More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2603 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2603  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 377 aa  752    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.425135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3104  monooxygenase, FAD-binding  43.2 
 
 		 373 aa  285  9e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11161  oxidoreductase  40.37 
 
 		 338 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.264314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5951  monooxygenase FAD-binding protein  43.54 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2102  monooxygenase FAD-binding  41.01 
 
 		 340 aa  183  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4182  monooxygenase FAD-binding  39.24 
 
 		 362 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.787993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5117  monooxygenase FAD-binding  43.52 
 
 		 343 aa  173  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1061  monooxygenase, FAD-binding protein  40.53 
 
 		 338 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1077  monooxygenase, FAD-binding  40.53 
 
 		 338 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0754157 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1088  monooxygenase, FAD-binding  40.53 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1194  FAD dependent oxidoreductase  38.01 
 
 		 340 aa  160  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0390  FAD-binding monooxygenase  37.88 
 
 		 368 aa  159  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5142  monooxygenase, FAD-binding  40 
 
 		 348 aa  159  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0418  monooxygenase FAD-binding  38.46 
 
 		 364 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00520  flavin-dependent dehydrogenase  34.27 
 
 		 363 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.845908  normal  0.877711 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1158  FAD dependent oxidoreductase  39.59 
 
 		 342 aa  144  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.327107  hitchhiker  0.00150467 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0419  monooxygenase FAD-binding  37.87 
 
 		 363 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4487  monooxygenase FAD-binding  28.29 
 
 		 385 aa  80.1  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  24.68 
 
 		 376 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  26.61 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  27.92 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  23.7 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  26.23 
 
 		 418 aa  73.6  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  29.14 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  27.33 
 
 		 389 aa  72.8  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  27.78 
 
 		 398 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  22.67 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  30.53 
 
 		 511 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  23.9 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5651  monooxygenase FAD-binding  27.32 
 
 		 547 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1109  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  27.6 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.666485  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  24.26 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  26.67 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  21.33 
 
 		 375 aa  70.1  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1644  FAD dependent oxidoreductase  23.59 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00782092 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3301  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  23.67 
 
 		 435 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000230546  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0714  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  23.82 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  27.36 
 
 		 384 aa  67  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3259  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  23.1 
 
 		 430 aa  67  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0253347  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  26.62 
 
 		 398 aa  67  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1150  monooxygenase FAD-binding protein  26.29 
 
 		 397 aa  66.2  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862466  normal  0.995827 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  29.11 
 
 		 382 aa  66.2  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1108  Ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family  23.26 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34769  hitchhiker  0.00000000136293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  29.59 
 
 		 481 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  26.07 
 
 		 377 aa  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  23.97 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3437  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  23.26 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727987 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  29.13 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  28.24 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3796  oxidoreductase  21.63 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.204918 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3438  monooxygenase, FAD-binding  27.51 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  24.39 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  34.4 
 
 		 431 aa  63.2  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2035  FAD dependent oxidoreductase  24.1 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  25.61 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0770  geranylgeranyl reductase  26.17 
 
 		 400 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  26.9 
 
 		 537 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  26.9 
 
 		 537 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  25.5 
 
 		 375 aa  62.8  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  26.9 
 
 		 537 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4393  monooxygenase FAD-binding  27.95 
 
 		 377 aa  62.4  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  24.47 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  25.07 
 
 		 384 aa  61.6  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0991  geranylgeranyl reductase  25.78 
 
 		 418 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  23.77 
 
 		 444 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  27.6 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  26.65 
 
 		 461 aa  60.8  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  32.48 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  22.47 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5254  geranylgeranyl reductase  29.25 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  26.86 
 
 		 455 aa  60.5  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  27.95 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0784  geranylgeranyl reductase  28.04 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  32.1 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  31.25 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  22.67 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0765  geranylgeranyl reductase  28.04 
 
 		 406 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  22.68 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2578  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  22.99 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  26.1 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  27.16 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  22.71 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0376  hypothetical protein  27.64 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1820  Ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family  26.88 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00177812  hitchhiker  0.00000000175067 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  23.66 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02229  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.4 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2854  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  24.01 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000692604  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  25.54 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0520333 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10918  putative oxidoreductase  21.85 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.183929  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  25.3 
 
 		 380 aa  57  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1739  geranylgeranyl reductase  48.21 
 
 		 358 aa  57  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539865  normal  0.0147858 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0948  geranylgeranyl reductase  26.35 
 
 		 417 aa  57  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.3862  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  24.92 
 
 		 399 aa  57  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  23.53 
 
 		 430 aa  57  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3505  ubiquinone biosynthesis hydroxylase family protein  26.17 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.682959  normal  0.0129679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5035  FAD dependent oxidoreductase  24.77 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.378834 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>