259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1512 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1512  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 365 aa  736    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.193117  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  27.25 
 
 		 375 aa  139  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2035  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 		 379 aa  129  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5035  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 		 374 aa  122  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1644  FAD dependent oxidoreductase  27.73 
 
 		 378 aa  119  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00782092 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3796  oxidoreductase  25.65 
 
 		 377 aa  116  7.999999999999999e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.204918 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  25.98 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  27.04 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3389  monooxygenase FAD-binding  29.91 
 
 		 392 aa  105  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  28.28 
 
 		 398 aa  94  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  24.93 
 
 		 413 aa  94  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  26.68 
 
 		 393 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  23.94 
 
 		 384 aa  90.9  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10918  putative oxidoreductase  24.93 
 
 		 374 aa  90.9  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.183929  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  25.61 
 
 		 393 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  25.93 
 
 		 398 aa  89.7  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  27.04 
 
 		 398 aa  89  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  26.52 
 
 		 418 aa  79.7  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  27.75 
 
 		 424 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  27.78 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  26.29 
 
 		 426 aa  76.3  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  26.8 
 
 		 396 aa  75.9  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  25.19 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2674  FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.680206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  26.69 
 
 		 461 aa  75.5  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  26.41 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  27.47 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  24.06 
 
 		 445 aa  73.2  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  25.76 
 
 		 370 aa  72.8  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  25.06 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  24.94 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  24.93 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  25.54 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  24.43 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  23.31 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  27.5 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  26.73 
 
 		 430 aa  67  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  21.32 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  30.07 
 
 		 403 aa  66.2  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  26.18 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  25.63 
 
 		 384 aa  65.5  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1061  monooxygenase, FAD-binding protein  28.96 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1077  monooxygenase, FAD-binding  28.96 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0754157 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00520  flavin-dependent dehydrogenase  27.02 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.845908  normal  0.877711 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  25.8 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  27.3 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  28.22 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1604  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  24.87 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  26.4 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1088  monooxygenase, FAD-binding  27.88 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  26.4 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0162  geranylgeranyl reductase  28.12 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.555099  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  23.24 
 
 		 444 aa  62.8  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  24.42 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  27.92 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  26.13 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  23.68 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  23.35 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  22.78 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  28.77 
 
 		 383 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  23.85 
 
 		 480 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 408 aa  62  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  20.87 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0636  glucose-inhibited division protein A  30 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  28.96 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4182  monooxygenase FAD-binding  27.44 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.787993  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  23.81 
 
 		 434 aa  59.7  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  25.66 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  26.33 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  23.89 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  24.4 
 
 		 443 aa  58.9  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0114  FAD dependent oxidoreductase  22.81 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00154267  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  23.28 
 
 		 470 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  23.28 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5142  monooxygenase, FAD-binding  28.52 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  24.64 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  25 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  25 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  21.95 
 
 		 506 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5117  monooxygenase FAD-binding  27.68 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  26.63 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  22.73 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0255  FAD dependent oxidoreductase  23.06 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.794372 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  21.72 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4211  monooxygenase FAD-binding  26.07 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747744  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  23.4 
 
 		 390 aa  57  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1194  FAD dependent oxidoreductase  27.74 
 
 		 340 aa  57  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  30.39 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  26.69 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  26.44 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0005  geranylgeranyl reductase  27.42 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  22.86 
 
 		 440 aa  56.2  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  43.28 
 
 		 362 aa  55.8  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  34.17 
 
 		 435 aa  55.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  25.91 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  24.45 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  24.16 
 
 		 395 aa  55.8  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  21.41 
 
 		 402 aa  55.1  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>