More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR2042 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR2042  L-sorbose dehydrogenase, FAD dependent, putative  100 
 
 		 544 aa  1122    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0700873  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1487  glucose-methanol-choline oxidoreductase  83.36 
 
 		 551 aa  951    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.354481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3164  choline dehydrogenase  83.55 
 
 		 551 aa  953    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.637341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2378  Choline dehydrogenase  73.38 
 
 		 551 aa  818    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.448643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0877  choline dehydrogenase  92.27 
 
 		 545 aa  1049    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.988222  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3929  glucose-methanol-choline oxidoreductase  61.54 
 
 		 528 aa  659    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1383  glucose-methanol-choline oxidoreductase  83.55 
 
 		 551 aa  951    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00471975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3579  glucose-methanol-choline oxidoreductase  66.42 
 
 		 539 aa  730    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000745521  normal  0.65455 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4183  glucose-methanol-choline oxidoreductase  53.45 
 
 		 557 aa  546  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000160741 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2223  glucose-methanol-choline oxidoreductase  52.19 
 
 		 531 aa  547  1e-154  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.487572  normal  0.417914 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0884  glucose-methanol-choline oxidoreductase  52.81 
 
 		 553 aa  533  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.275807  normal  0.461656 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1098  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.2 
 
 		 529 aa  489  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4657  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.04 
 
 		 537 aa  481  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6980  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.98 
 
 		 556 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0315325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6322  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.79 
 
 		 556 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1507  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.79 
 
 		 548 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.23617  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2644  choline dehydrogenase  45.01 
 
 		 574 aa  446  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3131  normal  0.995844 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2190  choline dehydrogenase, a flavoprotein  45.63 
 
 		 541 aa  445  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2781  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.45 
 
 		 538 aa  437  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0926901  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2450  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.3 
 
 		 554 aa  435  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.389651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4961  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.17 
 
 		 529 aa  430  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3910  Choline dehydrogenase  46.24 
 
 		 531 aa  428  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.96 
 
 		 563 aa  424  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0279119  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01161  hypothetical alcohol dehydrogenase  42.8 
 
 		 550 aa  422  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6015  choline dehydrogenase  44.47 
 
 		 570 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386009  normal  0.639563 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0054  GMC oxidoreductase  44.57 
 
 		 556 aa  423  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.810146  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0804  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.32 
 
 		 540 aa  423  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.271201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3680  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.33 
 
 		 537 aa  425  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.979094 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.81 
 
 		 536 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0437  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.96 
 
 		 532 aa  421  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.253187  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1199  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.21 
 
 		 530 aa  420  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3099  choline dehydrogenase  43.64 
 
 		 562 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6778  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.47 
 
 		 539 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4810  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.4 
 
 		 534 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0061  GMC oxidoreductase  43.81 
 
 		 556 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0278  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase family protein  43.81 
 
 		 556 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914416  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0062  GMC oxidoreductase  43.81 
 
 		 556 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4278  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.4 
 
 		 546 aa  414  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.942105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.03 
 
 		 541 aa  412  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0882717  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3651  choline dehydrogenase  45.64 
 
 		 553 aa  414  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2604  choline dehydrogenase  42.52 
 
 		 562 aa  413  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142768 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0991  choline dehydrogenase  43.25 
 
 		 552 aa  409  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0436021  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5443  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.86 
 
 		 542 aa  411  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3708  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.17 
 
 		 543 aa  409  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1213  putative alcohol dehydrogenase (acceptor)  44.13 
 
 		 534 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1833  GMC oxidoreductase  43.62 
 
 		 549 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2659  GMC oxidoreductase  43.62 
 
 		 549 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2719  GMC oxidoreductase  43.62 
 
 		 549 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.972032  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4282  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.5 
 
 		 541 aa  408  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0936618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3294  GMC oxidoreductase  43.62 
 
 		 549 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.38455  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0557  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.77 
 
 		 535 aa  405  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1614  glucose-methanol-choline oxidoreductase:GMC oxidoreductase  43.07 
 
 		 547 aa  405  1e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3840  choline dehydrogenase  41.76 
 
 		 561 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0331  GMC oxidoreductase  44.07 
 
 		 557 aa  405  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0572  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.81 
 
 		 531 aa  404  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0931268  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3792  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.23 
 
 		 535 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4456  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.47 
 
 		 531 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.691807  normal  0.0210476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3836  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.23 
 
 		 552 aa  402  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4010  choline dehydrogenase  40.04 
 
 		 561 aa  400  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0405578  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3744  choline dehydrogenase  44.4 
 
 		 554 aa  400  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0339169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2869  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.18 
 
 		 531 aa  400  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3680  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.05 
 
 		 534 aa  399  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1846  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.88 
 
 		 547 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.845154 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2890  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.32 
 
 		 534 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.561362  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0477  Choline dehydrogenase  42.21 
 
 		 531 aa  395  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5947  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.69 
 
 		 550 aa  397  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4519  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.75 
 
 		 542 aa  397  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0149458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5650  Choline dehydrogenase  42.29 
 
 		 559 aa  395  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4865  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.21 
 
 		 539 aa  398  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.69396  normal  0.438414 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3717  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.21 
 
 		 531 aa  395  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.975922 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0075  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.56 
 
 		 548 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0217236  hitchhiker  0.000000000166725 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1119  choline dehydrogenase  39.82 
 
 		 564 aa  394  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0102  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.59 
 
 		 518 aa  393  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4186  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.68 
 
 		 546 aa  394  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.296115 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5304  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.55 
 
 		 546 aa  393  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0072  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.18 
 
 		 548 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000289824 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8399  choline dehydrogenase  44.03 
 
 		 574 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.553301  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5015  choline dehydrogenase, a flavoprotein  43.73 
 
 		 557 aa  395  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00654928  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1348  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.12 
 
 		 555 aa  392  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3136  choline dehydrogenase  42.21 
 
 		 531 aa  394  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10850  putative dehydrogenase  42.39 
 
 		 559 aa  395  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000202363  normal  0.801894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0056  GMC family oxidoreductase  41.98 
 
 		 550 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000620913 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4211  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.75 
 
 		 559 aa  389  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0203  glucose-methanol-choline oxidoreductase:GMC oxidoreductase  43.81 
 
 		 559 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0072  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.98 
 
 		 548 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.010293  normal  0.0125106 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0996  alcohol dehydrogenase  42.54 
 
 		 559 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2587  choline dehydrogenase  40.53 
 
 		 556 aa  389  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.676646  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3754  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.39 
 
 		 552 aa  391  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0100  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.26 
 
 		 561 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3611  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.98 
 
 		 534 aa  388  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3226  choline dehydrogenase  41.32 
 
 		 556 aa  385  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.191345 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0084  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.89 
 
 		 561 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3372  glucose-methanol-choline oxidoreductase:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  41.75 
 
 		 539 aa  386  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02642  choline dehydrogenase  40.68 
 
 		 552 aa  386  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1196  choline dehydrogenase  40.04 
 
 		 565 aa  386  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000414657 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.51 
 
 		 577 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.713026  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0698  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.73 
 
 		 551 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.763915  decreased coverage  0.00316946 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2973  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.08 
 
 		 578 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1007  choline dehydrogenase  40.63 
 
 		 565 aa  387  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0082  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.08 
 
 		 578 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>