More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0257 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0257  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
413 aa  833    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000358585  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2969  putative oxidoreductase  54.17 
 
 
411 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.765819  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1292  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.23 
 
 
398 aa  428  1e-119  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2295  putative oxidoreductase  53.56 
 
 
412 aa  427  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3412  putative oxidoreductase  51.09 
 
 
405 aa  419  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000759974  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2776  putative oxidoreductase  54.07 
 
 
413 aa  418  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2463  putative oxidoreductase  54.32 
 
 
413 aa  420  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4566  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.77 
 
 
438 aa  282  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191225  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  37.73 
 
 
476 aa  278  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  36.94 
 
 
468 aa  260  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.05 
 
 
479 aa  259  8e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.6 
 
 
464 aa  256  5e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  35.73 
 
 
465 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0317  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.92 
 
 
469 aa  252  7e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000287651  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_36  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.27 
 
 
465 aa  252  8.000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  35.09 
 
 
468 aa  251  1e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.27 
 
 
466 aa  251  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  37.3 
 
 
463 aa  250  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  36.85 
 
 
464 aa  250  3e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0550  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.3 
 
 
463 aa  249  7e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  34.86 
 
 
468 aa  248  2e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  33.49 
 
 
465 aa  247  3e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0644  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.97 
 
 
474 aa  246  4e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000739676  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0793  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.82 
 
 
761 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.272826  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0617  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.81 
 
 
466 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.268237  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0337  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.53 
 
 
467 aa  243  3.9999999999999997e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3501  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.08 
 
 
463 aa  242  9e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.860483  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1263  putative oxidoreductase  36.66 
 
 
468 aa  241  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00449905  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1463  putative oxidoreductase  36.66 
 
 
468 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  36.68 
 
 
470 aa  239  9e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3635  putative oxidoreductase  36.87 
 
 
476 aa  238  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000713283  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.51 
 
 
457 aa  238  1e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0283  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.5 
 
 
464 aa  236  5.0000000000000005e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  36.64 
 
 
471 aa  236  7e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2934  putative oxidoreductase  37.97 
 
 
459 aa  233  3e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.912851  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  36.62 
 
 
469 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  36.19 
 
 
469 aa  232  7.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1250  putative oxidoreductase  36.92 
 
 
476 aa  232  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0020  putative oxidoreductase  35.13 
 
 
469 aa  231  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1138  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.56 
 
 
458 aa  229  6e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1828  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.64 
 
 
448 aa  229  6e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2150  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.81 
 
 
480 aa  229  6e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60175  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0766  putative oxidoreductase  35.55 
 
 
476 aa  229  6e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0956688 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  35.29 
 
 
455 aa  229  7e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2885  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  35.23 
 
 
1011 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0021  putative oxidoreductase  34.66 
 
 
469 aa  228  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  35.35 
 
 
469 aa  228  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  35.65 
 
 
470 aa  227  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0407  putative oxidoreductase  34.57 
 
 
503 aa  226  4e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0863164  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0938  putative oxidoreductase  35.02 
 
 
481 aa  227  4e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2977  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  35 
 
 
1011 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.118712  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2791  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  34.77 
 
 
1008 aa  225  9e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2033  glutamate synthase, small subunit  33.49 
 
 
462 aa  224  2e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276272 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.3 
 
 
476 aa  224  2e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1112  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  36.47 
 
 
446 aa  223  4e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1125  glutamate synthase subunit beta  32.45 
 
 
469 aa  223  6e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1607  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.49 
 
 
467 aa  223  6e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2781  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.29 
 
 
497 aa  221  1.9999999999999999e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.662826  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5075  glutamate synthase subunit beta  32.72 
 
 
472 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5125  glutamate synthase subunit beta  32.72 
 
 
472 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4948  glutamate synthase subunit beta  32.72 
 
 
472 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.551106  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0391  glutamate synthase subunit beta  32.49 
 
 
472 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275213  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2002  putative oxidoreductase  32.79 
 
 
480 aa  219  8.999999999999998e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14117  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1006  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  34.94 
 
 
994 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0537  putative oxidoreductase  33.26 
 
 
480 aa  218  2e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0167  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.78 
 
 
465 aa  218  2e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.609581  normal  0.315729 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0313  putative oxidoreductase  33.81 
 
 
473 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0436  putative oxidoreductase  32.63 
 
 
482 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259877  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0414  glutamate synthase subunit beta  32.48 
 
 
472 aa  217  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1012  glutamate synthase subunit beta  31 
 
 
469 aa  216  7e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0856  glutamate synthase subunit beta  30.54 
 
 
472 aa  216  7e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1282  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.76 
 
 
447 aa  216  8e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  32.33 
 
 
482 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0493  putative oxidoreductase  32.08 
 
 
477 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0661627  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1220  glutamate synthase subunit beta  31.48 
 
 
469 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1324  glutamate synthase subunit beta  30.21 
 
 
468 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1693  putative oxidoreductase  32.33 
 
 
483 aa  213  5.999999999999999e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195871  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2955  glutamate synthase subunit beta  29.98 
 
 
468 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0982485 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0820  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.05 
 
 
466 aa  212  7.999999999999999e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2873  glutamate synthase subunit beta  29.74 
 
 
468 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0110656 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2748  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  31.57 
 
 
1005 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036886  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45200  glutamate synthase subunit beta  31.25 
 
 
473 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1221  glutamate synthase subunit beta  29.74 
 
 
468 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0616  glutamate synthase subunit beta  31.87 
 
 
472 aa  211  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1031  glutamate synthase subunit beta  31.4 
 
 
469 aa  211  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.473013  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3051  glutamate synthase subunit beta  29.74 
 
 
468 aa  211  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0368167 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4502  glutamate synthase subunit beta  31.65 
 
 
475 aa  210  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0551  glutamate synthase subunit beta  31.15 
 
 
472 aa  210  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592463 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5121  glutamate synthase, small subunit  31.79 
 
 
472 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1068  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.05 
 
 
461 aa  209  6e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000664223  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2796  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  31.54 
 
 
477 aa  209  6e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144083  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1135  glutamate synthase subunit beta  29.98 
 
 
468 aa  209  7e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1177  glutamate synthase subunit beta  29.74 
 
 
468 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.407199  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3136  glutamate synthase subunit beta  29.51 
 
 
468 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.632002 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1254  glutamate synthase subunit beta  29.51 
 
 
468 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.55842 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0877  glutamate synthase, small subunit  29.25 
 
 
465 aa  207  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.44066  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66560  glutamate synthase subunit beta  31.32 
 
 
477 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0729  glutamate synthase, small subunit  29.25 
 
 
465 aa  207  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0412  glutamate synthase subunit beta  31.55 
 
 
472 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1129  glutamate synthase subunit beta  29.77 
 
 
472 aa  207  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0513615  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>