More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5651 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5651  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 
547 aa  1069    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  35.37 
 
 
506 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  36.02 
 
 
461 aa  208  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  29.01 
 
 
544 aa  197  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  34.12 
 
 
500 aa  189  8e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  35.56 
 
 
511 aa  189  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  39.52 
 
 
493 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1511  monooxygenase FAD-binding  36.2 
 
 
576 aa  181  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0685394  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  39.22 
 
 
486 aa  179  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  32.37 
 
 
548 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  32.37 
 
 
548 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  32.01 
 
 
548 aa  178  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  33.84 
 
 
518 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  32.6 
 
 
546 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  35.73 
 
 
489 aa  173  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  32.82 
 
 
549 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  30.04 
 
 
502 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  36.83 
 
 
486 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  32.64 
 
 
574 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  33.59 
 
 
388 aa  171  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  34.08 
 
 
535 aa  169  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  31.48 
 
 
511 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  32.18 
 
 
574 aa  169  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  29.83 
 
 
502 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  32.9 
 
 
481 aa  167  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  31.5 
 
 
550 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  29.83 
 
 
502 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  37.01 
 
 
414 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  32.62 
 
 
477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  34.5 
 
 
489 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  33.12 
 
 
550 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  35.36 
 
 
529 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  29.28 
 
 
502 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  33.72 
 
 
501 aa  163  8.000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  37.76 
 
 
475 aa  162  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  31.59 
 
 
566 aa  162  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3485  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductases-like  30.99 
 
 
557 aa  161  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.108496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  31.88 
 
 
546 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  36.73 
 
 
473 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4320  monooxygenase FAD-binding  31.71 
 
 
522 aa  160  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  36.73 
 
 
473 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  36.73 
 
 
473 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  34.15 
 
 
494 aa  158  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  32.41 
 
 
547 aa  156  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  33.88 
 
 
553 aa  156  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  31.74 
 
 
548 aa  155  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  31.94 
 
 
511 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  35.99 
 
 
479 aa  154  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  31.4 
 
 
531 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  36.71 
 
 
488 aa  153  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  35.48 
 
 
485 aa  152  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  36.7 
 
 
477 aa  151  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  31.57 
 
 
571 aa  151  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  30.84 
 
 
506 aa  150  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3372  monooxygenase FAD-binding protein  34.76 
 
 
553 aa  150  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  34.51 
 
 
489 aa  150  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  32.46 
 
 
548 aa  150  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  32.46 
 
 
548 aa  150  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  37.83 
 
 
477 aa  150  7e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  30.72 
 
 
480 aa  150  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  32.46 
 
 
611 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  31.72 
 
 
474 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  31.98 
 
 
548 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  31.98 
 
 
548 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1656  hypothetical protein  31.83 
 
 
508 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.652016  normal  0.325297 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0452  pentachlorophenol 4-monooxygenase, putative  31.75 
 
 
538 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0178  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  31.75 
 
 
538 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5297  monooxygenase, FAD-binding protein  35.73 
 
 
515 aa  147  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.85745  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5676  monooxygenase, FAD-binding  35.73 
 
 
515 aa  147  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5386  monooxygenase, FAD-binding  35.73 
 
 
515 aa  147  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.416517 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  31.54 
 
 
968 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  32.51 
 
 
498 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  35.26 
 
 
515 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2975  monooxygenase FAD-binding protein  33.7 
 
 
506 aa  144  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0868842  hitchhiker  0.000653809 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9228  hypothetical protein  29.98 
 
 
504 aa  143  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  35.99 
 
 
486 aa  143  8e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  35.66 
 
 
475 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4514  monooxygenase FAD-binding  37.57 
 
 
508 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  34.17 
 
 
552 aa  141  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  33.2 
 
 
493 aa  140  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  33.71 
 
 
503 aa  140  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2585  monooxygenase FAD-binding protein  35.36 
 
 
479 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  31.05 
 
 
497 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2196  monooxygenase, FAD-binding  30.75 
 
 
503 aa  137  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  29.51 
 
 
540 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3345  monooxygenase FAD-binding  34.19 
 
 
505 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  31.54 
 
 
486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1223  putative rifampin monooxygenase  36.18 
 
 
471 aa  134  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247853  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04210  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  33.33 
 
 
510 aa  135  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  34.87 
 
 
478 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1342  monooxygenase FAD-binding protein  31.7 
 
 
496 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  32.1 
 
 
537 aa  134  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2111  monooxygenase, FAD-binding  32.94 
 
 
511 aa  134  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.0054618  normal  0.499354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  32.1 
 
 
537 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  32.1 
 
 
537 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  33.06 
 
 
497 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  34.04 
 
 
506 aa  131  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2199  monooxygenase, FAD-binding  31.03 
 
 
492 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  32.87 
 
 
499 aa  130  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  28.95 
 
 
505 aa  130  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>