36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2750 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2750  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  100 
 
 		 366 aa  712    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.589907  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0291  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3720  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 372 aa  103  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288954 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0318  dehydrogenases (flavoproteins)-like  24.27 
 
 		 482 aa  96.3  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.331589 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0828  FAD dependent oxidoreductase  26.94 
 
 		 356 aa  87.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.491479  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2626  monooxygenase FAD-binding  25.75 
 
 		 356 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3477  dehydrogenase (flavoprotein)  25.75 
 
 		 356 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00015718  normal  0.0486362 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3529  monooxygenase FAD-binding  29.22 
 
 		 409 aa  80.9  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174105  decreased coverage  0.00232713 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  26.68 
 
 		 480 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1021  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 392 aa  79  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  27.79 
 
 		 506 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  27.3 
 
 		 401 aa  76.3  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  26.32 
 
 		 480 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  26.32 
 
 		 480 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  26.32 
 
 		 480 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  26.32 
 
 		 480 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4493  monooxygenase FAD-binding  25.86 
 
 		 488 aa  69.7  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575117  normal  0.0380746 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5262  hypothetical protein  29.68 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2948  monooxygenase FAD-binding  28.88 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284077  normal  0.479686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  24.87 
 
 		 470 aa  64.3  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4289  monooxygenase FAD-binding  25.07 
 
 		 372 aa  62.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  25.26 
 
 		 491 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2304  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.721165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2472  monooxygenase FAD-binding  28.52 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  30.29 
 
 		 584 aa  59.7  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0759  hypothetical protein  28.53 
 
 		 447 aa  53.1  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6678  tryptophan halogenase  28.07 
 
 		 506 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2979  aromatic-ring hydroxylase  28.05 
 
 		 434 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1421  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  30 
 
 		 403 aa  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.553689  normal  0.021071 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  23.4 
 
 		 424 aa  49.7  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2163  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  26.61 
 
 		 402 aa  47.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.260088  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1702  PimS2 protein  31.36 
 
 		 416 aa  46.2  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.665919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5035  FAD dependent oxidoreductase  22.16 
 
 		 374 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  21.49 
 
 		 422 aa  44.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  22.46 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  22.01 
 
 		 424 aa  43.9  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>