More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0178 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  84.69 
 
 
407 aa  717    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  84.9 
 
 
418 aa  722    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  74.88 
 
 
452 aa  635    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  74.88 
 
 
455 aa  638    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  85.15 
 
 
457 aa  711    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  92.59 
 
 
405 aa  790    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  86.63 
 
 
406 aa  731    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  88.12 
 
 
406 aa  742    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  100 
 
 
405 aa  835    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  99.75 
 
 
405 aa  834    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  72.2 
 
 
446 aa  625  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  72.44 
 
 
446 aa  627  1e-178  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  71.71 
 
 
446 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  71.92 
 
 
468 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  73.17 
 
 
449 aa  605  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  71.46 
 
 
445 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  72.2 
 
 
443 aa  580  1e-164  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  72.2 
 
 
443 aa  580  1e-164  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119498  geranylgeranyl reductase  68.49 
 
 
462 aa  549  1e-155  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50650  predicted protein  62.01 
 
 
463 aa  499  1e-140  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  43.92 
 
 
421 aa  333  4e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  42.89 
 
 
406 aa  309  6.999999999999999e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  41.75 
 
 
406 aa  303  5.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  42.11 
 
 
379 aa  287  2e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  41.85 
 
 
379 aa  280  4e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  41.04 
 
 
380 aa  272  7e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  39.9 
 
 
380 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  39.9 
 
 
380 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  40.7 
 
 
380 aa  259  4e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  38.6 
 
 
380 aa  255  8e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  37.81 
 
 
400 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  37.94 
 
 
394 aa  227  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  36.55 
 
 
400 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  37.75 
 
 
394 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  37.75 
 
 
394 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0167  geranylgeranyl reductase  36.57 
 
 
393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1304  geranylgeranyl reductase  36.81 
 
 
400 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1721  geranylgeranyl reductase  36.43 
 
 
401 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889725  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  37 
 
 
394 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  35.6 
 
 
402 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5367  geranylgeranyl reductase  36.19 
 
 
397 aa  212  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.707854 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  37.59 
 
 
405 aa  211  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2063  geranylgeranyl reductase  36.46 
 
 
399 aa  210  4e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.104109 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6424  geranylgeranyl reductase  35.34 
 
 
403 aa  208  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4822  geranylgeranyl reductase  36.19 
 
 
397 aa  204  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.0333239 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1854  geranylgeranyl reductase  32.99 
 
 
408 aa  204  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0189229 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5289  geranylgeranyl reductase  36.19 
 
 
397 aa  203  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.683475  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2779  geranylgeranyl reductase  36.39 
 
 
330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0629  geranylgeranyl reductase  33.59 
 
 
413 aa  169  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978932  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  29.91 
 
 
375 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  30.07 
 
 
381 aa  106  8e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  28.19 
 
 
390 aa  100  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  28.94 
 
 
378 aa  99.8  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  29.38 
 
 
418 aa  97.4  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  28.15 
 
 
390 aa  95.5  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  28.61 
 
 
390 aa  94.4  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  26.84 
 
 
399 aa  92.4  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  25.79 
 
 
387 aa  92  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  27.03 
 
 
390 aa  92  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  29.52 
 
 
424 aa  90.9  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  27.45 
 
 
396 aa  87.4  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  25.85 
 
 
391 aa  87.4  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  24.94 
 
 
391 aa  87  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  24.87 
 
 
395 aa  87  5e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  26.49 
 
 
389 aa  86.3  9e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  25.94 
 
 
396 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  29.25 
 
 
384 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  28.61 
 
 
379 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  27.68 
 
 
382 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  27.6 
 
 
382 aa  82  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  27.88 
 
 
419 aa  81.3  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  24.27 
 
 
408 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  26.72 
 
 
425 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08531  dehydrogenases (flavoproteins)  25.86 
 
 
398 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.741714  hitchhiker  0.00186449 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  34.88 
 
 
384 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  24.33 
 
 
396 aa  78.2  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  28.21 
 
 
370 aa  78.2  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  27.08 
 
 
435 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  24.72 
 
 
377 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  25.39 
 
 
368 aa  74.3  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  25.44 
 
 
391 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  26.06 
 
 
375 aa  73.6  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  25.58 
 
 
362 aa  73.6  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  28.08 
 
 
430 aa  73.6  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  26.67 
 
 
384 aa  73.2  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  25.3 
 
 
374 aa  73.2  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4237  putative oxidoreductase  28.49 
 
 
356 aa  72.8  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 
434 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  24.64 
 
 
423 aa  70.5  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0162  geranylgeranyl reductase  28.9 
 
 
392 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.555099  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  30.34 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  28.2 
 
 
385 aa  70.1  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  25 
 
 
403 aa  69.7  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  23.64 
 
 
393 aa  69.3  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  24.06 
 
 
348 aa  69.3  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  25.23 
 
 
376 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  26.36 
 
 
365 aa  69.3  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  22.85 
 
 
402 aa  68.6  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  23.98 
 
 
392 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  24.94 
 
 
434 aa  67.8  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>