88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2291 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2291  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  709    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0761399 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0732  hypothetical protein  67.88 
 
 		 358 aa  495  1e-139  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1933  hypothetical protein  71.23 
 
 		 358 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2063  hypothetical protein  66.47 
 
 		 363 aa  425  1e-118  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0893  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  28.53 
 
 		 393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0783  monooxygenase, FAD-binding  31.39 
 
 		 375 aa  89.4  9e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  22.8 
 
 		 392 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  22.98 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  23.18 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  23.23 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  23.55 
 
 		 386 aa  76.6  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  26.27 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  25.25 
 
 		 384 aa  71.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  27.27 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  26.96 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  22.6 
 
 		 380 aa  67  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  26.4 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  27.34 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  26.47 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  23.1 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  23.23 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  26.44 
 
 		 452 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1405  monooxygenase FAD-binding  32.23 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.144812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1042  geranylgeranyl reductase  25.09 
 
 		 388 aa  56.2  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  26.75 
 
 		 455 aa  54.3  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  22.55 
 
 		 380 aa  54.3  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1401  geranylgeranyl reductase  26 
 
 		 376 aa  54.7  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  26.2 
 
 		 402 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  25 
 
 		 379 aa  53.5  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.55 
 
 		 468 aa  53.1  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  25.62 
 
 		 418 aa  52.8  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1774  FAD dependent oxidoreductase  45.76 
 
 		 369 aa  52.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.496071 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  24.28 
 
 		 457 aa  52  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  22.36 
 
 		 380 aa  51.6  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  33.33 
 
 		 390 aa  51.2  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  24.85 
 
 		 393 aa  51.2  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  24.92 
 
 		 406 aa  50.8  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  24.37 
 
 		 379 aa  50.8  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  21.29 
 
 		 396 aa  49.7  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.54 
 
 		 446 aa  49.7  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  27.67 
 
 		 382 aa  49.3  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  25.57 
 
 		 341 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  21.75 
 
 		 380 aa  49.3  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  50.91 
 
 		 382 aa  48.9  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  25.23 
 
 		 443 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5367  geranylgeranyl reductase  30.88 
 
 		 397 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.707854 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.06 
 
 		 449 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.23 
 
 		 443 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.23 
 
 		 445 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.23 
 
 		 446 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3414  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  26.45 
 
 		 355 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.23 
 
 		 446 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  28.2 
 
 		 413 aa  47  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  68.57 
 
 		 378 aa  47  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  25.51 
 
 		 365 aa  47  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  23.42 
 
 		 381 aa  47  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  28.81 
 
 		 374 aa  46.6  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6424  geranylgeranyl reductase  25.49 
 
 		 403 aa  46.6  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  24.44 
 
 		 405 aa  46.6  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5207  monooxygenase, FAD-binding protein  28.66 
 
 		 379 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00824524  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1099  geranylgeranyl reductase  38.78 
 
 		 435 aa  46.6  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.997696  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  40.54 
 
 		 401 aa  46.6  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  23.53 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  35.94 
 
 		 348 aa  45.8  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  41.54 
 
 		 425 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  29.5 
 
 		 390 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2779  geranylgeranyl reductase  30.67 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  26.09 
 
 		 379 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  29.41 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4237  putative oxidoreductase  22.62 
 
 		 356 aa  43.9  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10918  putative oxidoreductase  28.3 
 
 		 374 aa  44.3  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.183929  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119498  geranylgeranyl reductase  28.74 
 
 		 462 aa  44.3  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  30.12 
 
 		 391 aa  44.3  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4822  geranylgeranyl reductase  33.33 
 
 		 397 aa  43.9  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.0333239 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  26.11 
 
 		 387 aa  43.5  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1166  geranylgeranyl reductase  22.58 
 
 		 385 aa  43.5  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.355185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  34 
 
 		 395 aa  43.9  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  38.89 
 
 		 390 aa  43.9  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1298  geranylgeranyl reductase  27.82 
 
 		 369 aa  43.5  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0362  geranylgeranyl reductase  28.35 
 
 		 436 aa  43.5  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.495463  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1955  hypothetical protein  22.4 
 
 		 405 aa  43.5  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5289  geranylgeranyl reductase  36.19 
 
 		 397 aa  43.1  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.683475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  29.41 
 
 		 368 aa  43.1  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50650  predicted protein  53.66 
 
 		 463 aa  43.1  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  22.59 
 
 		 394 aa  42.7  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3065  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  25.17 
 
 		 571 aa  42.7  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  53.19 
 
 		 440 aa  42.7  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  25.44 
 
 		 394 aa  42.7  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.673829 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>