264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3081 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3081  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
413 aa  854    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  81.71 
 
 
414 aa  714    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  68.7 
 
 
410 aa  597  1e-169  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0926  FAD dependent oxidoreductase  67.88 
 
 
411 aa  595  1e-169  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.609885  hitchhiker  0.00113671 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  64.46 
 
 
409 aa  555  1e-157  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  63.95 
 
 
410 aa  552  1e-156  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1955  hypothetical protein  35.37 
 
 
405 aa  215  9.999999999999999e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  33.46 
 
 
398 aa  104  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  26.72 
 
 
396 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0431  hypothetical protein  27.15 
 
 
422 aa  102  9e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.446535  normal  0.169558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  28.87 
 
 
398 aa  99.4  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  32.54 
 
 
399 aa  99.4  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  26.34 
 
 
453 aa  96.7  8e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  24.27 
 
 
452 aa  94.7  3e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  26.54 
 
 
393 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  26.82 
 
 
398 aa  93.6  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  24.68 
 
 
406 aa  92.4  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  23.9 
 
 
408 aa  91.7  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  25.64 
 
 
402 aa  90.9  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  26.84 
 
 
393 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  26.23 
 
 
402 aa  87.8  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  26.61 
 
 
453 aa  87.4  4e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  27.09 
 
 
390 aa  86.7  6e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  27.05 
 
 
390 aa  84  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  25.95 
 
 
395 aa  84.3  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4688  monooxygenase FAD-binding  26.2 
 
 
417 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  27.04 
 
 
407 aa  83.2  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  28.77 
 
 
390 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  25.66 
 
 
398 aa  82  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  29.91 
 
 
430 aa  80.5  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4604  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  27.07 
 
 
432 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  26.65 
 
 
397 aa  80.5  0.00000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  27.43 
 
 
393 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  23.45 
 
 
386 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  27.43 
 
 
393 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  28.27 
 
 
425 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  25.71 
 
 
390 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0811  geranylgeranyl reductase  23.5 
 
 
453 aa  78.2  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  25.13 
 
 
384 aa  79  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  24.6 
 
 
391 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  27.14 
 
 
393 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  25.3 
 
 
387 aa  77.4  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1377  geranylgeranyl reductase  29.68 
 
 
467 aa  75.9  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  28.11 
 
 
431 aa  75.9  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  23.6 
 
 
387 aa  75.9  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  29.23 
 
 
434 aa  75.5  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  24.72 
 
 
376 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  26.2 
 
 
423 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  22.95 
 
 
381 aa  73.2  0.000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08531  dehydrogenases (flavoproteins)  25.16 
 
 
398 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.741714  hitchhiker  0.00186449 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15361  NAD binding site  25.15 
 
 
405 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.298365 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  22.47 
 
 
396 aa  72  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  25.65 
 
 
424 aa  71.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  27.22 
 
 
419 aa  71.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  26.82 
 
 
457 aa  71.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  24.32 
 
 
391 aa  71.2  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  28.24 
 
 
435 aa  70.9  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1696  geranylgeranyl reductase  23.74 
 
 
459 aa  70.9  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  25.66 
 
 
378 aa  70.1  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0681  geranylgeranyl reductase  24.03 
 
 
453 aa  69.3  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00166018  hitchhiker  0.00000684168 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  26.06 
 
 
375 aa  68.9  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0479  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  24.74 
 
 
425 aa  68.9  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000230935  decreased coverage  0.000263259 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  27.37 
 
 
431 aa  68.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  27.07 
 
 
445 aa  68.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3575  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  23.45 
 
 
435 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120471  normal  0.145615 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  23.34 
 
 
444 aa  67.8  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  23.64 
 
 
415 aa  67.4  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  25.61 
 
 
398 aa  66.6  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  20.83 
 
 
439 aa  66.6  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  24.73 
 
 
368 aa  66.6  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  20.83 
 
 
439 aa  66.6  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  26.95 
 
 
414 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  28.99 
 
 
430 aa  65.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  25.29 
 
 
421 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1370  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  23.81 
 
 
434 aa  65.5  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  26.76 
 
 
411 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  21.6 
 
 
377 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  21.56 
 
 
385 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  21.84 
 
 
392 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2315  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  23.51 
 
 
436 aa  64.7  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0377746  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  22.41 
 
 
380 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  24.37 
 
 
405 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  25.21 
 
 
405 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0881  geranylgeranyl reductase  25.25 
 
 
455 aa  63.9  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170951  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  26.41 
 
 
418 aa  63.5  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  23.6 
 
 
444 aa  63.5  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  22.57 
 
 
399 aa  63.2  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1553  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  24.12 
 
 
436 aa  63.2  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457963  normal  0.229666 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  23.38 
 
 
380 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  27.63 
 
 
440 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  22.89 
 
 
455 aa  62  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  21.97 
 
 
444 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  24.85 
 
 
458 aa  62  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  27.91 
 
 
434 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  24.62 
 
 
379 aa  61.6  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  24.68 
 
 
406 aa  62.4  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  29.67 
 
 
443 aa  61.6  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  26.89 
 
 
413 aa  61.6  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  23.7 
 
 
382 aa  62.4  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  25.21 
 
 
405 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>