161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4688 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4688  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 417 aa  850    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0431  hypothetical protein  42.49 
 
 		 422 aa  344  2e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.446535  normal  0.169558 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08531  dehydrogenases (flavoproteins)  34.09 
 
 		 398 aa  226  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.741714  hitchhiker  0.00186449 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15361  NAD binding site  32.76 
 
 		 405 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.298365 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1429  hypothetical protein  31.44 
 
 		 395 aa  192  1e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0716636 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1070  hypothetical protein  28.57 
 
 		 387 aa  169  1e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1955  hypothetical protein  25.99 
 
 		 405 aa  114  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  25.5 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0926  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 		 411 aa  106  7e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.609885  hitchhiker  0.00113671 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3081  FAD dependent oxidoreductase  26.11 
 
 		 413 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  28.29 
 
 		 410 aa  106  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  26.91 
 
 		 414 aa  101  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 409 aa  98.2  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  25.51 
 
 		 410 aa  97.8  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  25.57 
 
 		 413 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  25.22 
 
 		 380 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  25.32 
 
 		 378 aa  76.3  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  25.54 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  24.5 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  24.38 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  24.38 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  24.28 
 
 		 425 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  24.23 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  24.54 
 
 		 434 aa  71.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  24.78 
 
 		 423 aa  70.5  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  24.7 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  24.25 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  24.43 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  23.76 
 
 		 431 aa  69.3  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  26.48 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  24.22 
 
 		 430 aa  67.8  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  23.72 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  23.15 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  24.25 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  22.61 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  24.24 
 
 		 457 aa  64.3  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  23.12 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  24.18 
 
 		 434 aa  63.2  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  23.6 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  22.41 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  26.33 
 
 		 453 aa  60.1  0.00000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  23.48 
 
 		 396 aa  59.7  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  23.31 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  23.81 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  23.34 
 
 		 396 aa  58.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  23.9 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  21.43 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  23.48 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  26.02 
 
 		 452 aa  57.4  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  24 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  23.6 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 		 390 aa  57  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  23.48 
 
 		 390 aa  57  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  21.96 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  20.55 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  24.4 
 
 		 380 aa  56.2  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  22.9 
 
 		 365 aa  56.2  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  22.57 
 
 		 393 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  25.08 
 
 		 402 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  23.88 
 
 		 426 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  23.36 
 
 		 384 aa  55.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  23.19 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  23.08 
 
 		 430 aa  55.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  21.23 
 
 		 379 aa  54.7  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  23.22 
 
 		 363 aa  55.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  22.26 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  22.65 
 
 		 401 aa  54.3  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  23.73 
 
 		 411 aa  54.3  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  23.47 
 
 		 386 aa  54.3  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  21.49 
 
 		 379 aa  54.3  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4493  monooxygenase FAD-binding  22.75 
 
 		 488 aa  54.3  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575117  normal  0.0380746 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  22.37 
 
 		 402 aa  53.9  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  22.16 
 
 		 375 aa  53.5  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  20.36 
 
 		 392 aa  53.5  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  21.61 
 
 		 376 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17730  geranylgeranyl reductase family protein  23.12 
 
 		 466 aa  52.8  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  21.53 
 
 		 439 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  23.4 
 
 		 435 aa  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  22.53 
 
 		 452 aa  52.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  23.87 
 
 		 380 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  21.53 
 
 		 439 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  22.34 
 
 		 468 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  24.04 
 
 		 399 aa  51.6  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  21.83 
 
 		 422 aa  51.6  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3882  monooxygenase FAD-binding protein  22.74 
 
 		 410 aa  51.6  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  22.56 
 
 		 405 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  23.26 
 
 		 360 aa  50.8  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  22.47 
 
 		 398 aa  50.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  21.92 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  23.91 
 
 		 406 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1696  geranylgeranyl reductase  26.13 
 
 		 459 aa  49.3  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  21.2 
 
 		 384 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2805  monooxygenase FAD-binding protein  24.06 
 
 		 369 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  23.37 
 
 		 449 aa  48.9  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  21.2 
 
 		 503 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1304  geranylgeranyl reductase  23.15 
 
 		 400 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  21.23 
 
 		 405 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  22.57 
 
 		 425 aa  47.4  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0636  glucose-inhibited division protein A  23.88 
 
 		 395 aa  47.4  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2426  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  23.23 
 
 		 258 aa  47.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00205999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>