265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1340 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1340  hypothetical protein  100 
 
 		 381 aa  759    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18731  NAD binding site  57.87 
 
 		 385 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.413657 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  28.35 
 
 		 413 aa  87  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  30.4 
 
 		 434 aa  87.4  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  24.16 
 
 		 375 aa  87  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  31.38 
 
 		 424 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  29.16 
 
 		 443 aa  84.7  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  27.32 
 
 		 378 aa  82.4  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  28.22 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2674  FAD dependent oxidoreductase  26.22 
 
 		 443 aa  80.1  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.680206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  23.06 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  25.19 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  26.81 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  29.83 
 
 		 430 aa  76.6  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  29.09 
 
 		 435 aa  76.3  0.0000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5035  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  27.75 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  27.35 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  28.7 
 
 		 425 aa  73.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  29.12 
 
 		 431 aa  72.8  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  37.93 
 
 		 409 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  31.32 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3796  oxidoreductase  23.43 
 
 		 377 aa  72.8  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.204918 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  31.68 
 
 		 375 aa  72  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1330  geranylgeranyl reductase  24.09 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  29.36 
 
 		 418 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  26.33 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  22.66 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  27.91 
 
 		 431 aa  70.9  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  28.49 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  28.34 
 
 		 431 aa  70.1  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  21.69 
 
 		 409 aa  68.9  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  21.97 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  26.41 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  20.89 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  25 
 
 		 384 aa  67  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  21.64 
 
 		 390 aa  67  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  26.09 
 
 		 398 aa  67  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  21.45 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  35.77 
 
 		 457 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  35.54 
 
 		 365 aa  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1644  FAD dependent oxidoreductase  25.16 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00782092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  29.31 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  24.79 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  21 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2035  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4182  monooxygenase FAD-binding  28.95 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.787993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  35 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  24.28 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  37.61 
 
 		 443 aa  63.5  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  25.96 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  23.31 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  25.98 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  22.92 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  23.58 
 
 		 384 aa  62.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  24.44 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  22.22 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  36.05 
 
 		 424 aa  62  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  27.62 
 
 		 384 aa  62  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10918  putative oxidoreductase  24.01 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.183929  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  23.53 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3959  monooxygenase FAD-binding  31.84 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  32.48 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  23.24 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  28.83 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  23.82 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  27.49 
 
 		 445 aa  60.5  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3389  monooxygenase FAD-binding  27.42 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  23.99 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1512  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 		 365 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.193117  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  27.3 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  27.67 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  28.74 
 
 		 429 aa  59.7  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  28.74 
 
 		 429 aa  59.7  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  30.71 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1604  geranylgeranyl reductase  26.36 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  28.74 
 
 		 429 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  28.74 
 
 		 429 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1696  geranylgeranyl reductase  28.35 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  30.71 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  23.58 
 
 		 377 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2265  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  29.22 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00453186  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  28.12 
 
 		 409 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  24.55 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3634  putative electron transfer oxidoreductase  29 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.822942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  28.22 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  28.21 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  26.89 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  35.77 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  28.22 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  23.56 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  26.61 
 
 		 420 aa  57  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  22.51 
 
 		 417 aa  57  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  26.71 
 
 		 379 aa  56.6  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  30 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  22.81 
 
 		 429 aa  55.8  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  30 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  25.59 
 
 		 401 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  30 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4604  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  24.8 
 
 		 432 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>