More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1823 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  85.89 
 
 		 405 aa  735    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  84.24 
 
 		 418 aa  721    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  82.27 
 
 		 457 aa  699    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  88.12 
 
 		 405 aa  744    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  88.12 
 
 		 405 aa  742    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 406 aa  840    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  84.28 
 
 		 407 aa  713    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  84.48 
 
 		 406 aa  719    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  73.59 
 
 		 452 aa  618  1e-176  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  74.08 
 
 		 455 aa  619  1e-176  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  71.88 
 
 		 446 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  71.64 
 
 		 446 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  71.39 
 
 		 446 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  71.85 
 
 		 468 aa  605  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  72.37 
 
 		 449 aa  592  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  70.32 
 
 		 445 aa  587  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  70.9 
 
 		 443 aa  562  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  70.9 
 
 		 443 aa  562  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119498  geranylgeranyl reductase  68.24 
 
 		 462 aa  554  1e-156  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50650  predicted protein  62.29 
 
 		 463 aa  510  1e-143  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  44.83 
 
 		 421 aa  338  8e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  43.25 
 
 		 406 aa  320  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  42 
 
 		 406 aa  316  4e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  41.61 
 
 		 379 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  40.69 
 
 		 379 aa  271  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  39.32 
 
 		 380 aa  267  2e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  39.01 
 
 		 380 aa  259  6e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  37.78 
 
 		 380 aa  255  8e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  39.3 
 
 		 380 aa  252  8.000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  37.83 
 
 		 380 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  39.1 
 
 		 400 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0167  geranylgeranyl reductase  37.6 
 
 		 393 aa  232  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  37.34 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  36.64 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  37.13 
 
 		 394 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  37.13 
 
 		 394 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1721  geranylgeranyl reductase  36.72 
 
 		 401 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889725  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1304  geranylgeranyl reductase  37.17 
 
 		 400 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  37.38 
 
 		 394 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  38.93 
 
 		 405 aa  210  3e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  35.08 
 
 		 402 aa  210  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2063  geranylgeranyl reductase  36.71 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.104109 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5367  geranylgeranyl reductase  35.58 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.707854 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1854  geranylgeranyl reductase  33.93 
 
 		 408 aa  204  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0189229 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6424  geranylgeranyl reductase  34.73 
 
 		 403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4822  geranylgeranyl reductase  35.58 
 
 		 397 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.0333239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5289  geranylgeranyl reductase  35.58 
 
 		 397 aa  196  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.683475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2779  geranylgeranyl reductase  37.09 
 
 		 330 aa  192  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0629  geranylgeranyl reductase  34.1 
 
 		 413 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978932  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  28.65 
 
 		 375 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  28.04 
 
 		 381 aa  104  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  28.78 
 
 		 378 aa  102  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  30.61 
 
 		 418 aa  98.6  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  31 
 
 		 424 aa  95.9  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  27.53 
 
 		 390 aa  94.4  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  27.78 
 
 		 390 aa  94.4  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  26.18 
 
 		 387 aa  93.6  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  28.02 
 
 		 390 aa  90.1  6e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  26.44 
 
 		 390 aa  89.7  7e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  27.07 
 
 		 425 aa  89.7  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  27.22 
 
 		 399 aa  89.4  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  26.8 
 
 		 391 aa  89.4  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  28.49 
 
 		 419 aa  89  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  26.95 
 
 		 382 aa  87.4  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  25.19 
 
 		 396 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  27.27 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  25.51 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  28.15 
 
 		 435 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  27.27 
 
 		 396 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  26.87 
 
 		 362 aa  82.8  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  24.45 
 
 		 402 aa  82.4  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  25.13 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  24.94 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  25.32 
 
 		 368 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  27.25 
 
 		 382 aa  79.3  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  27.69 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  27.39 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  25.88 
 
 		 370 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  27.81 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  27.08 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  27.84 
 
 		 430 aa  76.6  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0162  geranylgeranyl reductase  28.25 
 
 		 392 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.555099  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  27.27 
 
 		 434 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  28.01 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  22.79 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  25.32 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  27.7 
 
 		 403 aa  73.6  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  26.06 
 
 		 457 aa  73.2  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  24.07 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  27.62 
 
 		 382 aa  73.2  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  26.72 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  28.48 
 
 		 358 aa  73.2  0.000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0520333 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4237  putative oxidoreductase  26.41 
 
 		 356 aa  72.8  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  27.87 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  24.93 
 
 		 445 aa  72.8  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08531  dehydrogenases (flavoproteins)  25.12 
 
 		 398 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.741714  hitchhiker  0.00186449 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  26.38 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  27.58 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  26.6 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  32.41 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>