More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2969 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2969  putative oxidoreductase  100 
 
 		 411 aa  850    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.765819  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1292  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  57.56 
 
 		 398 aa  505  9.999999999999999e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2295  putative oxidoreductase  59.22 
 
 		 412 aa  492  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3412  putative oxidoreductase  56.83 
 
 		 405 aa  486  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000759974  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2776  putative oxidoreductase  57 
 
 		 413 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2463  putative oxidoreductase  56.72 
 
 		 413 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0257  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  54.17 
 
 		 413 aa  459  9.999999999999999e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000358585  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  41.19 
 
 		 476 aa  319  5e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  40.65 
 
 		 466 aa  319  5e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3501  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  42 
 
 		 463 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.860483  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  40.47 
 
 		 463 aa  301  1e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  39.95 
 
 		 464 aa  301  1e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  39.49 
 
 		 468 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.02 
 
 		 479 aa  296  3e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0793  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.77 
 
 		 761 aa  296  4e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.272826  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1463  putative oxidoreductase  40 
 
 		 468 aa  296  4e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4566  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.53 
 
 		 438 aa  295  7e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191225  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1263  putative oxidoreductase  39.77 
 
 		 468 aa  294  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00449905  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.15 
 
 		 457 aa  292  6e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.06 
 
 		 464 aa  292  8e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0317  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.24 
 
 		 469 aa  290  3e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000287651  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2150  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.79 
 
 		 480 aa  290  3e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  39.34 
 
 		 469 aa  289  7e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  39.58 
 
 		 470 aa  286  4e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0550  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.59 
 
 		 463 aa  286  4e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0617  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.17 
 
 		 466 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.268237  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  38.92 
 
 		 455 aa  282  6.000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_36  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.89 
 
 		 465 aa  282  7.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  37.12 
 
 		 465 aa  281  1e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  36.81 
 
 		 465 aa  280  2e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0644  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.39 
 
 		 474 aa  279  6e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000739676  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  38.34 
 
 		 469 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0766  putative oxidoreductase  39.59 
 
 		 476 aa  277  3e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0956688 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3635  putative oxidoreductase  39.44 
 
 		 476 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000713283  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  37.12 
 
 		 470 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  37.59 
 
 		 468 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  37.35 
 
 		 468 aa  271  1e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0407  putative oxidoreductase  37.35 
 
 		 503 aa  270  4e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0863164  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2781  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.52 
 
 		 497 aa  269  5e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.662826  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0020  putative oxidoreductase  37.53 
 
 		 469 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2934  putative oxidoreductase  39.76 
 
 		 459 aa  269  5.9999999999999995e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.912851  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1250  putative oxidoreductase  39.68 
 
 		 476 aa  268  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0021  putative oxidoreductase  37.3 
 
 		 469 aa  267  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1828  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.66 
 
 		 448 aa  268  2e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  38.08 
 
 		 469 aa  266  4e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  37 
 
 		 471 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  39.49 
 
 		 476 aa  264  2e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2796  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  37.14 
 
 		 477 aa  264  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0938  putative oxidoreductase  38.71 
 
 		 481 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2033  glutamate synthase, small subunit  36.56 
 
 		 462 aa  263  4.999999999999999e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276272 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1282  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.88 
 
 		 447 aa  262  1e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0436  putative oxidoreductase  35.42 
 
 		 482 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1138  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.76 
 
 		 458 aa  259  8e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0167  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.17 
 
 		 465 aa  259  8e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.609581  normal  0.315729 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0313  putative oxidoreductase  37.44 
 
 		 473 aa  259  8e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1112  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  35.71 
 
 		 446 aa  258  1e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0337  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.56 
 
 		 467 aa  256  3e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1607  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.57 
 
 		 467 aa  255  1.0000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  36.15 
 
 		 482 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0283  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.11 
 
 		 464 aa  253  6e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1693  putative oxidoreductase  35.43 
 
 		 483 aa  252  9.000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0493  putative oxidoreductase  35.13 
 
 		 477 aa  251  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0661627  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0820  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.15 
 
 		 466 aa  251  2e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0537  putative oxidoreductase  34.5 
 
 		 480 aa  247  3e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2002  putative oxidoreductase  34.8 
 
 		 480 aa  246  4e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14117  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1068  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.09 
 
 		 461 aa  245  8e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000664223  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1117  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.38 
 
 		 447 aa  244  3e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2977  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  36.03 
 
 		 1011 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.118712  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2885  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  36.49 
 
 		 1011 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2748  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  34.41 
 
 		 1005 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1006  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  36.87 
 
 		 994 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2791  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  35.8 
 
 		 1008 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1984  putative oxidoreductase  37.12 
 
 		 473 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.292785  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1125  glutamate synthase subunit beta  32.49 
 
 		 469 aa  238  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5075  glutamate synthase subunit beta  33.49 
 
 		 472 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4948  glutamate synthase subunit beta  33.49 
 
 		 472 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.551106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5125  glutamate synthase subunit beta  33.49 
 
 		 472 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5121  glutamate synthase, small subunit  33.57 
 
 		 472 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1933  glutamate synthase, small subunit  33.02 
 
 		 469 aa  236  5.0000000000000005e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.889564  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1111  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.05 
 
 		 469 aa  236  6e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0659  putative oxidoreductase  33.64 
 
 		 485 aa  236  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0616  glutamate synthase subunit beta  34.66 
 
 		 472 aa  235  9e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0391  glutamate synthase subunit beta  33.02 
 
 		 472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0658  glutamate synthase beta chain-related oxidoreductase, containing 2Fe-2S and 4Fe-4S clusters  35.39 
 
 		 688 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1129  glutamate synthase subunit beta  32.49 
 
 		 472 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0513615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0529  glutamate synthase subunit beta  32.49 
 
 		 472 aa  234  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0465  glutamate synthase subunit beta  32.49 
 
 		 472 aa  234  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000235827  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0412  glutamate synthase subunit beta  33.33 
 
 		 472 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1900  putative bifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta  36.18 
 
 		 747 aa  233  5e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.22072  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0262  putative oxidoreductase  34.43 
 
 		 462 aa  233  6e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0414  glutamate synthase subunit beta  32.87 
 
 		 472 aa  232  9e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0494  glutamate synthase, small subunit  32.33 
 
 		 472 aa  232  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3557  glutamate synthase subunit beta  32.33 
 
 		 472 aa  232  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0856  glutamate synthase subunit beta  32.64 
 
 		 472 aa  232  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4113  glutamate synthase, small subunit  32.49 
 
 		 473 aa  231  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116897 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3792  glutamate synthase subunit beta  33.02 
 
 		 472 aa  231  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0551  glutamate synthase subunit beta  32.63 
 
 		 472 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592463 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45200  glutamate synthase subunit beta  32.79 
 
 		 473 aa  231  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3509  glutamate synthase subunit beta  32.33 
 
 		 472 aa  231  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4536  glutamate synthase subunit beta  32.33 
 
 		 472 aa  231  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>