162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1158 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1158  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
342 aa  641    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.327107  hitchhiker  0.00150467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2102  monooxygenase FAD-binding  54.41 
 
 
340 aa  286  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1194  FAD dependent oxidoreductase  49.85 
 
 
340 aa  276  5e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232264  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11161  oxidoreductase  53.33 
 
 
338 aa  263  3e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.264314 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5117  monooxygenase FAD-binding  54.05 
 
 
343 aa  251  9.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1088  monooxygenase, FAD-binding  49.85 
 
 
338 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129242  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1061  monooxygenase, FAD-binding protein  48.97 
 
 
338 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1077  monooxygenase, FAD-binding  48.97 
 
 
338 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0754157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5951  monooxygenase FAD-binding protein  53.22 
 
 
337 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00520  flavin-dependent dehydrogenase  48.31 
 
 
363 aa  233  5e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.845908  normal  0.877711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5142  monooxygenase, FAD-binding  50.3 
 
 
348 aa  229  4e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4182  monooxygenase FAD-binding  45.1 
 
 
362 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.787993  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3104  monooxygenase, FAD-binding  39.46 
 
 
373 aa  150  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0390  FAD-binding monooxygenase  46.13 
 
 
368 aa  142  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2603  monooxygenase FAD-binding  40.26 
 
 
377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.425135  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0418  monooxygenase FAD-binding  42.62 
 
 
364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0419  monooxygenase FAD-binding  42.23 
 
 
363 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  25.71 
 
 
384 aa  66.6  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  29.72 
 
 
506 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  30.06 
 
 
445 aa  63.5  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0339  monooxygenase, FAD-binding  31.87 
 
 
534 aa  61.2  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0305956  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  30.03 
 
 
418 aa  60.5  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2854  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  25 
 
 
413 aa  59.3  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000692604  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2333  monooxygenase FAD-binding  32.28 
 
 
536 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.307173 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3437  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  24.25 
 
 
420 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000727987 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2035  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 
379 aa  57.4  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3259  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  24.85 
 
 
430 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0253347  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0323  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  27.78 
 
 
409 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.97579 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  25.71 
 
 
379 aa  56.6  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3301  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  24.49 
 
 
435 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000230546  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1108  Ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family  23.84 
 
 
430 aa  56.6  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34769  hitchhiker  0.00000000136293 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  25.08 
 
 
382 aa  56.2  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  31.37 
 
 
409 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  27.55 
 
 
380 aa  55.1  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  27.59 
 
 
389 aa  55.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  27.24 
 
 
362 aa  53.1  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1541  monooxygenase FAD-binding  30.22 
 
 
497 aa  53.1  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1512  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
365 aa  52.8  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.193117  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  25.81 
 
 
380 aa  52.8  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5221  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  27.33 
 
 
409 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2196  monooxygenase, FAD-binding  31.46 
 
 
503 aa  52.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  27.4 
 
 
379 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5035  FAD dependent oxidoreductase  21.86 
 
 
374 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  32.76 
 
 
486 aa  51.2  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3793  monooxygenase, FAD-binding  27.93 
 
 
524 aa  50.8  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.791839  normal  0.0125936 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  21.19 
 
 
376 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1298  geranylgeranyl reductase  32.13 
 
 
369 aa  50.4  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  19.32 
 
 
375 aa  50.8  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  28.61 
 
 
434 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1071  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  25.15 
 
 
408 aa  50.1  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0719385  normal  0.0638655 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  24.44 
 
 
380 aa  50.4  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  25.23 
 
 
380 aa  50.4  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1010  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  23.96 
 
 
408 aa  50.1  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  normal  0.0569415 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  27.35 
 
 
424 aa  49.7  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0817  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  22.94 
 
 
411 aa  49.3  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0219172  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  26.52 
 
 
425 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  28.06 
 
 
409 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  25.55 
 
 
406 aa  49.3  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  50 
 
 
411 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  28.09 
 
 
361 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  32.35 
 
 
475 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  23.43 
 
 
398 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  32.26 
 
 
403 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3543  monooxygenase FAD-binding  30.81 
 
 
489 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  27.99 
 
 
385 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  33.14 
 
 
500 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.92 
 
 
446 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1644  FAD dependent oxidoreductase  29.91 
 
 
378 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00782092 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2188  monooxygenase, FAD-binding  30.36 
 
 
503 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.053184  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  28.62 
 
 
375 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  24.92 
 
 
398 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3304  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  25.23 
 
 
406 aa  48.5  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0850508  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  32.56 
 
 
479 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  26.4 
 
 
362 aa  48.5  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  29.45 
 
 
434 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  29.61 
 
 
435 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  27.76 
 
 
494 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  25.67 
 
 
409 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  21.89 
 
 
375 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1006  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  23.15 
 
 
408 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0152891  normal  0.26628 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  26.62 
 
 
407 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5964  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  26.13 
 
 
410 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  30.33 
 
 
413 aa  47.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47310  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  26.7 
 
 
405 aa  47.4  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.16 
 
 
446 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  27.41 
 
 
431 aa  47  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  32.94 
 
 
489 aa  47.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  39.06 
 
 
457 aa  47.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6603  monooxygenase FAD-binding protein  28.99 
 
 
400 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145948  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4320  monooxygenase FAD-binding  29.94 
 
 
522 aa  47.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0660  geranylgeranyl reductase  27.27 
 
 
406 aa  47  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  30 
 
 
537 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  30 
 
 
537 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.08 
 
 
446 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  30 
 
 
537 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  28.93 
 
 
382 aa  46.6  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.66 
 
 
445 aa  46.6  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  28.11 
 
 
358 aa  46.6  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0520333 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68955  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  25.98 
 
 
405 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  25.89 
 
 
418 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>