186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2558 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2558  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 452 aa  906    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.958993  normal  0.172468 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0773  FAD dependent oxidoreductase  67.25 
 
 		 455 aa  544  1e-153  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.299543  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1882  FAD dependent oxidoreductase  60.43 
 
 		 462 aa  493  9.999999999999999e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0028  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  57.27 
 
 		 463 aa  488  1e-136  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.29232  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1638  FAD dependent oxidoreductase  60.17 
 
 		 462 aa  477  1e-133  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.298777 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  25.06 
 
 		 396 aa  77  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  22.31 
 
 		 391 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  22.33 
 
 		 390 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  23.3 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  25.48 
 
 		 402 aa  73.2  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  22.6 
 
 		 390 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  22.09 
 
 		 390 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  25.89 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 395 aa  67  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  30.12 
 
 		 422 aa  66.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  24.93 
 
 		 393 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  25.49 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0129  FAD dependent oxidoreductase  31.61 
 
 		 436 aa  62.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  26.54 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  30.62 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  24.7 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  23.04 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  24.86 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  26.78 
 
 		 382 aa  59.3  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1774  FAD dependent oxidoreductase  22.85 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.496071 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  30.08 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  24.62 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4927  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  26.64 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  29.39 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  23.41 
 
 		 443 aa  57  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.41 
 
 		 443 aa  57  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.41 
 
 		 445 aa  57  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  27.02 
 
 		 407 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0489  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  23.68 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.905872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  28.92 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  28.92 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4604  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  32.94 
 
 		 432 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  28.11 
 
 		 435 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  28.11 
 
 		 435 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  28.51 
 
 		 429 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  28.92 
 
 		 429 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0636  glucose-inhibited division protein A  28.41 
 
 		 395 aa  55.8  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5084  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  25.46 
 
 		 435 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  23.2 
 
 		 453 aa  55.5  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  25.97 
 
 		 393 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  25.97 
 
 		 393 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5046  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  26.09 
 
 		 435 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  28.06 
 
 		 400 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  27.71 
 
 		 435 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0083  putative oxidoreductase FixC  27.56 
 
 		 428 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.715205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  27.4 
 
 		 430 aa  54.3  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  24.7 
 
 		 457 aa  54.3  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1090  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  26.82 
 
 		 435 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0083  putative oxidoreductase FixC  27.56 
 
 		 428 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  24.54 
 
 		 430 aa  54.3  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0087  putative oxidoreductase FixC  27.68 
 
 		 428 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0086  putative oxidoreductase FixC  27.68 
 
 		 428 aa  54.3  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  26.67 
 
 		 418 aa  54.3  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  23.48 
 
 		 380 aa  54.3  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1553  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  23.32 
 
 		 436 aa  53.9  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457963  normal  0.229666 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0084  putative oxidoreductase FixC  27.68 
 
 		 428 aa  54.3  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0574  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 		 429 aa  53.9  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  27.66 
 
 		 413 aa  53.9  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  26.83 
 
 		 396 aa  53.9  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  28.69 
 
 		 429 aa  53.9  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  27.73 
 
 		 429 aa  53.9  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  27.71 
 
 		 436 aa  53.5  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  25.58 
 
 		 393 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4276  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  25.65 
 
 		 434 aa  53.5  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  24.69 
 
 		 405 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  23.79 
 
 		 405 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00047  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  28.05 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3556  FAD dependent oxidoreductase  28.05 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00046  hypothetical protein  28.05 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3612  putative oxidoreductase FixC  28.05 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  28 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0049  putative oxidoreductase FixC  28.05 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  25.31 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3106  FAD dependent oxidoreductase  24.48 
 
 		 472 aa  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000790545 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  23.95 
 
 		 348 aa  52  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  31.94 
 
 		 457 aa  51.6  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  24.19 
 
 		 406 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1370  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  22.87 
 
 		 434 aa  51.2  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  26.36 
 
 		 423 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  30.04 
 
 		 424 aa  51.6  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.11 
 
 		 449 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0047  putative oxidoreductase FixC  25.69 
 
 		 428 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0770  geranylgeranyl reductase  30.87 
 
 		 400 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0784  geranylgeranyl reductase  30.87 
 
 		 406 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  28.25 
 
 		 382 aa  51.2  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0765  geranylgeranyl reductase  30.87 
 
 		 406 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7737  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  28.33 
 
 		 436 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0047  putative oxidoreductase FixC  27.6 
 
 		 428 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1696  geranylgeranyl reductase  26.69 
 
 		 459 aa  51.2  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  23.6 
 
 		 418 aa  50.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 452 aa  50.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  25.46 
 
 		 425 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  28.83 
 
 		 409 aa  50.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  24.1 
 
 		 381 aa  50.8  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3927  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 		 431 aa  50.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.610841 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>