110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4710 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4710  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 358 aa  676    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1188  monooxygenase, FAD-binding  47.49 
 
 		 378 aa  218  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  28.85 
 
 		 375 aa  99.8  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 375 aa  90.1  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5035  FAD dependent oxidoreductase  27.9 
 
 		 374 aa  80.9  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3796  oxidoreductase  21.08 
 
 		 377 aa  79.3  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.204918 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10918  putative oxidoreductase  23.69 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.183929  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3389  monooxygenase FAD-binding  29.06 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2035  FAD dependent oxidoreductase  25.08 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1644  FAD dependent oxidoreductase  25.87 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00782092 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3634  putative electron transfer oxidoreductase  32.18 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.822942  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  27.44 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1088  monooxygenase, FAD-binding  31.62 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  24.26 
 
 		 382 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  29.09 
 
 		 457 aa  63.9  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1061  monooxygenase, FAD-binding protein  31.05 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1077  monooxygenase, FAD-binding  31.05 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0754157 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2674  FAD dependent oxidoreductase  30.5 
 
 		 443 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.680206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  29.57 
 
 		 423 aa  62  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  26.22 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  28.01 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  27.61 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  28.88 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  26.17 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  29.41 
 
 		 431 aa  59.7  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  28 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0255  FAD dependent oxidoreductase  23.98 
 
 		 352 aa  59.3  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.794372 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  29.78 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  27.99 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0636  glucose-inhibited division protein A  24.56 
 
 		 395 aa  57  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0420  hypothetical protein  24.66 
 
 		 363 aa  56.2  0.0000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.299605 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  29.24 
 
 		 431 aa  55.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  28.9 
 
 		 413 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1512  FAD dependent oxidoreductase  27.21 
 
 		 365 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.193117  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  27.15 
 
 		 445 aa  55.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  26.93 
 
 		 426 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18731  NAD binding site  29.69 
 
 		 385 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.413657 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  28.92 
 
 		 434 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  25.69 
 
 		 435 aa  53.9  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  36 
 
 		 425 aa  53.5  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  34.82 
 
 		 424 aa  53.5  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  28.32 
 
 		 411 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  36.21 
 
 		 443 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  35.11 
 
 		 375 aa  51.2  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  27.08 
 
 		 430 aa  50.4  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  35.48 
 
 		 419 aa  49.7  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  33.02 
 
 		 362 aa  49.7  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  32.41 
 
 		 368 aa  49.3  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  26.5 
 
 		 393 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  33.55 
 
 		 403 aa  49.3  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  26.88 
 
 		 443 aa  49.3  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3104  monooxygenase, FAD-binding  25.94 
 
 		 373 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  26.81 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  28.45 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  30.57 
 
 		 383 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  35.25 
 
 		 444 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  24.59 
 
 		 461 aa  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  24.07 
 
 		 384 aa  47.4  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  23.41 
 
 		 398 aa  47.4  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  26.56 
 
 		 384 aa  47  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  27.06 
 
 		 378 aa  47  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  27.14 
 
 		 398 aa  47  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  27.21 
 
 		 370 aa  46.6  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  29.11 
 
 		 371 aa  46.2  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0465  thioredoxin reductase  49.02 
 
 		 305 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  26.4 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  33.1 
 
 		 401 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  26.25 
 
 		 376 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2558  FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 		 452 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.958993  normal  0.172468 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00047  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  29 
 
 		 428 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3556  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 		 428 aa  45.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2256  FAD-binding monooxygenase  37.5 
 
 		 399 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0049  putative oxidoreductase FixC  29 
 
 		 428 aa  45.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0047  putative oxidoreductase FixC  29 
 
 		 428 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  28.3 
 
 		 440 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  55.88 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617769  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3612  putative oxidoreductase FixC  29 
 
 		 428 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  26.13 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00046  hypothetical protein  29 
 
 		 428 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4276  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  28.8 
 
 		 434 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  22.42 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5142  monooxygenase, FAD-binding  35.19 
 
 		 348 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  32.76 
 
 		 430 aa  44.3  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3185  monooxygenase FAD-binding  30.28 
 
 		 442 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304651  hitchhiker  0.000303065 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  24.62 
 
 		 398 aa  44.3  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5117  monooxygenase FAD-binding  31.14 
 
 		 343 aa  44.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1621  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  52.94 
 
 		 326 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00734465  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1405  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  52.94 
 
 		 326 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0297448  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1377  thioredoxin reductase  52.94 
 
 		 326 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1376  thioredoxin reductase  52.94 
 
 		 326 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0895595  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  23.35 
 
 		 396 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1515  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  52.94 
 
 		 326 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000898092  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1262  uncharacterized FAD-dependent dehydrogenase  28.78 
 
 		 539 aa  43.9  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.65008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1656  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  52.94 
 
 		 326 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000378104  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1550  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  52.94 
 
 		 326 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3795  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  52.94 
 
 		 326 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000252573  hitchhiker  0.00000000266911 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1589  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  52.94 
 
 		 326 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75583e-24 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  27.78 
 
 		 409 aa  43.5  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1161  geranylgeranyl reductase  31.35 
 
 		 429 aa  43.9  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.32 
 
 		 455 aa  43.5  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>