228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11161 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11161  oxidoreductase  100 
 
 		 338 aa  666    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.264314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2102  monooxygenase FAD-binding  51.79 
 
 		 340 aa  286  5e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5951  monooxygenase FAD-binding protein  55.82 
 
 		 337 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1061  monooxygenase, FAD-binding protein  52.24 
 
 		 338 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1077  monooxygenase, FAD-binding  52.24 
 
 		 338 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0754157 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1194  FAD dependent oxidoreductase  50.59 
 
 		 340 aa  280  3e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1088  monooxygenase, FAD-binding  51.64 
 
 		 338 aa  272  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129242  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1158  FAD dependent oxidoreductase  53.33 
 
 		 342 aa  262  6.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.327107  hitchhiker  0.00150467 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5117  monooxygenase FAD-binding  50.59 
 
 		 343 aa  244  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5142  monooxygenase, FAD-binding  50 
 
 		 348 aa  236  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00520  flavin-dependent dehydrogenase  46.57 
 
 		 363 aa  221  9.999999999999999e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.845908  normal  0.877711 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2603  monooxygenase FAD-binding  41.37 
 
 		 377 aa  191  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.425135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3104  monooxygenase, FAD-binding  42.55 
 
 		 373 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4182  monooxygenase FAD-binding  41.78 
 
 		 362 aa  176  7e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.787993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0418  monooxygenase FAD-binding  40.24 
 
 		 364 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0390  FAD-binding monooxygenase  39.02 
 
 		 368 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0419  monooxygenase FAD-binding  38.74 
 
 		 363 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  28.83 
 
 		 434 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  24.7 
 
 		 375 aa  77.8  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  27.54 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  28.27 
 
 		 424 aa  72.4  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  26.67 
 
 		 375 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  27.36 
 
 		 398 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  28.88 
 
 		 434 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  28.78 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  27.07 
 
 		 430 aa  69.7  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  27.38 
 
 		 423 aa  69.3  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  25.66 
 
 		 425 aa  69.3  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  32.38 
 
 		 409 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  27.19 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.09 
 
 		 449 aa  66.6  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  25.57 
 
 		 398 aa  65.9  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  28.32 
 
 		 445 aa  65.5  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  29.64 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  25.56 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2035  FAD dependent oxidoreductase  23.2 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  27.19 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  25.38 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0327  geranylgeranyl reductase  30.82 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.252383  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  24.28 
 
 		 431 aa  62.8  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  26.21 
 
 		 435 aa  62.4  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1644  FAD dependent oxidoreductase  23.33 
 
 		 378 aa  62.4  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00782092 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  25.08 
 
 		 362 aa  62.8  0.000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  27.96 
 
 		 423 aa  62.8  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  26.36 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  25.96 
 
 		 358 aa  62.4  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0520333 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  27.17 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5035  FAD dependent oxidoreductase  24.53 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  28.48 
 
 		 506 aa  60.1  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  22.65 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  29.1 
 
 		 382 aa  59.7  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  27.21 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  28.39 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3796  oxidoreductase  22.91 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.204918 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.22 
 
 		 568 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  29.33 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1405  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  24.24 
 
 		 432 aa  58.5  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.431587  normal  0.559254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.22 
 
 		 573 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.22 
 
 		 573 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1739  geranylgeranyl reductase  28.62 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539865  normal  0.0147858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0660  geranylgeranyl reductase  26.64 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  27.86 
 
 		 419 aa  57  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  50 
 
 		 420 aa  57  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2578  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  24.85 
 
 		 381 aa  57  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  26.06 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  21.88 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  27.16 
 
 		 379 aa  55.8  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  25.73 
 
 		 378 aa  55.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  20.98 
 
 		 390 aa  55.8  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  26.24 
 
 		 424 aa  55.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  26.95 
 
 		 440 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  25.3 
 
 		 457 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 402 aa  55.1  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  27.95 
 
 		 503 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  25.25 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0080  hypothetical protein  24.43 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2454  regulatory proteins, IclR  27.64 
 
 		 575 aa  54.3  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.283629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  30.29 
 
 		 537 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  29.45 
 
 		 423 aa  54.3  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  30.29 
 
 		 537 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  30.29 
 
 		 537 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  25.96 
 
 		 473 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  25.96 
 
 		 473 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  25.96 
 
 		 473 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  27.44 
 
 		 413 aa  53.1  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  25.22 
 
 		 379 aa  53.1  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  25.93 
 
 		 384 aa  53.1  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  33.53 
 
 		 506 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  24.92 
 
 		 409 aa  52.8  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  26.67 
 
 		 409 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  31.4 
 
 		 481 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  34.15 
 
 		 507 aa  52  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  25.69 
 
 		 411 aa  52.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2391  geranylgeranyl reductase  29.41 
 
 		 375 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  26.98 
 
 		 425 aa  52.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  27.47 
 
 		 529 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3793  monooxygenase, FAD-binding  25.81 
 
 		 524 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.791839  normal  0.0125936 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  25.21 
 
 		 415 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  22.95 
 
 		 390 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>