More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6322 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6322  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 		 556 aa  1141    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1098  glucose-methanol-choline oxidoreductase  70.11 
 
 		 529 aa  780    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1507  glucose-methanol-choline oxidoreductase  99.82 
 
 		 548 aa  1122    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.23617  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6980  glucose-methanol-choline oxidoreductase  98.74 
 
 		 556 aa  1129    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0315325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4183  glucose-methanol-choline oxidoreductase  53.96 
 
 		 557 aa  548  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000160741 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0884  glucose-methanol-choline oxidoreductase  52.65 
 
 		 553 aa  539  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.275807  normal  0.461656 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2223  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.4 
 
 		 531 aa  506  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.487572  normal  0.417914 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2378  Choline dehydrogenase  47.84 
 
 		 551 aa  489  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.448643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3164  choline dehydrogenase  47.18 
 
 		 551 aa  482  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.637341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4657  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.68 
 
 		 537 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1487  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.77 
 
 		 551 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.354481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1383  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.77 
 
 		 551 aa  475  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00471975  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2042  L-sorbose dehydrogenase, FAD dependent, putative  46.79 
 
 		 544 aa  472  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0700873  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0877  choline dehydrogenase  47.36 
 
 		 545 aa  474  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.988222  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3579  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.11 
 
 		 539 aa  466  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000745521  normal  0.65455 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3929  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.87 
 
 		 528 aa  459  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2190  choline dehydrogenase, a flavoprotein  44.09 
 
 		 541 aa  440  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2450  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.55 
 
 		 554 aa  423  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.389651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4282  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.94 
 
 		 541 aa  425  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0936618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10850  putative dehydrogenase  42.96 
 
 		 559 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000202363  normal  0.801894 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4519  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.3 
 
 		 542 aa  425  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0149458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2890  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.05 
 
 		 534 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.561362  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0996  alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 		 559 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2644  choline dehydrogenase  41.23 
 
 		 574 aa  413  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3131  normal  0.995844 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0804  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.96 
 
 		 540 aa  412  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.271201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3717  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.46 
 
 		 531 aa  412  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.975922 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3840  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.05 
 
 		 544 aa  409  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397758  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0061  GMC oxidoreductase  43.96 
 
 		 556 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0278  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase family protein  43.96 
 
 		 556 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914416  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6778  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.75 
 
 		 539 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0054  GMC oxidoreductase  43.06 
 
 		 556 aa  412  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.810146  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3836  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.05 
 
 		 552 aa  412  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0437  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.65 
 
 		 532 aa  411  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.253187  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0477  Choline dehydrogenase  44.28 
 
 		 531 aa  410  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3754  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.01 
 
 		 552 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0062  GMC oxidoreductase  43.96 
 
 		 556 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4961  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.08 
 
 		 529 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3680  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.86 
 
 		 537 aa  408  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.979094 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0572  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.01 
 
 		 531 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0931268  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.53 
 
 		 563 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0279119  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1199  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.52 
 
 		 530 aa  405  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.4 
 
 		 536 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4810  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.29 
 
 		 534 aa  404  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1348  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.1 
 
 		 555 aa  404  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2604  choline dehydrogenase  42.22 
 
 		 562 aa  405  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142768 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5443  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.62 
 
 		 542 aa  399  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4456  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.16 
 
 		 531 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.691807  normal  0.0210476 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3294  GMC oxidoreductase  43.41 
 
 		 549 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.38455  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2659  GMC oxidoreductase  43.41 
 
 		 549 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1833  GMC oxidoreductase  43.41 
 
 		 549 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2719  GMC oxidoreductase  43.41 
 
 		 549 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.972032  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4459  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.98 
 
 		 560 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0573714  hitchhiker  0.00237498 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0698  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.27 
 
 		 551 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.763915  decreased coverage  0.00316946 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2716  putative GMC oxidoreductase  42.78 
 
 		 562 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0562  choline dehydrogenase  43.23 
 
 		 549 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.55111 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6221  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.09 
 
 		 551 aa  395  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.768834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2005  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.65 
 
 		 551 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4377  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.17 
 
 		 551 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3910  Choline dehydrogenase  42.09 
 
 		 531 aa  393  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5947  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.09 
 
 		 550 aa  393  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6015  choline dehydrogenase  40.82 
 
 		 570 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386009  normal  0.639563 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0889  choline dehydrogenase  42.8 
 
 		 549 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2781  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.78 
 
 		 538 aa  395  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0926901  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5650  Choline dehydrogenase  43.98 
 
 		 559 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4211  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.96 
 
 		 559 aa  392  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3919  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.98 
 
 		 572 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.326511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2513  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.46 
 
 		 571 aa  391  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0138495  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0331  GMC oxidoreductase  42.75 
 
 		 557 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4277  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.86 
 
 		 553 aa  392  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.968608 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3099  choline dehydrogenase  40.67 
 
 		 562 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3708  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.77 
 
 		 543 aa  389  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3611  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.63 
 
 		 534 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1213  putative alcohol dehydrogenase (acceptor)  42.21 
 
 		 534 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1993  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.89 
 
 		 553 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.689295 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4865  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.65 
 
 		 539 aa  388  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.69396  normal  0.438414 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3144  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.8 
 
 		 521 aa  389  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.88 
 
 		 541 aa  386  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0882717  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5304  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.68 
 
 		 546 aa  385  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3601  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.27 
 
 		 572 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3292  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.05 
 
 		 533 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6848  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.28 
 
 		 556 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.90225 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3245  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.04 
 
 		 541 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4528  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.18 
 
 		 550 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.167866 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3792  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.83 
 
 		 535 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4024  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.05 
 
 		 533 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5337  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.65 
 
 		 600 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.231686 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5015  choline dehydrogenase, a flavoprotein  41.91 
 
 		 557 aa  385  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00654928  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3506  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.46 
 
 		 575 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145411  normal  0.0815254 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1882  choline dehydrogenase  42.38 
 
 		 551 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0776  choline dehydrogenase  41.64 
 
 		 549 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0802775 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2310  choline dehydrogenase  43.01 
 
 		 548 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.568209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3680  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.21 
 
 		 534 aa  379  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3434  GMC family oxidoreductase  37.96 
 
 		 539 aa  380  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6126  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.98 
 
 		 569 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.939433 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4942  choline dehydrogenase  42.62 
 
 		 520 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.953244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6414  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.8 
 
 		 569 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.981458 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1614  glucose-methanol-choline oxidoreductase:GMC oxidoreductase  41.04 
 
 		 547 aa  378  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0102  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.3 
 
 		 518 aa  376  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5162  Choline dehydrogenase  40.49 
 
 		 541 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0769143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1635  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.2 
 
 		 534 aa  378  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.643208  normal  0.915824 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>