135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1933 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1933  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  694    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0732  hypothetical protein  69.83 
 
 		 358 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2291  hypothetical protein  71.23 
 
 		 358 aa  495  1e-139  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0761399 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2063  hypothetical protein  66.77 
 
 		 363 aa  423  1e-117  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0893  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  27.01 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0783  monooxygenase, FAD-binding  33.44 
 
 		 375 aa  106  5e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  30.94 
 
 		 386 aa  86.7  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  27.79 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  24.75 
 
 		 392 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  24.52 
 
 		 392 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  25.08 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  25.71 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  24.58 
 
 		 385 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  24.51 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  26.15 
 
 		 378 aa  72.8  0.000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  28.23 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1042  geranylgeranyl reductase  27 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  28.14 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  24.92 
 
 		 418 aa  63.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  27.19 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  26.42 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  25.24 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  29.17 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1774  FAD dependent oxidoreductase  36.17 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.496071 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1401  geranylgeranyl reductase  25.81 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  22.45 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  23.63 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  24.15 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  27.71 
 
 		 365 aa  58.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  26.56 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  25.47 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  29.25 
 
 		 385 aa  57  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  26.07 
 
 		 457 aa  55.8  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  23.51 
 
 		 405 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  25.38 
 
 		 380 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  25.45 
 
 		 380 aa  55.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  26.6 
 
 		 380 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 393 aa  54.3  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  23.73 
 
 		 396 aa  53.9  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119498  geranylgeranyl reductase  25.31 
 
 		 462 aa  52.8  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  23.81 
 
 		 406 aa  52.8  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5367  geranylgeranyl reductase  34.33 
 
 		 397 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.707854 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  25.96 
 
 		 405 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5207  monooxygenase, FAD-binding protein  30.27 
 
 		 379 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00824524  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  41.54 
 
 		 390 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0114  FAD dependent oxidoreductase  22.87 
 
 		 399 aa  50.4  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00154267  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  31.82 
 
 		 406 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  31.82 
 
 		 406 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  25.96 
 
 		 405 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  28.83 
 
 		 348 aa  50.1  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5158  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  40.45 
 
 		 671 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0654699  normal  0.0882409 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  38.85 
 
 		 402 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  29.06 
 
 		 395 aa  49.7  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  24.21 
 
 		 379 aa  49.7  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1166  geranylgeranyl reductase  24.9 
 
 		 385 aa  49.7  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.355185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 400 aa  49.7  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2779  geranylgeranyl reductase  30.77 
 
 		 330 aa  49.3  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  24.06 
 
 		 379 aa  49.7  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0160  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 		 332 aa  49.3  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.358314  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  24.91 
 
 		 416 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.55 
 
 		 446 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  71.43 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10918  putative oxidoreductase  38.78 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.183929  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.77 
 
 		 468 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0399  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 		 357 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0918847  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  44.26 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1854  geranylgeranyl reductase  33.82 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0189229 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  35.05 
 
 		 382 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  42.86 
 
 		 375 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  27.72 
 
 		 415 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  45.1 
 
 		 390 aa  47.8  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1721  geranylgeranyl reductase  28.04 
 
 		 401 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889725  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  28.08 
 
 		 374 aa  47.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  25.48 
 
 		 408 aa  47.4  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  28.65 
 
 		 398 aa  47.4  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  30.7 
 
 		 431 aa  47  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  37.5 
 
 		 387 aa  47  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  30 
 
 		 399 aa  47  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3460  geranylgeranyl reductase  25.67 
 
 		 362 aa  46.6  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  27.72 
 
 		 449 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  53.06 
 
 		 446 aa  46.6  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  26.32 
 
 		 341 aa  46.6  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  53.06 
 
 		 446 aa  46.6  0.0007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  32.99 
 
 		 389 aa  46.6  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  53.06 
 
 		 445 aa  46.2  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50650  predicted protein  58.54 
 
 		 463 aa  46.6  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4237  putative oxidoreductase  24.19 
 
 		 356 aa  46.6  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  53.06 
 
 		 443 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0362  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.495463  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  55.32 
 
 		 430 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2949  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  26.3 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  53.06 
 
 		 443 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  38.96 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0219  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  21.68 
 
 		 355 aa  46.2  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  23.46 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  41.49 
 
 		 384 aa  44.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  27.33 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1304  geranylgeranyl reductase  32.5 
 
 		 400 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  28.02 
 
 		 368 aa  45.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>