19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0255 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0420  hypothetical protein  95.17 
 
 		 363 aa  688    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.299605 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0255  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 352 aa  724    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.794372 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  24.47 
 
 		 375 aa  97.4  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3796  oxidoreductase  22.31 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.204918 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1644  FAD dependent oxidoreductase  23.16 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00782092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5035  FAD dependent oxidoreductase  20.58 
 
 		 374 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  22.63 
 
 		 375 aa  66.2  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2035  FAD dependent oxidoreductase  21.89 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1188  monooxygenase, FAD-binding  22.51 
 
 		 378 aa  53.1  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1512  FAD dependent oxidoreductase  22.59 
 
 		 365 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.193117  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  31.06 
 
 		 455 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  22.88 
 
 		 378 aa  52.4  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  20.45 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10918  putative oxidoreductase  20.57 
 
 		 374 aa  47  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.183929  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  22.22 
 
 		 434 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  28.69 
 
 		 431 aa  46.6  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  29.1 
 
 		 457 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  28.79 
 
 		 375 aa  44.7  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  21.19 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>