207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10918 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_10918  putative oxidoreductase  100 
 
 		 374 aa  769    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.183929  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  48.4 
 
 		 375 aa  370  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  49.73 
 
 		 375 aa  365  1e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1644  FAD dependent oxidoreductase  49.46 
 
 		 378 aa  350  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00782092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5035  FAD dependent oxidoreductase  48.53 
 
 		 374 aa  349  5e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3796  oxidoreductase  36.93 
 
 		 377 aa  236  6e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.204918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2035  FAD dependent oxidoreductase  33.6 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3389  monooxygenase FAD-binding  25.07 
 
 		 392 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2674  FAD dependent oxidoreductase  23.1 
 
 		 443 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.680206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1512  FAD dependent oxidoreductase  24.38 
 
 		 365 aa  94  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.193117  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  24.52 
 
 		 398 aa  90.9  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  24.52 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  23.58 
 
 		 445 aa  83.2  0.000000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  23.12 
 
 		 425 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  22.45 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  22.28 
 
 		 434 aa  80.1  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  22.73 
 
 		 423 aa  79.7  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  24.47 
 
 		 384 aa  78.6  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5951  monooxygenase FAD-binding protein  24.59 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  21.94 
 
 		 435 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  30.63 
 
 		 368 aa  75.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  22.61 
 
 		 457 aa  74.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  23.08 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  22.02 
 
 		 418 aa  72.8  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  22.16 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  23.79 
 
 		 461 aa  72.8  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  21.63 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00520  flavin-dependent dehydrogenase  23.48 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.845908  normal  0.877711 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  23.37 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  24.42 
 
 		 376 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  22.96 
 
 		 444 aa  70.9  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  22.53 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  22.78 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  23.97 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  21.94 
 
 		 419 aa  69.7  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3104  monooxygenase, FAD-binding  23.93 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4182  monooxygenase FAD-binding  23.51 
 
 		 362 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.787993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1188  monooxygenase, FAD-binding  23.08 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3634  putative electron transfer oxidoreductase  23.62 
 
 		 340 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.822942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1194  FAD dependent oxidoreductase  23 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  24.4 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18731  NAD binding site  19.57 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.413657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  22.22 
 
 		 423 aa  66.2  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1061  monooxygenase, FAD-binding protein  21.57 
 
 		 338 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1077  monooxygenase, FAD-binding  21.57 
 
 		 338 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0754157 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  23.48 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1088  monooxygenase, FAD-binding  21.24 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  18.41 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  20.24 
 
 		 443 aa  63.5  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0765  geranylgeranyl reductase  22.74 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  23.16 
 
 		 370 aa  62.8  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4710  FAD dependent oxidoreductase  22.7 
 
 		 358 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  21.72 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  24.59 
 
 		 380 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  23.68 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  22.01 
 
 		 384 aa  61.6  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  23.33 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0390  FAD-binding monooxygenase  20.63 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0255  FAD dependent oxidoreductase  21.56 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.794372 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0770  geranylgeranyl reductase  22.43 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0784  geranylgeranyl reductase  22.43 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5117  monooxygenase FAD-binding  24.74 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  24.85 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  22.81 
 
 		 439 aa  60.1  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  22.81 
 
 		 439 aa  60.1  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  22.15 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0420  hypothetical protein  21.29 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.299605 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  23.3 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  22.44 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  19.16 
 
 		 431 aa  58.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  20.98 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2102  monooxygenase FAD-binding  20.72 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2299  geranylgeranyl reductase  22.61 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.650791  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  22.97 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  22.46 
 
 		 470 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5142  monooxygenase, FAD-binding  22.71 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  20.24 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  20.17 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  23.06 
 
 		 584 aa  57.4  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  21.84 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  35.35 
 
 		 392 aa  57  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  22.91 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  21 
 
 		 455 aa  55.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0660  geranylgeranyl reductase  21.38 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  21.31 
 
 		 413 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  23.47 
 
 		 376 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1161  geranylgeranyl reductase  21.48 
 
 		 429 aa  54.3  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0418  monooxygenase FAD-binding  19.72 
 
 		 364 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  22.08 
 
 		 415 aa  54.3  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  21.86 
 
 		 424 aa  53.5  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  20.95 
 
 		 409 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  22.19 
 
 		 455 aa  53.5  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  23.3 
 
 		 380 aa  53.1  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  22.77 
 
 		 403 aa  53.1  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  24.41 
 
 		 373 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  22.04 
 
 		 449 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  21.75 
 
 		 425 aa  52  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  22.41 
 
 		 368 aa  52.8  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17730  geranylgeranyl reductase family protein  22.53 
 
 		 466 aa  52.8  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  22.44 
 
 		 449 aa  52.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>