More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3708 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3708  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 		 543 aa  1123    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3680  glucose-methanol-choline oxidoreductase  52.2 
 
 		 534 aa  548  1e-154  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2644  choline dehydrogenase  47.96 
 
 		 574 aa  525  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3131  normal  0.995844 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1543  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.76 
 
 		 530 aa  494  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2587  choline dehydrogenase  46.36 
 
 		 556 aa  489  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.676646  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0553  choline dehydrogenase  46.18 
 
 		 549 aa  483  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.93918  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3099  choline dehydrogenase  48.95 
 
 		 562 aa  485  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3226  choline dehydrogenase  47.52 
 
 		 556 aa  483  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.191345 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3744  choline dehydrogenase  48.24 
 
 		 554 aa  483  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0339169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0991  choline dehydrogenase  48.66 
 
 		 552 aa  483  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0436021  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0554  choline dehydrogenase  46.37 
 
 		 549 aa  484  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2709  choline dehydrogenase  45.62 
 
 		 549 aa  481  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3035  choline dehydrogenase  47.71 
 
 		 561 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.82163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1325  choline dehydrogenase  47.71 
 
 		 561 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1315  choline dehydrogenase  47.71 
 
 		 561 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5304  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.48 
 
 		 546 aa  476  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1351  choline dehydrogenase  47.71 
 
 		 561 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.875987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2310  choline dehydrogenase  47.63 
 
 		 548 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.568209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2184  choline dehydrogenase  47.73 
 
 		 548 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4081  choline dehydrogenase  46.04 
 
 		 560 aa  474  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2190  choline dehydrogenase, a flavoprotein  46.37 
 
 		 541 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1515  choline dehydrogenase  47.54 
 
 		 555 aa  469  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.307618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0856  choline dehydrogenase  47.35 
 
 		 548 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1119  choline dehydrogenase  46.37 
 
 		 564 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0715  choline dehydrogenase  45.81 
 
 		 572 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00120252  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1334  choline dehydrogenase  46.17 
 
 		 560 aa  467  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3754  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.91 
 
 		 552 aa  466  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1946  choline dehydrogenase  45.7 
 
 		 560 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1007  choline dehydrogenase  46.5 
 
 		 565 aa  462  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2554  choline dehydrogenase  45.84 
 
 		 559 aa  464  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0102453  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2890  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.14 
 
 		 534 aa  465  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.561362  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3840  choline dehydrogenase  46.17 
 
 		 561 aa  464  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1196  choline dehydrogenase  45.83 
 
 		 565 aa  464  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000414657 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1882  choline dehydrogenase  46.5 
 
 		 551 aa  464  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2072  choline dehydrogenase  45.99 
 
 		 562 aa  462  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0804  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.2 
 
 		 540 aa  459  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.271201  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5064  choline dehydrogenase  46.1 
 
 		 565 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4937  choline dehydrogenase  46.28 
 
 		 565 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0401  choline dehydrogenase  47.07 
 
 		 563 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.726855 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02642  choline dehydrogenase  45.05 
 
 		 552 aa  460  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3651  choline dehydrogenase  47.64 
 
 		 553 aa  459  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0562  choline dehydrogenase  44.88 
 
 		 549 aa  461  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.55111 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.06 
 
 		 541 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0882717  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01161  hypothetical alcohol dehydrogenase  46.78 
 
 		 550 aa  461  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5443  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.64 
 
 		 542 aa  461  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1896  choline dehydrogenase  47.81 
 
 		 550 aa  462  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0481  choline dehydrogenase  46.13 
 
 		 565 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5115  choline dehydrogenase  46.46 
 
 		 565 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179508  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4010  choline dehydrogenase  45.47 
 
 		 561 aa  458  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0405578  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2831  choline dehydrogenase  47.16 
 
 		 567 aa  458  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0776  choline dehydrogenase  44.51 
 
 		 549 aa  458  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0802775 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2917  choline dehydrogenase  47.16 
 
 		 567 aa  458  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.80885  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2781  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.21 
 
 		 538 aa  456  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0926901  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2604  choline dehydrogenase  46.18 
 
 		 562 aa  458  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142768 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1348  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.26 
 
 		 555 aa  453  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.25 
 
 		 563 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0279119  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5244  choline dehydrogenase  45.02 
 
 		 567 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80037  normal  0.0658003 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1199  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.11 
 
 		 530 aa  452  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0889  choline dehydrogenase  44.32 
 
 		 549 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06179  choline dehydrogenase  43.68 
 
 		 569 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000364  choline dehydrogenase  44.01 
 
 		 571 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1492  choline dehydrogenase  46.4 
 
 		 556 aa  449  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3680  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.15 
 
 		 537 aa  450  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.979094 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70940  choline dehydrogenase  45.57 
 
 		 561 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.512014 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00267  choline dehydrogenase  45.27 
 
 		 556 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3295  choline dehydrogenase  45.45 
 
 		 556 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0370  choline dehydrogenase  45.45 
 
 		 556 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0326  choline dehydrogenase  45.45 
 
 		 556 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8399  choline dehydrogenase  46.49 
 
 		 574 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.553301  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00270  hypothetical protein  45.27 
 
 		 556 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6157  choline dehydrogenase  45.39 
 
 		 561 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.103614  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3312  choline dehydrogenase  45.45 
 
 		 556 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0373  choline dehydrogenase  45.27 
 
 		 562 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.868243  normal  0.338212 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4716  choline dehydrogenase  46.3 
 
 		 561 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.959774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0437  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.65 
 
 		 532 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.253187  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0443  choline dehydrogenase  44.75 
 
 		 568 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.300865  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4732  choline dehydrogenase  44.75 
 
 		 568 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5058  choline dehydrogenase  45.72 
 
 		 561 aa  444  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0575159 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5650  Choline dehydrogenase  45.75 
 
 		 559 aa  442  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3536  choline dehydrogenase  44.71 
 
 		 566 aa  443  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4519  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.78 
 
 		 542 aa  439  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0149458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4961  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.42 
 
 		 529 aa  441  9.999999999999999e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1144  choline dehydrogenase  44.38 
 
 		 551 aa  439  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0553  choline dehydrogenase  44.78 
 
 		 566 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1592  choline dehydrogenase  45.54 
 
 		 561 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.860333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3310  choline dehydrogenase  45.09 
 
 		 572 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.903723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0996  alcohol dehydrogenase  43.87 
 
 		 559 aa  435  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4810  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.56 
 
 		 534 aa  438  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0377  choline dehydrogenase  44.61 
 
 		 565 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.119078  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0342  choline dehydrogenase  44.89 
 
 		 562 aa  438  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1832  choline dehydrogenase  45.83 
 
 		 560 aa  438  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.287087  normal  0.448798 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5100  choline dehydrogenase  44.59 
 
 		 566 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3268  choline dehydrogenase  44.59 
 
 		 566 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.121076  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5182  choline dehydrogenase  44.59 
 
 		 566 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.222705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4512  choline dehydrogenase  44.78 
 
 		 566 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.422466 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5037  choline dehydrogenase  44.78 
 
 		 566 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10850  putative dehydrogenase  43.87 
 
 		 559 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000202363  normal  0.801894 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0102  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.83 
 
 		 518 aa  433  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1837  choline dehydrogenase  44.59 
 
 		 565 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0179  choline dehydrogenase  44.61 
 
 		 565 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>