More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3412 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3412  putative oxidoreductase  100 
 
 		 405 aa  833    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000759974  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2969  putative oxidoreductase  56.83 
 
 		 411 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.765819  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1292  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  53.07 
 
 		 398 aa  441  9.999999999999999e-123  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2295  putative oxidoreductase  52.31 
 
 		 412 aa  429  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0257  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.09 
 
 		 413 aa  419  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000358585  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2776  putative oxidoreductase  51.24 
 
 		 413 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2463  putative oxidoreductase  51.24 
 
 		 413 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  38.22 
 
 		 476 aa  281  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  38.05 
 
 		 466 aa  279  7e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4566  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.71 
 
 		 438 aa  277  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191225  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2033  glutamate synthase, small subunit  37.44 
 
 		 462 aa  272  9e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276272 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  37.88 
 
 		 464 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0793  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.5 
 
 		 761 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.272826  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  38.64 
 
 		 469 aa  268  2e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  37.41 
 
 		 464 aa  264  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0021  putative oxidoreductase  36.36 
 
 		 469 aa  262  8e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  36.24 
 
 		 457 aa  260  3e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0020  putative oxidoreductase  36.13 
 
 		 469 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1463  putative oxidoreductase  36.68 
 
 		 468 aa  257  3e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1263  putative oxidoreductase  36.45 
 
 		 468 aa  256  3e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00449905  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  36.21 
 
 		 465 aa  256  6e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  37.79 
 
 		 463 aa  255  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1828  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.42 
 
 		 448 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.27 
 
 		 479 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3501  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.96 
 
 		 463 aa  253  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.860483  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  34.88 
 
 		 470 aa  253  3e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  35.31 
 
 		 468 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0317  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.12 
 
 		 469 aa  251  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000287651  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  35.58 
 
 		 471 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0550  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35 
 
 		 463 aa  249  6e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_36  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.05 
 
 		 465 aa  249  8e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  34.58 
 
 		 465 aa  248  2e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1117  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.9 
 
 		 447 aa  245  8e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0766  putative oxidoreductase  36.24 
 
 		 476 aa  245  9e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0956688 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1282  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.07 
 
 		 447 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  35.6 
 
 		 455 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0337  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.6 
 
 		 467 aa  243  3e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0283  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.87 
 
 		 464 aa  243  3e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  35.73 
 
 		 469 aa  243  6e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2796  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  34.12 
 
 		 477 aa  241  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2781  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.51 
 
 		 497 aa  241  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.662826  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0617  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.49 
 
 		 466 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.268237  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  34.88 
 
 		 469 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1607  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.26 
 
 		 467 aa  239  4e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  34.19 
 
 		 470 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0313  putative oxidoreductase  36.36 
 
 		 473 aa  238  1e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1250  putative oxidoreductase  37.38 
 
 		 476 aa  238  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2150  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.19 
 
 		 480 aa  238  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0644  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  33.41 
 
 		 474 aa  237  3e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000739676  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1112  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  34.33 
 
 		 446 aa  236  4e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3635  putative oxidoreductase  36.32 
 
 		 476 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000713283  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2934  putative oxidoreductase  36.6 
 
 		 459 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.912851  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  34.33 
 
 		 468 aa  233  5e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  34.63 
 
 		 468 aa  231  2e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0938  putative oxidoreductase  35.25 
 
 		 481 aa  230  4e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0407  putative oxidoreductase  33.72 
 
 		 503 aa  230  4e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0863164  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1138  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.89 
 
 		 458 aa  229  4e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2977  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  33.88 
 
 		 1011 aa  229  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.118712  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2885  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  33.64 
 
 		 1011 aa  229  8e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0616  glutamate synthase subunit beta  33.8 
 
 		 472 aa  228  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0436  putative oxidoreductase  34.02 
 
 		 482 aa  228  1e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2002  putative oxidoreductase  33.49 
 
 		 480 aa  227  2e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14117  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0391  glutamate synthase subunit beta  32.94 
 
 		 472 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0167  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.39 
 
 		 465 aa  226  7e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.609581  normal  0.315729 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5075  glutamate synthase subunit beta  32.48 
 
 		 472 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5125  glutamate synthase subunit beta  32.48 
 
 		 472 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4948  glutamate synthase subunit beta  32.48 
 
 		 472 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.551106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2748  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  31.71 
 
 		 1005 aa  226  7e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2791  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  33.18 
 
 		 1008 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0493  putative oxidoreductase  33.8 
 
 		 477 aa  225  1e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0661627  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5121  glutamate synthase, small subunit  33.1 
 
 		 472 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1693  putative oxidoreductase  32.79 
 
 		 483 aa  223  3e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0537  putative oxidoreductase  33.8 
 
 		 480 aa  223  3e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0412  glutamate synthase subunit beta  32.86 
 
 		 472 aa  223  6e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1031  glutamate synthase subunit beta  33.25 
 
 		 469 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.473013  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0414  glutamate synthase subunit beta  32.39 
 
 		 472 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0820  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  35.06 
 
 		 466 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1958  glutamate synthase subunit beta  33.41 
 
 		 470 aa  221  3e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1220  glutamate synthase subunit beta  33.41 
 
 		 469 aa  220  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2955  glutamate synthase subunit beta  30.86 
 
 		 468 aa  220  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0982485 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.35 
 
 		 476 aa  219  5e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2873  glutamate synthase subunit beta  30.63 
 
 		 468 aa  219  6e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0110656 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3051  glutamate synthase subunit beta  30.63 
 
 		 468 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0368167 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  32.79 
 
 		 482 aa  219  7.999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4113  glutamate synthase, small subunit  32.32 
 
 		 473 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116897 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3019  glutamate synthase subunit beta  32.55 
 
 		 468 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.117975  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1900  putative bifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta  34.39 
 
 		 747 aa  218  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.22072  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1125  glutamate synthase subunit beta  31.64 
 
 		 469 aa  219  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0551  glutamate synthase subunit beta  32.63 
 
 		 472 aa  218  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592463 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1006  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  32.1 
 
 		 994 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0856  glutamate synthase subunit beta  31.87 
 
 		 472 aa  218  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1984  putative oxidoreductase  32.94 
 
 		 473 aa  216  7e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.292785  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2682  glutamate synthase subunit beta  30.86 
 
 		 483 aa  215  9e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.287891 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66560  glutamate synthase subunit beta  32.39 
 
 		 477 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0271  glutamate synthase, small subunit  32.55 
 
 		 467 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0925346 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5772  glutamate synthase subunit beta  32.16 
 
 		 477 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45200  glutamate synthase subunit beta  30.91 
 
 		 473 aa  213  5.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1068  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  34.74 
 
 		 461 aa  212  7.999999999999999e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000664223  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1324  glutamate synthase subunit beta  30.16 
 
 		 468 aa  212  9e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1012  glutamate synthase subunit beta  30.95 
 
 		 469 aa  211  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>