181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4237 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4237  putative oxidoreductase  100 
 
 		 356 aa  724    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0371  putative oxidoreductase  44.32 
 
 		 356 aa  294  2e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3617  putative oxidoreductase  43.63 
 
 		 353 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0110465  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0282  putative oxidoreductase  40.39 
 
 		 353 aa  268  8.999999999999999e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.951437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5123  putative oxidoreductase  38.24 
 
 		 354 aa  251  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.121383 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3902  putative oxidoreductase  38.18 
 
 		 366 aa  249  7e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4200  putative oxidoreductase  37.89 
 
 		 354 aa  249  7e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4056  putative oxidoreductase  37.89 
 
 		 361 aa  248  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03573  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  37.61 
 
 		 354 aa  247  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.360175  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0013  putative oxidoreductase  37.61 
 
 		 354 aa  247  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03517  hypothetical protein  37.61 
 
 		 354 aa  247  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.394006  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0013  putative oxidoreductase  37.89 
 
 		 354 aa  246  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  28.93 
 
 		 380 aa  89.4  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  29.34 
 
 		 380 aa  88.2  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  28.35 
 
 		 405 aa  86.3  8e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  27.51 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  28.66 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  27.99 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  29.22 
 
 		 402 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  28.14 
 
 		 418 aa  79.7  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  26.96 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  28.75 
 
 		 380 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1721  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 401 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889725  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  27.84 
 
 		 400 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  25.47 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  28.3 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6424  geranylgeranyl reductase  29.15 
 
 		 403 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0167  geranylgeranyl reductase  29.77 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  27.44 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  28.31 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  28.31 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  27.85 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  26.41 
 
 		 406 aa  73.2  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  28.49 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  28.49 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  27.11 
 
 		 405 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  27.27 
 
 		 407 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  26.35 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  28.71 
 
 		 409 aa  70.1  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  27.38 
 
 		 421 aa  69.7  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  26.26 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.45 
 
 		 449 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  26.43 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2063  geranylgeranyl reductase  28.3 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.104109 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  30.65 
 
 		 394 aa  67  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 		 455 aa  66.6  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  25.51 
 
 		 452 aa  66.6  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  25.08 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5367  geranylgeranyl reductase  26.94 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.707854 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  28.19 
 
 		 457 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1304  geranylgeranyl reductase  25.89 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  26.07 
 
 		 468 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.75 
 
 		 446 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  23.96 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.73 
 
 		 446 aa  63.5  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  27.63 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5289  geranylgeranyl reductase  26.83 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.683475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0629  geranylgeranyl reductase  27.24 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978932  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  26.99 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  25.83 
 
 		 425 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4822  geranylgeranyl reductase  26.83 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.0333239 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1739  geranylgeranyl reductase  28.9 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539865  normal  0.0147858 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  24.62 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  26.11 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.36 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119498  geranylgeranyl reductase  29.59 
 
 		 462 aa  60.8  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  27.91 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0520333 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  24.93 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2779  geranylgeranyl reductase  26.72 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  23.75 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.44 
 
 		 445 aa  60.5  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  24.05 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0269  geranylgeranyl reductase  22.91 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0349456 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3481  geranylgeranyl reductase  24.09 
 
 		 374 aa  59.3  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  26.4 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  23.75 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1854  geranylgeranyl reductase  26.54 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0189229 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  25.32 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  24.93 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  25.95 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.95 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  23.99 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50650  predicted protein  29.24 
 
 		 463 aa  57.4  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  24.76 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  27.22 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  23.78 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  24.46 
 
 		 458 aa  55.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  27.04 
 
 		 409 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  23.92 
 
 		 392 aa  55.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  23.23 
 
 		 403 aa  55.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  24.62 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4404  monooxygenase FAD-binding  21.8 
 
 		 565 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5805  monooxygenase FAD-binding  25.39 
 
 		 547 aa  53.9  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000018754  hitchhiker  0.00132409 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0732  hypothetical protein  22.12 
 
 		 358 aa  53.9  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  25.51 
 
 		 423 aa  53.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  24.4 
 
 		 424 aa  53.5  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  22.57 
 
 		 376 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5086  monooxygenase, FAD-binding  21.51 
 
 		 570 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5774  monooxygenase, FAD-binding  21.51 
 
 		 570 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750601 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>