More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5142 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_5142  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 
348 aa  681    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1194  FAD dependent oxidoreductase  81.71 
 
 
340 aa  508  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232264  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1088  monooxygenase, FAD-binding  64.44 
 
 
338 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129242  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1061  monooxygenase, FAD-binding protein  62.61 
 
 
338 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1077  monooxygenase, FAD-binding  62.61 
 
 
338 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0754157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2102  monooxygenase FAD-binding  57.1 
 
 
340 aa  313  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5951  monooxygenase FAD-binding protein  56.53 
 
 
337 aa  288  6e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5117  monooxygenase FAD-binding  56.63 
 
 
343 aa  255  6e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11161  oxidoreductase  49.05 
 
 
338 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.264314 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1158  FAD dependent oxidoreductase  49.69 
 
 
342 aa  245  8e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.327107  hitchhiker  0.00150467 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00520  flavin-dependent dehydrogenase  42.98 
 
 
363 aa  206  6e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.845908  normal  0.877711 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4182  monooxygenase FAD-binding  42.98 
 
 
362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.787993  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3104  monooxygenase, FAD-binding  38.23 
 
 
373 aa  169  9e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0390  FAD-binding monooxygenase  44.15 
 
 
368 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0418  monooxygenase FAD-binding  41.21 
 
 
364 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2603  monooxygenase FAD-binding  38.89 
 
 
377 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.425135  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0419  monooxygenase FAD-binding  41.21 
 
 
363 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  29.67 
 
 
431 aa  85.1  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 
420 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  25.51 
 
 
425 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  28.83 
 
 
424 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 
418 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  24.92 
 
 
376 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5035  FAD dependent oxidoreductase  25.31 
 
 
374 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  26.33 
 
 
375 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 
419 aa  74.3  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  26.2 
 
 
431 aa  74.3  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  26.63 
 
 
434 aa  73.6  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  29.73 
 
 
375 aa  73.2  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  26.93 
 
 
423 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  26.55 
 
 
390 aa  69.7  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  23.53 
 
 
398 aa  69.3  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  27.89 
 
 
398 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  26.5 
 
 
380 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  25.79 
 
 
379 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  24.23 
 
 
398 aa  68.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  25.93 
 
 
435 aa  68.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3796  oxidoreductase  24.02 
 
 
377 aa  68.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.204918 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  25.38 
 
 
390 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  26.18 
 
 
380 aa  67.4  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  31.01 
 
 
382 aa  67.4  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  24.85 
 
 
382 aa  66.6  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  27.71 
 
 
445 aa  64.7  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  24.48 
 
 
390 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  26.25 
 
 
380 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  24.78 
 
 
390 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  27.95 
 
 
378 aa  64.3  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  25.16 
 
 
426 aa  64.3  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  26.22 
 
 
443 aa  63.9  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2035  FAD dependent oxidoreductase  25.64 
 
 
379 aa  63.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  26.17 
 
 
384 aa  63.2  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  26.36 
 
 
389 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  26.89 
 
 
393 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  26.88 
 
 
434 aa  62.8  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  30.13 
 
 
479 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0114  FAD dependent oxidoreductase  28.28 
 
 
399 aa  61.6  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00154267  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  34.4 
 
 
423 aa  61.6  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1108  Ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family  25.28 
 
 
430 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34769  hitchhiker  0.00000000136293 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  30.51 
 
 
413 aa  61.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  20.49 
 
 
375 aa  60.8  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3301  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  25.56 
 
 
435 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000230546  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  27.74 
 
 
358 aa  60.5  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0520333 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  25.56 
 
 
393 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  28.93 
 
 
475 aa  60.1  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  24.01 
 
 
362 aa  60.1  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  26.81 
 
 
430 aa  60.1  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3259  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  25.42 
 
 
430 aa  59.7  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0253347  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  28.17 
 
 
367 aa  59.7  0.00000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  26.73 
 
 
425 aa  59.7  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  28.1 
 
 
430 aa  59.3  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  22.92 
 
 
391 aa  59.3  0.00000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  28.53 
 
 
403 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  24.58 
 
 
385 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  27.54 
 
 
506 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3304  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  25.38 
 
 
406 aa  58.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0850508  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3437  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  25.28 
 
 
420 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000727987 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  25.08 
 
 
379 aa  58.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  47.37 
 
 
423 aa  58.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  26.7 
 
 
461 aa  58.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1429  hypothetical protein  27.83 
 
 
395 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0716636 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  25.55 
 
 
380 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  24.84 
 
 
406 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  47.37 
 
 
423 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2391  geranylgeranyl reductase  31.73 
 
 
375 aa  57.4  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2578  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  25 
 
 
381 aa  57.4  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4211  monooxygenase FAD-binding  27.74 
 
 
429 aa  57.4  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747744  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  23.98 
 
 
449 aa  57  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1161  geranylgeranyl reductase  30.61 
 
 
429 aa  57.4  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  25.95 
 
 
374 aa  57  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  24.76 
 
 
418 aa  56.6  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  27.99 
 
 
489 aa  56.6  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  29.91 
 
 
477 aa  56.6  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  29.14 
 
 
403 aa  56.2  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  28.34 
 
 
409 aa  56.2  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  40.91 
 
 
443 aa  56.2  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  26.51 
 
 
431 aa  55.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  25.47 
 
 
378 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  25.82 
 
 
419 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  26.3 
 
 
408 aa  55.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4393  monooxygenase FAD-binding  28.96 
 
 
377 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>