285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_18731 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_18731  NAD binding site  100 
 
 		 385 aa  768    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.413657 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1340  hypothetical protein  57.87 
 
 		 381 aa  384  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  31.62 
 
 		 413 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  28.67 
 
 		 423 aa  103  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  28.37 
 
 		 423 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  23.29 
 
 		 375 aa  97.4  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  28.77 
 
 		 431 aa  92.8  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2674  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 		 443 aa  92  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.680206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  28.09 
 
 		 418 aa  90.5  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  27.99 
 
 		 434 aa  90.5  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  29.15 
 
 		 435 aa  88.6  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  29.38 
 
 		 426 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  30.84 
 
 		 378 aa  88.2  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  27.92 
 
 		 430 aa  86.7  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  27.51 
 
 		 414 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  24.35 
 
 		 375 aa  84.7  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  28.01 
 
 		 431 aa  83.6  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  28.14 
 
 		 425 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  28 
 
 		 443 aa  82  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  26.9 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  28.05 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  27.66 
 
 		 445 aa  82  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5035  FAD dependent oxidoreductase  22.97 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  26.2 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  28.87 
 
 		 424 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  22.54 
 
 		 415 aa  79.7  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  29.02 
 
 		 384 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  28.28 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  29.04 
 
 		 430 aa  77  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  27.59 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  27.82 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  30.16 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  27.14 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3389  monooxygenase FAD-binding  28.1 
 
 		 392 aa  72.4  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  34.12 
 
 		 424 aa  72.4  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1330  geranylgeranyl reductase  23.36 
 
 		 376 aa  72.8  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  26.65 
 
 		 398 aa  72.4  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  23.45 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  26.95 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1644  FAD dependent oxidoreductase  23.35 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00782092 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  20.83 
 
 		 422 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  22.6 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10918  putative oxidoreductase  19.84 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.183929  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  27.3 
 
 		 384 aa  69.7  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  26.98 
 
 		 409 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  25.5 
 
 		 395 aa  68.9  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  26.04 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  24.26 
 
 		 393 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  21.45 
 
 		 387 aa  67  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  26.57 
 
 		 420 aa  66.6  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  22.97 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  37.7 
 
 		 457 aa  66.6  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  23.04 
 
 		 393 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  29.33 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  29.55 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  26.09 
 
 		 382 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  25.6 
 
 		 443 aa  63.5  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  31.4 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  27.51 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1604  geranylgeranyl reductase  26.16 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1099  geranylgeranyl reductase  27.18 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.997696  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  22.28 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  25.86 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  29.41 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2035  FAD dependent oxidoreductase  24.32 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  21.82 
 
 		 424 aa  62.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  26.85 
 
 		 398 aa  62.8  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  25.94 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  26.24 
 
 		 400 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  27.7 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  25.45 
 
 		 506 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1512  FAD dependent oxidoreductase  33.86 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.193117  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1298  geranylgeranyl reductase  26.78 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  24.37 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  28.82 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  28.82 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  27.13 
 
 		 407 aa  59.7  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  22.64 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  25.24 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  24.16 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  27.44 
 
 		 470 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  28.84 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1696  geranylgeranyl reductase  30.64 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  23.75 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  25.29 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  22.96 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  25.78 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  23.55 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0164  putative electron transfer oxidoreductase  30.95 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.762503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  24.85 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  29.78 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  27.78 
 
 		 368 aa  57  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6230  FAD dependent oxidoreductase  29.53 
 
 		 435 aa  57  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4237  putative oxidoreductase  23.93 
 
 		 356 aa  57  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3575  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  25.3 
 
 		 435 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120471  normal  0.145615 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  22.42 
 
 		 429 aa  56.2  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  29.48 
 
 		 415 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  22.19 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  22.66 
 
 		 435 aa  56.2  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  25.39 
 
 		 429 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>