19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0420 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0420  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  745    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.299605 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0255  FAD dependent oxidoreductase  95.17 
 
 		 352 aa  688    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.794372 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  24.2 
 
 		 375 aa  91.3  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1644  FAD dependent oxidoreductase  23.67 
 
 		 378 aa  76.3  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00782092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5035  FAD dependent oxidoreductase  21.54 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3796  oxidoreductase  22.07 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.204918 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  22.87 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2035  FAD dependent oxidoreductase  21.89 
 
 		 379 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  22.1 
 
 		 455 aa  50.4  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  20.4 
 
 		 430 aa  50.8  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1512  FAD dependent oxidoreductase  22.59 
 
 		 365 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.193117  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  22.78 
 
 		 378 aa  47  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1188  monooxygenase, FAD-binding  21.77 
 
 		 378 aa  46.2  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10918  putative oxidoreductase  20.29 
 
 		 374 aa  45.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.183929  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  29.31 
 
 		 375 aa  43.5  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  28.33 
 
 		 431 aa  43.5  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  20.45 
 
 		 424 aa  43.1  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2626  monooxygenase FAD-binding  43.86 
 
 		 356 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  21.36 
 
 		 384 aa  42.7  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>