More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_07230 on replicon BN001304
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001304  ANIA_07230  cellobiose dehydrogenase (AFU_orthologue; AFUA_2G17620)  100 
 
 
780 aa  1601    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.267409  normal  0.372324 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10488  hypothetical protein  43.72 
 
 
233 aa  164  8.000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0045277  normal  0.353466 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2838  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.72 
 
 
555 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4961  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.07 
 
 
529 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1255  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.05 
 
 
535 aa  134  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000162528 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2190  choline dehydrogenase, a flavoprotein  26.66 
 
 
541 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1507  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.45 
 
 
548 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.23617  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6322  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.35 
 
 
556 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4081  choline dehydrogenase  28.36 
 
 
560 aa  126  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6980  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.82 
 
 
556 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0315325  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0102  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.28 
 
 
518 aa  126  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3595  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.16 
 
 
549 aa  126  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0317  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.87 
 
 
511 aa  125  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1949  GMC family oxidoreductase  26.5 
 
 
550 aa  124  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0586145  unclonable  0.000000512241 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3144  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.29 
 
 
521 aa  124  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5319  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.24 
 
 
533 aa  124  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0918272  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.27 
 
 
536 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10850  putative dehydrogenase  27.18 
 
 
559 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000202363  normal  0.801894 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4657  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.43 
 
 
537 aa  122  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02642  choline dehydrogenase  27.65 
 
 
552 aa  121  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0996  alcohol dehydrogenase  27.35 
 
 
559 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4942  choline dehydrogenase  27.3 
 
 
520 aa  121  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.953244  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0758  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.65 
 
 
523 aa  121  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.245711  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1383  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.2 
 
 
551 aa  120  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00471975  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0877  choline dehydrogenase  26.39 
 
 
545 aa  120  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.988222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5026  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.89 
 
 
533 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0437  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.49 
 
 
532 aa  120  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.253187  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0194  GMC family oxidoreductase  26.6 
 
 
548 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1993  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.52 
 
 
553 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.689295 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2378  Choline dehydrogenase  26.08 
 
 
551 aa  120  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.448643  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3136  choline dehydrogenase  25.65 
 
 
531 aa  120  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4938  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.89 
 
 
533 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1487  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.54 
 
 
551 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.354481  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4183  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.3 
 
 
557 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000160741 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2450  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.23 
 
 
554 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.389651  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7343  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.93 
 
 
546 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381853  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3754  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.58 
 
 
552 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1031  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.37 
 
 
539 aa  119  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6820  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.61 
 
 
602 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1098  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.26 
 
 
529 aa  118  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3434  GMC family oxidoreductase  26.54 
 
 
539 aa  117  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2042  L-sorbose dehydrogenase, FAD dependent, putative  26.3 
 
 
544 aa  117  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0700873  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2223  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.14 
 
 
531 aa  117  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.487572  normal  0.417914 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2587  choline dehydrogenase  25.9 
 
 
556 aa  117  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.676646  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3164  choline dehydrogenase  26.13 
 
 
551 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.637341  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3929  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.89 
 
 
528 aa  117  8.999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7146  Choline dehydrogenase  26.2 
 
 
514 aa  117  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0527106 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3197  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.6 
 
 
547 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130434  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3840  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.29 
 
 
544 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397758  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2072  choline dehydrogenase  27.42 
 
 
562 aa  116  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1946  choline dehydrogenase  26.76 
 
 
560 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1846  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.83 
 
 
547 aa  116  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.845154 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0884  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.3 
 
 
553 aa  115  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.275807  normal  0.461656 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.57 
 
 
563 aa  115  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0279119  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01429  choline oxidase (CodA), putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04090)  28.62 
 
 
542 aa  115  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.262126 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1119  choline dehydrogenase  26.68 
 
 
564 aa  115  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4708  Choline dehydrogenase  25.91 
 
 
513 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1300  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.91 
 
 
478 aa  115  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0965776 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16390  putative GMC-type oxidoreductase  27.11 
 
 
557 aa  114  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0804  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.43 
 
 
540 aa  114  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.271201  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1614  glucose-methanol-choline oxidoreductase:GMC oxidoreductase  26.8 
 
 
547 aa  114  7.000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5650  Choline dehydrogenase  26.87 
 
 
559 aa  114  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3680  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.12 
 
 
537 aa  114  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.979094 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0530  choline dehydrogenase  26.31 
 
 
570 aa  114  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6272  putative choline (or alcohol) dehydrogenase  26.33 
 
 
544 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4030  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.46 
 
 
534 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159836  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01161  hypothetical alcohol dehydrogenase  27.05 
 
 
550 aa  113  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4810  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.34 
 
 
534 aa  112  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37100  putative dehydrogenase  25.17 
 
 
545 aa  112  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0054  GMC oxidoreductase  25.09 
 
 
556 aa  112  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.810146  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3579  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.33 
 
 
539 aa  112  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000745521  normal  0.65455 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6326  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.91 
 
 
554 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4709  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.75 
 
 
527 aa  112  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1543  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.02 
 
 
530 aa  111  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1007  choline dehydrogenase  25.13 
 
 
565 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0130  choline dehydrogenase  26.52 
 
 
547 aa  112  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000105235  normal  0.777409 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2644  choline dehydrogenase  25.44 
 
 
574 aa  111  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3131  normal  0.995844 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1426  putative GMC-type oxidoreductase  26.63 
 
 
557 aa  111  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5015  choline dehydrogenase, a flavoprotein  25.72 
 
 
557 aa  110  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00654928  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4278  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.67 
 
 
546 aa  110  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.942105  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5406  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.09 
 
 
525 aa  110  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.702828  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2458  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.51 
 
 
554 aa  110  8.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.144677  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3708  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.84 
 
 
543 aa  110  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0366  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.21 
 
 
531 aa  110  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.136332  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3611  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.61 
 
 
534 aa  110  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2716  putative GMC oxidoreductase  26.94 
 
 
562 aa  110  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1199  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.93 
 
 
530 aa  110  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1351  choline dehydrogenase  26.33 
 
 
561 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.875987  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3020  choline dehydrogenase  26.24 
 
 
553 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0228  GMC family oxidoreductase  27.29 
 
 
547 aa  109  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3275  GMC family oxidoreductase  27.29 
 
 
547 aa  109  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.183424  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0323  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.48 
 
 
562 aa  109  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.518363  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0216  GMC family oxidoreductase  27.29 
 
 
547 aa  109  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0487725  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2148  GMC family oxidoreductase  27.41 
 
 
613 aa  109  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3406  GMC family oxidoreductase  27.29 
 
 
547 aa  109  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0572  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.25 
 
 
531 aa  109  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0931268  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1315  choline dehydrogenase  26.33 
 
 
561 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3035  choline dehydrogenase  26.33 
 
 
561 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.82163  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1325  choline dehydrogenase  26.33 
 
 
561 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2941  GMC family oxidoreductase  27.29 
 
 
547 aa  109  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.44858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>