More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2295 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2295  putative oxidoreductase  100 
 
 		 412 aa  847    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2969  putative oxidoreductase  59.22 
 
 		 411 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.765819  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1292  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  55.75 
 
 		 398 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3412  putative oxidoreductase  52.31 
 
 		 405 aa  455  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000759974  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0257  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  53.43 
 
 		 413 aa  451  1e-125  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000358585  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2776  putative oxidoreductase  54.63 
 
 		 413 aa  448  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2463  putative oxidoreductase  54.39 
 
 		 413 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  42.52 
 
 		 466 aa  325  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  42.47 
 
 		 476 aa  323  3e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  42.09 
 
 		 464 aa  302  7.000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4566  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.69 
 
 		 438 aa  300  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191225  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  42.06 
 
 		 469 aa  293  5e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0793  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.58 
 
 		 761 aa  291  1e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.272826  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40.42 
 
 		 479 aa  290  3e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  39.15 
 
 		 468 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  39.2 
 
 		 455 aa  286  5.999999999999999e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  40.94 
 
 		 469 aa  285  7e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0617  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.97 
 
 		 466 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.268237  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  41.12 
 
 		 468 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1263  putative oxidoreductase  41.08 
 
 		 468 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00449905  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  41.03 
 
 		 463 aa  282  8.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3501  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40.56 
 
 		 463 aa  282  9e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.860483  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_36  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.7 
 
 		 465 aa  281  2e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.07 
 
 		 464 aa  281  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1463  putative oxidoreductase  40.85 
 
 		 468 aa  280  3e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  39.63 
 
 		 468 aa  279  6e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40.57 
 
 		 457 aa  279  8e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  37.47 
 
 		 465 aa  278  1e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  37.82 
 
 		 465 aa  277  3e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0317  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.49 
 
 		 469 aa  276  5e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000287651  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2781  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.91 
 
 		 497 aa  274  2.0000000000000002e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.662826  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0550  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.86 
 
 		 463 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1282  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  41.63 
 
 		 447 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1138  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.03 
 
 		 458 aa  273  6e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  38.39 
 
 		 470 aa  272  9e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0644  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40.76 
 
 		 474 aa  271  1e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000739676  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  39.54 
 
 		 470 aa  270  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2150  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.65 
 
 		 480 aa  270  5e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0283  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.89 
 
 		 464 aa  269  7e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2002  putative oxidoreductase  37.79 
 
 		 480 aa  269  7e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14117  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1693  putative oxidoreductase  36.13 
 
 		 483 aa  268  8.999999999999999e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0766  putative oxidoreductase  40.19 
 
 		 476 aa  268  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0956688 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.91 
 
 		 476 aa  266  4e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0493  putative oxidoreductase  37.47 
 
 		 477 aa  266  5.999999999999999e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0661627  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0020  putative oxidoreductase  37.67 
 
 		 469 aa  264  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1125  glutamate synthase subunit beta  36.03 
 
 		 469 aa  264  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  39.25 
 
 		 469 aa  264  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0436  putative oxidoreductase  36.83 
 
 		 482 aa  263  6e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1607  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.81 
 
 		 467 aa  263  6e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  37.24 
 
 		 482 aa  262  6.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0537  putative oxidoreductase  37.38 
 
 		 480 aa  262  8.999999999999999e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0021  putative oxidoreductase  37.53 
 
 		 469 aa  261  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2934  putative oxidoreductase  39.62 
 
 		 459 aa  261  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.912851  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1068  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  41.13 
 
 		 461 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000664223  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2796  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  37.3 
 
 		 477 aa  259  6e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  37.59 
 
 		 471 aa  259  7e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1031  glutamate synthase subunit beta  35.42 
 
 		 469 aa  259  9e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.473013  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1112  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  38.97 
 
 		 446 aa  258  2e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1828  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.66 
 
 		 448 aa  257  2e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0167  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.5 
 
 		 465 aa  256  4e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.609581  normal  0.315729 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1117  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38 
 
 		 447 aa  256  6e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0337  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.11 
 
 		 467 aa  256  7e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0313  putative oxidoreductase  38.05 
 
 		 473 aa  255  8e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3635  putative oxidoreductase  37.41 
 
 		 476 aa  255  9e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000713283  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0856  glutamate synthase subunit beta  36.09 
 
 		 472 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1958  glutamate synthase subunit beta  35.25 
 
 		 470 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1220  glutamate synthase subunit beta  36.03 
 
 		 469 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0820  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.03 
 
 		 466 aa  253  4.0000000000000004e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1250  putative oxidoreductase  38.57 
 
 		 476 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2791  glutamate synthase subunit beta  36.53 
 
 		 485 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1900  putative bifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta  39.63 
 
 		 747 aa  252  7e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.22072  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2033  glutamate synthase, small subunit  36 
 
 		 462 aa  252  8.000000000000001e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276272 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2873  glutamate synthase subunit beta  35.19 
 
 		 468 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0110656 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1111  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.41 
 
 		 469 aa  251  1e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3051  glutamate synthase subunit beta  35.19 
 
 		 468 aa  251  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0368167 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1012  glutamate synthase subunit beta  34.64 
 
 		 469 aa  251  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0262  putative oxidoreductase  36.3 
 
 		 462 aa  250  3e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3522  glutamate synthase subunit beta  34.65 
 
 		 472 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3691  glutamate synthase subunit beta  34.65 
 
 		 472 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.752822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0938  putative oxidoreductase  38.11 
 
 		 481 aa  249  6e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3629  glutamate synthase subunit beta  34.65 
 
 		 472 aa  249  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.344291 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3593  glutamate synthase subunit beta  34.65 
 
 		 472 aa  249  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2955  glutamate synthase subunit beta  34.95 
 
 		 468 aa  249  9e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0982485 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4536  glutamate synthase subunit beta  34.19 
 
 		 472 aa  249  9e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1324  glutamate synthase subunit beta  35.42 
 
 		 468 aa  248  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3524  glutamate synthase subunit beta  34.42 
 
 		 472 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3701  glutamate synthase subunit beta  34.11 
 
 		 472 aa  247  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1135  glutamate synthase subunit beta  34.49 
 
 		 468 aa  248  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3509  glutamate synthase subunit beta  34.19 
 
 		 472 aa  247  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03078  glutamate synthase, 4Fe-4S protein, small subunit  34.11 
 
 		 472 aa  247  3e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0487  glutamate synthase subunit beta  34.11 
 
 		 472 aa  247  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03029  hypothetical protein  34.11 
 
 		 472 aa  247  3e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3406  glutamate synthase subunit beta  34.11 
 
 		 472 aa  247  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0494  glutamate synthase, small subunit  34.11 
 
 		 472 aa  246  4e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3557  glutamate synthase subunit beta  34.11 
 
 		 472 aa  246  4e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0391  glutamate synthase subunit beta  35.19 
 
 		 472 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1129  glutamate synthase subunit beta  35.35 
 
 		 472 aa  246  8e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0513615  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0407  putative oxidoreductase  36.66 
 
 		 503 aa  245  9.999999999999999e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0863164  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4948  glutamate synthase subunit beta  34.72 
 
 		 472 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.551106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0465  glutamate synthase subunit beta  35.35 
 
 		 472 aa  245  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000235827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>