41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0893 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0893  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  100 
 
 
393 aa  786    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0732  hypothetical protein  30.22 
 
 
358 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2063  hypothetical protein  29.04 
 
 
363 aa  124  3e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2291  hypothetical protein  28.53 
 
 
358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0761399 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0783  monooxygenase, FAD-binding  28.85 
 
 
375 aa  104  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1933  hypothetical protein  28.86 
 
 
358 aa  101  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  26.25 
 
 
392 aa  86.3  8e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  25.33 
 
 
385 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  26.48 
 
 
386 aa  83.6  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  24.44 
 
 
391 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  25.15 
 
 
378 aa  73.9  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  23.75 
 
 
384 aa  71.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1166  geranylgeranyl reductase  24.71 
 
 
385 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.355185  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1042  geranylgeranyl reductase  25 
 
 
388 aa  70.9  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  22.84 
 
 
382 aa  65.9  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  21.07 
 
 
392 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  23.59 
 
 
379 aa  64.7  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  23.43 
 
 
396 aa  63.5  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  24.13 
 
 
393 aa  62  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  24.01 
 
 
379 aa  61.2  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  22.46 
 
 
386 aa  58.9  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  20.97 
 
 
375 aa  57  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  25 
 
 
399 aa  56.6  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0005  geranylgeranyl reductase  30.17 
 
 
360 aa  53.5  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1401  geranylgeranyl reductase  24.03 
 
 
376 aa  52.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1298  geranylgeranyl reductase  28.07 
 
 
369 aa  51.6  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0399  FAD dependent oxidoreductase  25.35 
 
 
357 aa  50.8  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0918847  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0269  geranylgeranyl reductase  25.38 
 
 
361 aa  50.4  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0349456 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1649  conserved hypothetical protein  27.65 
 
 
290 aa  48.5  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.101073  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10571  oxidoreductase  25.86 
 
 
408 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.649109  normal  0.274108 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  20.5 
 
 
396 aa  47.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0840  monooxygenase FAD-binding  22.49 
 
 
401 aa  47.4  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.634419  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0770  geranylgeranyl reductase  28.08 
 
 
400 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0784  geranylgeranyl reductase  28.08 
 
 
406 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  20.9 
 
 
348 aa  45.8  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3460  geranylgeranyl reductase  21.39 
 
 
362 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0765  geranylgeranyl reductase  27.59 
 
 
406 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  24.18 
 
 
416 aa  43.9  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  22.7 
 
 
361 aa  43.9  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5254  geranylgeranyl reductase  27.08 
 
 
416 aa  43.1  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  21.99 
 
 
402 aa  42.7  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>