More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5443 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  68.16 
 
 
563 aa  749    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0279119  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5443  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 
542 aa  1105    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078996  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0437  glucose-methanol-choline oxidoreductase  66.92 
 
 
532 aa  738    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.253187  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5304  glucose-methanol-choline oxidoreductase  54.34 
 
 
546 aa  588  1e-167  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  55.32 
 
 
541 aa  585  1e-166  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0882717  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01161  hypothetical alcohol dehydrogenase  52.65 
 
 
550 aa  555  1e-157  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2781  glucose-methanol-choline oxidoreductase  51.61 
 
 
538 aa  542  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0926901  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2644  choline dehydrogenase  50.47 
 
 
574 aa  532  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3131  normal  0.995844 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0572  glucose-methanol-choline oxidoreductase  51.8 
 
 
531 aa  525  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0931268  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1199  glucose-methanol-choline oxidoreductase  51.42 
 
 
530 aa  522  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3717  glucose-methanol-choline oxidoreductase  52.94 
 
 
531 aa  523  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.975922 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0477  Choline dehydrogenase  52.94 
 
 
531 aa  524  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0203  glucose-methanol-choline oxidoreductase:GMC oxidoreductase  51.2 
 
 
559 aa  514  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6778  glucose-methanol-choline oxidoreductase  49.26 
 
 
539 aa  514  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485614  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4459  glucose-methanol-choline oxidoreductase  49.81 
 
 
560 aa  512  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0573714  hitchhiker  0.00237498 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0174  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50.38 
 
 
552 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1213  putative alcohol dehydrogenase (acceptor)  49.62 
 
 
534 aa  503  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6848  glucose-methanol-choline oxidoreductase  49.62 
 
 
556 aa  504  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.90225 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0194  GMC family oxidoreductase  50.47 
 
 
548 aa  503  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4282  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.87 
 
 
541 aa  499  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0936618  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3792  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.22 
 
 
535 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5414  choline dehydrogenase, a flavoprotein  49.91 
 
 
534 aa  498  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.269281 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3067  glucose-methanol-choline oxidoreductase  51.03 
 
 
546 aa  501  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.766547 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3762  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50 
 
 
552 aa  500  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3836  glucose-methanol-choline oxidoreductase  51.03 
 
 
552 aa  496  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  51.08 
 
 
534 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.917916  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3089  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50.66 
 
 
546 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.203231  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3637  glucose-methanol-choline oxidoreductase  49.09 
 
 
576 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67419  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2981  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50.19 
 
 
546 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3313  glucose-methanol-choline oxidoreductase  49.02 
 
 
576 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1502  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50.59 
 
 
535 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5015  choline dehydrogenase, a flavoprotein  49.72 
 
 
557 aa  494  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00654928  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1882  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50.1 
 
 
534 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5337  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.71 
 
 
600 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.231686 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3070  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50.47 
 
 
546 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.606173  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3919  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.15 
 
 
572 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.326511  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5947  glucose-methanol-choline oxidoreductase  49.91 
 
 
550 aa  489  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2513  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.78 
 
 
571 aa  491  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0138495  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4186  glucose-methanol-choline oxidoreductase  49.16 
 
 
546 aa  490  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.296115 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2456  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50.47 
 
 
546 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101134  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3115  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50.19 
 
 
546 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0123  putative alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  47.94 
 
 
574 aa  486  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0996  alcohol dehydrogenase  48.45 
 
 
559 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6419  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50.28 
 
 
546 aa  488  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3506  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.34 
 
 
575 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145411  normal  0.0815254 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3601  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.96 
 
 
572 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407231  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2148  GMC family oxidoreductase  49.91 
 
 
613 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3275  GMC family oxidoreductase  49.91 
 
 
547 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.183424  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0411  GMC family oxidoreductase  49.91 
 
 
547 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0228  GMC family oxidoreductase  49.91 
 
 
547 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4961  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.48 
 
 
529 aa  484  1e-135  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3744  choline dehydrogenase  48.6 
 
 
554 aa  483  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0339169  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0216  GMC family oxidoreductase  49.91 
 
 
547 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0487725  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2716  putative GMC oxidoreductase  47.35 
 
 
562 aa  482  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2941  GMC family oxidoreductase  49.91 
 
 
547 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.44858  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3406  GMC family oxidoreductase  49.91 
 
 
547 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10850  putative dehydrogenase  48.69 
 
 
559 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000202363  normal  0.801894 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2190  choline dehydrogenase, a flavoprotein  47.82 
 
 
541 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1614  glucose-methanol-choline oxidoreductase:GMC oxidoreductase  48.69 
 
 
547 aa  476  1e-133  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0054  GMC oxidoreductase  50.19 
 
 
556 aa  478  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.810146  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4749  glucose-methanol-choline oxidoreductase:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  47.22 
 
 
546 aa  473  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769541  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1846  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.5 
 
 
547 aa  470  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.845154 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0159  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.85 
 
 
560 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0062  GMC oxidoreductase  48.67 
 
 
556 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0278  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase family protein  48.67 
 
 
556 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914416  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1348  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.91 
 
 
555 aa  468  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0061  GMC oxidoreductase  48.67 
 
 
556 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4657  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.01 
 
 
537 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4456  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.31 
 
 
531 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.691807  normal  0.0210476 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0084  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.01 
 
 
561 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3651  choline dehydrogenase  48.05 
 
 
553 aa  464  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0100  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.43 
 
 
561 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1635  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.15 
 
 
534 aa  465  1e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.643208  normal  0.915824 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0073  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.86 
 
 
561 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0804  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.83 
 
 
540 aa  459  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.271201  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0082  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.24 
 
 
578 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111773  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0082  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.05 
 
 
578 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2890  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.24 
 
 
534 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.561362  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2973  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.05 
 
 
578 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3708  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.64 
 
 
543 aa  461  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2659  GMC oxidoreductase  47.44 
 
 
549 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.24 
 
 
577 aa  458  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.713026  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1833  GMC oxidoreductase  47.44 
 
 
549 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3680  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.44 
 
 
537 aa  457  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.979094 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3294  GMC oxidoreductase  47.44 
 
 
549 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.38455  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2719  GMC oxidoreductase  47.44 
 
 
549 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.972032  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3378  oxidoreductase, GMC family protein  45.27 
 
 
561 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.869228  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1610  oxidoreductase, GMC family protein  45.27 
 
 
561 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3434  GMC family oxidoreductase  43.61 
 
 
539 aa  452  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3995  GMC family oxidoreductase  45.27 
 
 
561 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.530618  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2933  oxidoreductase, GMC family protein  45.27 
 
 
561 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2822  choline dehydrogenase  45.15 
 
 
551 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2991  oxidoreductase, GMC family protein  45.27 
 
 
561 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0670  GMC family oxidoreductase  44.15 
 
 
534 aa  451  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3840  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.55 
 
 
544 aa  449  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397758  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0201  oxidoreductase, GMC family protein  44.91 
 
 
561 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.260049  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4377  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.86 
 
 
551 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3595  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.54 
 
 
549 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3345  putative choline dehydrogenase lipoprotein oxidoreductase  45.56 
 
 
544 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3540  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.18 
 
 
544 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.200796 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>