76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1188 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1188  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 		 378 aa  717    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4710  FAD dependent oxidoreductase  47.62 
 
 		 358 aa  236  6e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 375 aa  95.1  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10918  putative oxidoreductase  24.7 
 
 		 374 aa  88.6  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.183929  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  26.94 
 
 		 375 aa  86.3  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2035  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 		 379 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1644  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 		 378 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00782092 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2674  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.680206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1512  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 		 365 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.193117  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3796  oxidoreductase  22.4 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.204918 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5035  FAD dependent oxidoreductase  24.84 
 
 		 374 aa  72.8  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  25.78 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3389  monooxygenase FAD-binding  29.58 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  24.72 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0255  FAD dependent oxidoreductase  22.29 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.794372 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  31.61 
 
 		 403 aa  62  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  30.43 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  28.4 
 
 		 457 aa  57.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  26.75 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0420  hypothetical protein  21.69 
 
 		 363 aa  57  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.299605 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  27.36 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  29.38 
 
 		 425 aa  57  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0164  putative electron transfer oxidoreductase  29.08 
 
 		 420 aa  54.7  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.762503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  29.34 
 
 		 423 aa  55.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  29.53 
 
 		 408 aa  53.9  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  33.33 
 
 		 418 aa  53.5  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  28.84 
 
 		 445 aa  53.1  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  25.88 
 
 		 445 aa  52.8  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  34.17 
 
 		 443 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  23.45 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  26.38 
 
 		 435 aa  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  26.46 
 
 		 425 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  26.36 
 
 		 431 aa  50.4  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  33.1 
 
 		 444 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  29.75 
 
 		 384 aa  50.4  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  26.83 
 
 		 423 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  26.35 
 
 		 413 aa  49.7  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  27.25 
 
 		 426 aa  49.7  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18731  NAD binding site  25.86 
 
 		 385 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.413657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2102  monooxygenase FAD-binding  29.36 
 
 		 340 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  24.84 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3634  putative electron transfer oxidoreductase  29.26 
 
 		 340 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.822942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  27.79 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  32.79 
 
 		 431 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  22.9 
 
 		 444 aa  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1061  monooxygenase, FAD-binding protein  28.41 
 
 		 338 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  24.78 
 
 		 398 aa  47.4  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  25.93 
 
 		 434 aa  47.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.58 
 
 		 449 aa  47.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1077  monooxygenase, FAD-binding  28.41 
 
 		 338 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0754157 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1535  monooxygenase, FAD-binding  33.59 
 
 		 422 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.859227 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  25.98 
 
 		 414 aa  47  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1088  monooxygenase, FAD-binding  29.28 
 
 		 338 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  25.08 
 
 		 455 aa  46.6  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  37.38 
 
 		 411 aa  46.6  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  31.68 
 
 		 401 aa  46.2  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  30.56 
 
 		 368 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  32.26 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  22.26 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  22.26 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  22.9 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  22.75 
 
 		 444 aa  44.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  29.91 
 
 		 362 aa  45.4  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  30.43 
 
 		 424 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  27.72 
 
 		 392 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  21.79 
 
 		 389 aa  44.3  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  21.7 
 
 		 398 aa  44.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5951  monooxygenase FAD-binding protein  40 
 
 		 337 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  31.96 
 
 		 424 aa  44.3  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1429  hypothetical protein  28.85 
 
 		 395 aa  43.9  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0716636 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5117  monooxygenase FAD-binding  33.16 
 
 		 343 aa  43.1  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  30.77 
 
 		 443 aa  43.1  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2961  N-6 DNA methylase  26.13 
 
 		 530 aa  43.1  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  26.09 
 
 		 398 aa  43.1  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2558  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 		 452 aa  43.1  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.958993  normal  0.172468 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  30.41 
 
 		 470 aa  42.7  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>