86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1070 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1070  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  774    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1429  hypothetical protein  56.59 
 
 		 395 aa  407  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0716636 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15361  NAD binding site  48.06 
 
 		 405 aa  325  6e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.298365 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08531  dehydrogenases (flavoproteins)  41.45 
 
 		 398 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.741714  hitchhiker  0.00186449 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4688  monooxygenase FAD-binding  29.34 
 
 		 417 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0431  hypothetical protein  31.11 
 
 		 422 aa  159  6e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.446535  normal  0.169558 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  24.25 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1955  hypothetical protein  31.54 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  28.17 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  28.38 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  23.84 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  26.41 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  22.42 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  26.51 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  22.84 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  27.22 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  28.21 
 
 		 411 aa  53.1  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  25.49 
 
 		 382 aa  53.1  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  24.83 
 
 		 407 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  22.61 
 
 		 384 aa  53.1  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  27.91 
 
 		 406 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  33.93 
 
 		 426 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0926  FAD dependent oxidoreductase  21.25 
 
 		 411 aa  52.4  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.609885  hitchhiker  0.00113671 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119498  geranylgeranyl reductase  22.67 
 
 		 462 aa  51.6  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  27.83 
 
 		 406 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  24.58 
 
 		 405 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  25.11 
 
 		 396 aa  50.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  28.52 
 
 		 399 aa  50.1  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  23.59 
 
 		 405 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.1 
 
 		 449 aa  49.7  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  23.59 
 
 		 405 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  25.26 
 
 		 394 aa  49.7  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  25.26 
 
 		 394 aa  49.7  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  22.3 
 
 		 443 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  30.32 
 
 		 418 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  22.56 
 
 		 446 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  22.97 
 
 		 446 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  24.58 
 
 		 386 aa  49.3  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  22.3 
 
 		 443 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  25.17 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  22.11 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  21.75 
 
 		 382 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  33.62 
 
 		 365 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  22.92 
 
 		 445 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  22.64 
 
 		 446 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0714  geranylgeranyl reductase  33.33 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  33.33 
 
 		 430 aa  47.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  23.11 
 
 		 439 aa  47.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  23.11 
 
 		 439 aa  47.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  24.33 
 
 		 396 aa  47  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  28.07 
 
 		 423 aa  47  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  29.01 
 
 		 407 aa  46.6  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  26.12 
 
 		 406 aa  46.6  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  28.33 
 
 		 449 aa  46.6  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  22.89 
 
 		 455 aa  46.2  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3081  FAD dependent oxidoreductase  23.78 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  24.27 
 
 		 434 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  33.06 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  21.93 
 
 		 452 aa  44.3  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  31.53 
 
 		 375 aa  44.7  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  22.81 
 
 		 457 aa  44.7  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0770  geranylgeranyl reductase  31.4 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0784  geranylgeranyl reductase  31.4 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  20.15 
 
 		 379 aa  44.7  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  27.8 
 
 		 394 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  21.11 
 
 		 468 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0765  geranylgeranyl reductase  31.4 
 
 		 406 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  21.67 
 
 		 380 aa  43.9  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  24.83 
 
 		 391 aa  43.9  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02880  halogenase  26.85 
 
 		 540 aa  43.9  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  25.37 
 
 		 384 aa  43.5  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  27.1 
 
 		 398 aa  43.5  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  28.7 
 
 		 403 aa  43.5  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  22.76 
 
 		 444 aa  43.5  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  28.31 
 
 		 362 aa  43.5  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5367  geranylgeranyl reductase  24.03 
 
 		 397 aa  43.5  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.707854 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  28.49 
 
 		 374 aa  43.1  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0991  geranylgeranyl reductase  30.97 
 
 		 418 aa  43.1  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  32.91 
 
 		 419 aa  43.1  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  21.58 
 
 		 414 aa  43.1  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2954  geranylgeranyl reductase  23.89 
 
 		 457 aa  43.1  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0362  geranylgeranyl reductase  31.36 
 
 		 436 aa  43.1  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.495463  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0164  putative electron transfer oxidoreductase  26.61 
 
 		 420 aa  43.1  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.762503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  25.75 
 
 		 453 aa  42.7  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2779  geranylgeranyl reductase  27.41 
 
 		 330 aa  42.7  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  28.21 
 
 		 389 aa  42.7  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>