293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0948 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0948  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 417 aa  805    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.3862  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0714  geranylgeranyl reductase  69.16 
 
 		 415 aa  504  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1099  geranylgeranyl reductase  62.53 
 
 		 435 aa  462  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.997696  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5254  geranylgeranyl reductase  63.05 
 
 		 416 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0991  geranylgeranyl reductase  63.28 
 
 		 418 aa  457  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10571  oxidoreductase  60.84 
 
 		 408 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.649109  normal  0.274108 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0765  geranylgeranyl reductase  62.62 
 
 		 406 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0770  geranylgeranyl reductase  61.72 
 
 		 400 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0784  geranylgeranyl reductase  62.62 
 
 		 406 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0362  geranylgeranyl reductase  39.35 
 
 		 436 aa  228  1e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.495463  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  37.88 
 
 		 418 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  37.18 
 
 		 445 aa  205  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  35.57 
 
 		 431 aa  202  8e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  33.65 
 
 		 434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  43.64 
 
 		 431 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  37.53 
 
 		 424 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  36.38 
 
 		 434 aa  192  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  34.3 
 
 		 430 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  33.02 
 
 		 423 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  35.5 
 
 		 430 aa  191  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  33.8 
 
 		 426 aa  190  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  33.33 
 
 		 435 aa  189  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  35.06 
 
 		 443 aa  187  4e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  34.41 
 
 		 425 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  37.59 
 
 		 419 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  35.77 
 
 		 444 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  32.77 
 
 		 457 aa  178  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  34.81 
 
 		 443 aa  178  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  34.77 
 
 		 423 aa  177  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  34.15 
 
 		 423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  34.93 
 
 		 431 aa  172  9e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  35.56 
 
 		 440 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  32.3 
 
 		 424 aa  160  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17730  geranylgeranyl reductase family protein  34.03 
 
 		 466 aa  148  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  31.15 
 
 		 393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  32.08 
 
 		 393 aa  134  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  37.53 
 
 		 413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  30.79 
 
 		 393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  30.79 
 
 		 393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  30.79 
 
 		 393 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  36.31 
 
 		 420 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  26.97 
 
 		 376 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  32.41 
 
 		 398 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  28.15 
 
 		 415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  34.73 
 
 		 409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  30.18 
 
 		 398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  31.2 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  27.44 
 
 		 384 aa  100  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  34.08 
 
 		 425 aa  99.4  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  28.21 
 
 		 382 aa  99.4  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  30.12 
 
 		 385 aa  93.6  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  32.02 
 
 		 389 aa  91.3  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  33.23 
 
 		 409 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1161  geranylgeranyl reductase  36.48 
 
 		 429 aa  88.2  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0164  putative electron transfer oxidoreductase  34.94 
 
 		 420 aa  87  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.762503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  30.94 
 
 		 414 aa  86.7  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  33.64 
 
 		 378 aa  86.3  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  31.51 
 
 		 375 aa  85.9  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  28 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  30.43 
 
 		 403 aa  84.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  28.61 
 
 		 362 aa  83.2  0.000000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  28.81 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  28.92 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  32.05 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  22.99 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  25.62 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  28.36 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  27.04 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  24.7 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  23.88 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  25.19 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0660  geranylgeranyl reductase  34.57 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  30.15 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  26.82 
 
 		 368 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  28.07 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  29.14 
 
 		 358 aa  67  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0520333 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1739  geranylgeranyl reductase  29.28 
 
 		 358 aa  67  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539865  normal  0.0147858 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  22.13 
 
 		 415 aa  67  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2102  monooxygenase FAD-binding  29.64 
 
 		 340 aa  67  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  28.6 
 
 		 423 aa  66.6  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  29.6 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  29.6 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0114  FAD dependent oxidoreductase  25.34 
 
 		 399 aa  66.2  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00154267  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  28.48 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0327  geranylgeranyl reductase  33.44 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.252383  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2674  FAD dependent oxidoreductase  26.76 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.680206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3481  geranylgeranyl reductase  28.66 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  22.62 
 
 		 422 aa  63.2  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  25.08 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  29.97 
 
 		 384 aa  62.4  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18731  NAD binding site  31.61 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.413657 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  27.38 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0808  geranylgeranyl reductase  32.89 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.967973  hitchhiker  0.000310699 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  24.43 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1194  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 340 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  28.66 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 394 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  24.79 
 
 		 375 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  27.32 
 
 		 480 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  28.75 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>