299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1377 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_3127  geranylgeranyl reductase  73.25 
 
 		 458 aa  664    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.541663  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1413  geranylgeranyl reductase  75.11 
 
 		 456 aa  665    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.145276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2778  geranylgeranyl reductase  88.11 
 
 		 471 aa  803    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1377  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 467 aa  955    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0881  geranylgeranyl reductase  70.44 
 
 		 455 aa  613  9.999999999999999e-175  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170951  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  56.96 
 
 		 458 aa  541  1e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2954  geranylgeranyl reductase  56.29 
 
 		 457 aa  491  9.999999999999999e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1523  geranylgeranyl reductase  42.42 
 
 		 495 aa  345  1e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545892  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  34.57 
 
 		 453 aa  204  2e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  32.05 
 
 		 452 aa  176  8e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  32.8 
 
 		 453 aa  166  9e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0811  geranylgeranyl reductase  30.84 
 
 		 453 aa  159  1e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1696  geranylgeranyl reductase  31.08 
 
 		 459 aa  152  1e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0166  geranylgeranyl reductase  26.49 
 
 		 453 aa  133  6e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0681  geranylgeranyl reductase  27.62 
 
 		 453 aa  127  4.0000000000000003e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00166018  hitchhiker  0.00000684168 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  27.53 
 
 		 408 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1514  geranylgeranyl reductase  23.44 
 
 		 485 aa  107  6e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00785047 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  27.88 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  27.65 
 
 		 406 aa  102  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  25.95 
 
 		 395 aa  98.6  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  26.67 
 
 		 384 aa  94  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  30.29 
 
 		 387 aa  92  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  29.6 
 
 		 434 aa  90.1  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  31.06 
 
 		 445 aa  89.4  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  30.36 
 
 		 398 aa  88.2  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  26.3 
 
 		 390 aa  88.2  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  29.46 
 
 		 424 aa  88.2  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  28.79 
 
 		 434 aa  87.8  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  30.54 
 
 		 397 aa  87.4  4e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  29.73 
 
 		 435 aa  87.4  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  30.33 
 
 		 398 aa  87.4  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  25.64 
 
 		 390 aa  87  7e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  29.31 
 
 		 407 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3081  FAD dependent oxidoreductase  29.97 
 
 		 413 aa  86.3  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  26.69 
 
 		 402 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  28.3 
 
 		 430 aa  85.9  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  26.13 
 
 		 396 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  26.36 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  25.57 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  30.61 
 
 		 365 aa  83.2  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  29.56 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 		 426 aa  81.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  28.27 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  26.38 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  29.6 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  29.37 
 
 		 423 aa  80.1  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  27.78 
 
 		 360 aa  79.7  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  29.92 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  28.25 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  24.63 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  27.13 
 
 		 457 aa  74.7  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  26.48 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  27.48 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  27.37 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  27.64 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  27.4 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  27.51 
 
 		 431 aa  72.8  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  24.93 
 
 		 399 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  27.25 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  28.02 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  24.4 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  28.45 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  26.35 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  26.72 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  21.66 
 
 		 396 aa  68.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  29.38 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1774  FAD dependent oxidoreductase  24.56 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.496071 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  25.99 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  23.64 
 
 		 375 aa  67  0.0000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1150  monooxygenase FAD-binding protein  24.57 
 
 		 397 aa  67  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862466  normal  0.995827 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  24.87 
 
 		 417 aa  67  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0083  putative oxidoreductase FixC  26.9 
 
 		 428 aa  66.6  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.715205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  26.3 
 
 		 402 aa  66.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1434  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  26.47 
 
 		 442 aa  66.6  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.84038  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  27.43 
 
 		 382 aa  66.2  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  26.18 
 
 		 387 aa  65.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0083  putative oxidoreductase FixC  26.63 
 
 		 428 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  30.43 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  28.43 
 
 		 430 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  25.34 
 
 		 506 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  24.04 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  28.49 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0086  putative oxidoreductase FixC  26.63 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0084  putative oxidoreductase FixC  26.63 
 
 		 428 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0087  putative oxidoreductase FixC  26.63 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1955  hypothetical protein  29.38 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0926  FAD dependent oxidoreductase  25.66 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.609885  hitchhiker  0.00113671 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  27.56 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  25.21 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  24.34 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  25.95 
 
 		 421 aa  62.4  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  22.54 
 
 		 379 aa  62  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 		 452 aa  62  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  28.91 
 
 		 431 aa  62.4  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.21 
 
 		 445 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  31.62 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0164  putative electron transfer oxidoreductase  28.69 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.762503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  25.6 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>