24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3634 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3634  putative electron transfer oxidoreductase  100 
 
 		 340 aa  662    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.822942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5035  FAD dependent oxidoreductase  30.35 
 
 		 374 aa  99.8  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  30.23 
 
 		 375 aa  97.4  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 		 375 aa  96.7  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1644  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 		 378 aa  92  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00782092 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3796  oxidoreductase  22.46 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.204918 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10918  putative oxidoreductase  23.95 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.183929  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2035  FAD dependent oxidoreductase  22.96 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4710  FAD dependent oxidoreductase  32.1 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  31.01 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3389  monooxygenase FAD-binding  28.77 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1512  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 		 365 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.193117  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2674  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 		 443 aa  54.3  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.680206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0255  FAD dependent oxidoreductase  24.83 
 
 		 352 aa  52.4  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.794372 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18731  NAD binding site  26.12 
 
 		 385 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.413657 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  31.2 
 
 		 383 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0420  hypothetical protein  25.17 
 
 		 363 aa  50.1  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.299605 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  29.93 
 
 		 424 aa  49.7  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1340  hypothetical protein  29 
 
 		 381 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  32.2 
 
 		 426 aa  46.6  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  34.33 
 
 		 419 aa  46.6  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  24.93 
 
 		 376 aa  46.2  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  30.51 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  31.03 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>