121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4289 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4289  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 372 aa  779    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3477  dehydrogenase (flavoprotein)  32.23 
 
 		 356 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00015718  normal  0.0486362 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2626  monooxygenase FAD-binding  32.23 
 
 		 356 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0318  dehydrogenases (flavoproteins)-like  29.03 
 
 		 482 aa  163  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.331589 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0291  FAD dependent oxidoreductase  28.34 
 
 		 361 aa  143  6e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3720  FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 		 372 aa  134  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288954 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  27.74 
 
 		 401 aa  133  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0828  FAD dependent oxidoreductase  26.58 
 
 		 356 aa  126  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.491479  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3529  monooxygenase FAD-binding  26.51 
 
 		 409 aa  112  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174105  decreased coverage  0.00232713 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  24.33 
 
 		 439 aa  92  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  24.33 
 
 		 439 aa  92  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5262  hypothetical protein  25.21 
 
 		 366 aa  89.7  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1021  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 		 392 aa  87.4  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  24.92 
 
 		 455 aa  82.8  0.000000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  25.07 
 
 		 444 aa  80.5  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  22.19 
 
 		 444 aa  79.7  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  24.4 
 
 		 461 aa  79.3  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  24.32 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  23.53 
 
 		 445 aa  76.3  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  31.1 
 
 		 409 aa  72.8  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1705  FAD dependent oxidoreductase  23.02 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  23.26 
 
 		 449 aa  72.8  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  21.66 
 
 		 444 aa  71.2  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  24.02 
 
 		 587 aa  70.5  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  23.96 
 
 		 413 aa  69.7  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  25.95 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  22.68 
 
 		 455 aa  69.3  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  22.44 
 
 		 506 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  28.9 
 
 		 415 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  29.65 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  23.65 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  29.41 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  29.82 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  22.26 
 
 		 449 aa  63.2  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  24.92 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  24.92 
 
 		 409 aa  62.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  27.49 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  28.4 
 
 		 419 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  28.4 
 
 		 419 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  21.97 
 
 		 495 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  23.87 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  23.55 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  29.94 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  25.45 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  24.18 
 
 		 425 aa  56.6  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  24.25 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  28.74 
 
 		 435 aa  56.2  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  23.77 
 
 		 584 aa  56.2  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  27.71 
 
 		 435 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  28.74 
 
 		 435 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4493  monooxygenase FAD-binding  23.49 
 
 		 488 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575117  normal  0.0380746 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  24.61 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  21.52 
 
 		 480 aa  54.7  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 		 429 aa  54.3  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2979  aromatic-ring hydroxylase  32.63 
 
 		 434 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  23.28 
 
 		 409 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  24.89 
 
 		 417 aa  54.3  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  28.14 
 
 		 436 aa  53.9  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  26.38 
 
 		 429 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  26.82 
 
 		 424 aa  53.5  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  26.38 
 
 		 429 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  26.38 
 
 		 429 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  23.71 
 
 		 413 aa  53.5  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  26.38 
 
 		 429 aa  53.1  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0759  hypothetical protein  29.67 
 
 		 447 aa  53.1  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  27.27 
 
 		 409 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  29.35 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  22.55 
 
 		 418 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  21.45 
 
 		 455 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2948  monooxygenase FAD-binding  22.42 
 
 		 430 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284077  normal  0.479686 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  24.86 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  28.49 
 
 		 390 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  28.49 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  28.8 
 
 		 415 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  21.92 
 
 		 420 aa  50.8  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  27.01 
 
 		 419 aa  50.1  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  23.03 
 
 		 470 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  22.65 
 
 		 391 aa  49.7  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 		 413 aa  50.1  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  22.91 
 
 		 390 aa  49.7  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  25.28 
 
 		 414 aa  49.7  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  21.89 
 
 		 393 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  22.57 
 
 		 647 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  25.7 
 
 		 429 aa  49.3  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2750  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  25.23 
 
 		 366 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.589907  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  29.35 
 
 		 396 aa  48.9  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  27.55 
 
 		 457 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  26.2 
 
 		 529 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07601  NAD binding site  21.95 
 
 		 375 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2472  monooxygenase FAD-binding  24.55 
 
 		 430 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3046  tryptophan halogenase  29.94 
 
 		 414 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354433  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  22.71 
 
 		 376 aa  47.8  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  29.94 
 
 		 414 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  22.22 
 
 		 405 aa  47.8  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  29.41 
 
 		 377 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  20.38 
 
 		 491 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2083  FAD dependent oxidoreductase  22.67 
 
 		 344 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  23.91 
 
 		 434 aa  47.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  22.16 
 
 		 393 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  21.92 
 
 		 410 aa  47.4  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>