95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_15361 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_15361  NAD binding site  100 
 
 		 405 aa  817    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.298365 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08531  dehydrogenases (flavoproteins)  48.4 
 
 		 398 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.741714  hitchhiker  0.00186449 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1429  hypothetical protein  50.5 
 
 		 395 aa  384  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0716636 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1070  hypothetical protein  48.06 
 
 		 387 aa  337  2.9999999999999997e-91  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4688  monooxygenase FAD-binding  32.23 
 
 		 417 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0431  hypothetical protein  32.84 
 
 		 422 aa  189  7e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.446535  normal  0.169558 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  26.8 
 
 		 410 aa  87.8  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  25.59 
 
 		 409 aa  85.1  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0926  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 		 411 aa  84  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.609885  hitchhiker  0.00113671 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  23.32 
 
 		 402 aa  76.3  0.0000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  24.04 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1955  hypothetical protein  25.74 
 
 		 405 aa  75.9  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3081  FAD dependent oxidoreductase  25.15 
 
 		 413 aa  72.8  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  22.42 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  24.1 
 
 		 455 aa  66.2  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  24.59 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  25.64 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  23.01 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  24.69 
 
 		 449 aa  63.9  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  26.89 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  26.69 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  24.16 
 
 		 455 aa  60.8  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  25.16 
 
 		 405 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  22.93 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  19.57 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  22.39 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  22.16 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0687  FAD dependent oxidoreductase  23.82 
 
 		 329 aa  54.7  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000330964  unclonable  0.000000300742 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  25.46 
 
 		 423 aa  54.3  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  24.41 
 
 		 390 aa  53.9  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  25.57 
 
 		 400 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  22.42 
 
 		 405 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  22.42 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  23.15 
 
 		 406 aa  52.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  22.61 
 
 		 431 aa  52.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  22.97 
 
 		 406 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  23.55 
 
 		 425 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  22.22 
 
 		 348 aa  51.6  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  29.05 
 
 		 376 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  24.21 
 
 		 378 aa  51.2  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 419 aa  51.2  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  23.69 
 
 		 444 aa  51.6  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  21.87 
 
 		 435 aa  51.2  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  22.7 
 
 		 418 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  22.93 
 
 		 424 aa  51.2  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  22.9 
 
 		 390 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  23.7 
 
 		 418 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  23.75 
 
 		 390 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  24.66 
 
 		 423 aa  50.8  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  23.03 
 
 		 385 aa  50.8  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  22.49 
 
 		 444 aa  50.8  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  21.47 
 
 		 445 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  22.48 
 
 		 439 aa  50.4  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  22.48 
 
 		 439 aa  50.4  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  23.41 
 
 		 426 aa  49.7  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  23.18 
 
 		 434 aa  49.7  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.48 
 
 		 446 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  22.71 
 
 		 443 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  24.63 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1696  geranylgeranyl reductase  26.35 
 
 		 459 aa  48.5  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  23.32 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  26.35 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  22.71 
 
 		 443 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0160  FAD dependent oxidoreductase  23.7 
 
 		 332 aa  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.358314  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  23.1 
 
 		 406 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  19.46 
 
 		 396 aa  47.8  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1514  geranylgeranyl reductase  25.89 
 
 		 485 aa  48.1  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00785047 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  24.75 
 
 		 400 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  25.75 
 
 		 341 aa  47.8  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  23.19 
 
 		 391 aa  47.8  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  21.37 
 
 		 449 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  24.77 
 
 		 452 aa  47.4  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  22.58 
 
 		 446 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  22.58 
 
 		 446 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  22.64 
 
 		 445 aa  47  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0114  FAD dependent oxidoreductase  21.81 
 
 		 399 aa  46.2  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00154267  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  27.33 
 
 		 489 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  23.18 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  23.12 
 
 		 457 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  21.32 
 
 		 457 aa  45.8  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  24.43 
 
 		 394 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  24.43 
 
 		 394 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  21.11 
 
 		 422 aa  43.9  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2585  monooxygenase FAD-binding protein  25.72 
 
 		 479 aa  43.9  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  23.9 
 
 		 380 aa  43.9  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  22 
 
 		 395 aa  43.9  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  24.55 
 
 		 461 aa  43.5  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  21.89 
 
 		 396 aa  43.5  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  23.48 
 
 		 387 aa  43.5  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  24.73 
 
 		 430 aa  43.5  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  23.22 
 
 		 414 aa  43.5  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  27.94 
 
 		 444 aa  43.5  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  23.66 
 
 		 489 aa  43.1  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  30.71 
 
 		 403 aa  43.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  23.26 
 
 		 421 aa  43.1  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>