 
 
434 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  31.35 
 
 
423 aa  80.1  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  28.39 
 
 
457 aa  79.3  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  33.22 
 
 
375 aa  79  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  28.19 
 
 
389 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  31.01 
 
 
423 aa  77.4  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  23.4 
 
 
398 aa  77.4  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1644  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
378 aa  76.3  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00782092 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  29.85 
 
 
430 aa  75.9  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3796  oxidoreductase  24.31 
 
 
377 aa  75.9  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.204918 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  28.93 
 
 
430 aa  75.5  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  26.54 
 
 
384 aa  74.7  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  27.16 
 
 
426 aa  73.9  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  29.14 
 
 
411 aa  73.6  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  27.22 
 
 
380 aa  72.8  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  27.41 
 
 
431 aa  72  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  26.35 
 
 
380 aa  70.9  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  33.89 
 
 
413 aa  70.5  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  26.9 
 
 
380 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  31.07 
 
 
378 aa  69.7  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  30.03 
 
 
440 aa  69.7  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  26.75 
 
 
379 aa  69.7  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  26.98 
 
 
380 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  25.48 
 
 
379 aa  68.2  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  29.87 
 
 
424 aa  67.8  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  26.85 
 
 
376 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  21.6 
 
 
375 aa  67  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  23.77 
 
 
390 aa  66.6  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  29.66 
 
 
384 aa  66.6  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  27.74 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5035  FAD dependent oxidoreductase  25.17 
 
 
374 aa  66.6  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1161  geranylgeranyl reductase  33.45 
 
 
429 aa  66.6  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2035  FAD dependent oxidoreductase  25.39 
 
 
379 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  23.75 
 
 
390 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  26.67 
 
 
398 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  24.01 
 
 
402 aa  65.9  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  28.89 
 
 
494 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  27.3 
 
 
393 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  26.34 
 
 
393 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  25.59 
 
 
390 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0162  geranylgeranyl reductase  34.64 
 
 
392 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.555099  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  21.93 
 
 
391 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  28.77 
 
 
506 aa  63.5  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  34.63 
 
 
403 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 
443 aa  63.2  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  29.18 
 
 
379 aa  63.2  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  29.08 
 
 
489 aa  62.8  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  27.73 
 
 
449 aa  62.8  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  22.46 
 
 
444 aa  61.6  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  31.6 
 
 
475 aa  61.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  23.1 
 
 
390 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  33.11 
 
 
382 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  28.21 
 
 
431 aa  61.6  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  28.93 
 
 
444 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  26.32 
 
 
385 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  27.42 
 
 
455 aa  60.5  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2578  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  25.3 
 
 
381 aa  60.5  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  29.19 
 
 
368 aa  60.1  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  27.3 
 
 
362 aa  60.1  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  27.13 
 
 
439 aa  59.7  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  27.13 
 
 
439 aa  59.7  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  30.38 
 
 
409 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2391  geranylgeranyl reductase  33.56 
 
 
375 aa  58.9  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  27.88 
 
 
452 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0164  putative electron transfer oxidoreductase  30.92 
 
 
420 aa  57.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.762503  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  26.58 
 
 
444 aa  57.4  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2166  oxygenase  33.5 
 
 
522 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229966  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  26.76 
 
 
503 aa  56.6  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>