More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4709 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4709  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 		 527 aa  1086    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0102  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.17 
 
 		 518 aa  389  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2727  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.35 
 
 		 525 aa  378  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0412228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4961  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.56 
 
 		 529 aa  374  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4708  Choline dehydrogenase  40.94 
 
 		 513 aa  363  6e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6126  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.55 
 
 		 569 aa  352  7e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.939433 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0572  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.66 
 
 		 531 aa  352  1e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0931268  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6414  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.36 
 
 		 569 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.981458 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1543  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.55 
 
 		 530 aa  350  3e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3840  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.35 
 
 		 544 aa  348  1e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397758  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1213  putative alcohol dehydrogenase (acceptor)  36.82 
 
 		 534 aa  345  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3910  Choline dehydrogenase  37.64 
 
 		 531 aa  341  2e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6778  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.3 
 
 		 539 aa  339  8e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3136  choline dehydrogenase  38.42 
 
 		 531 aa  338  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2604  choline dehydrogenase  36.36 
 
 		 562 aa  335  2e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142768 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1199  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.87 
 
 		 530 aa  333  5e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3840  choline dehydrogenase  36.16 
 
 		 561 aa  332  8e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2644  choline dehydrogenase  35.77 
 
 		 574 aa  332  8e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3131  normal  0.995844 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.07 
 
 		 534 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.917916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3792  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.15 
 
 		 535 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1348  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.46 
 
 		 555 aa  331  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1613  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.97 
 
 		 533 aa  330  5.0000000000000004e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4810  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.95 
 
 		 534 aa  329  9e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1334  choline dehydrogenase  34.59 
 
 		 560 aa  328  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4459  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.25 
 
 		 560 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0573714  hitchhiker  0.00237498 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2781  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.73 
 
 		 538 aa  325  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0926901  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2044  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.25 
 
 		 562 aa  325  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.544058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5304  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.59 
 
 		 546 aa  323  3e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1119  choline dehydrogenase  33.51 
 
 		 564 aa  323  4e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2190  choline dehydrogenase, a flavoprotein  34.61 
 
 		 541 aa  323  7e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2869  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.15 
 
 		 531 aa  322  9.000000000000001e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3919  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.88 
 
 		 572 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.326511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1993  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.22 
 
 		 553 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.689295 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5015  choline dehydrogenase, a flavoprotein  35.35 
 
 		 557 aa  322  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00654928  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3708  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.61 
 
 		 543 aa  322  9.999999999999999e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3245  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.64 
 
 		 541 aa  321  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3099  choline dehydrogenase  34.19 
 
 		 562 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0996  alcohol dehydrogenase  37.32 
 
 		 559 aa  319  6e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1946  choline dehydrogenase  33.45 
 
 		 560 aa  320  6e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10850  putative dehydrogenase  35.92 
 
 		 559 aa  319  7e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000202363  normal  0.801894 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02642  choline dehydrogenase  34.79 
 
 		 552 aa  319  7.999999999999999e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0477  Choline dehydrogenase  35.01 
 
 		 531 aa  319  9e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3637  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.84 
 
 		 576 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3313  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.66 
 
 		 576 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3611  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.74 
 
 		 534 aa  318  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5337  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.62 
 
 		 600 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.231686 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3601  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.52 
 
 		 572 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3680  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.6 
 
 		 534 aa  317  3e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1514  choline dehydrogenase  36.46 
 
 		 560 aa  317  3e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0264792  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3717  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.83 
 
 		 531 aa  317  4e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.975922 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6848  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.61 
 
 		 556 aa  317  5e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.90225 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0715  choline dehydrogenase  33.88 
 
 		 572 aa  316  5e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00120252  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2513  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.11 
 
 		 571 aa  316  8e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0138495  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3506  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.88 
 
 		 575 aa  315  9e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145411  normal  0.0815254 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2072  choline dehydrogenase  33.45 
 
 		 562 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2587  choline dehydrogenase  34.32 
 
 		 556 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.676646  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1169  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.75 
 
 		 544 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5650  Choline dehydrogenase  36.25 
 
 		 559 aa  314  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0562  choline dehydrogenase  36.65 
 
 		 549 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.55111 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0123  putative alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  35.4 
 
 		 574 aa  313  6.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1351  choline dehydrogenase  32.61 
 
 		 561 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.875987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3035  choline dehydrogenase  32.61 
 
 		 561 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.82163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1315  choline dehydrogenase  32.61 
 
 		 561 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1325  choline dehydrogenase  32.61 
 
 		 561 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1196  choline dehydrogenase  33.27 
 
 		 565 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000414657 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3836  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.18 
 
 		 552 aa  312  9e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2378  Choline dehydrogenase  35.99 
 
 		 551 aa  311  1e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.448643  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4010  choline dehydrogenase  32.97 
 
 		 561 aa  311  2e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0405578  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4369  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.96 
 
 		 556 aa  311  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.535677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0317  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.71 
 
 		 511 aa  311  2e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1882  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.62 
 
 		 534 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4749  glucose-methanol-choline oxidoreductase:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  34.7 
 
 		 546 aa  311  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769541  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1502  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.01 
 
 		 535 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0877  choline dehydrogenase  36.83 
 
 		 545 aa  310  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.988222  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0373  choline dehydrogenase  36.22 
 
 		 562 aa  310  4e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.868243  normal  0.338212 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0326  choline dehydrogenase  36.04 
 
 		 556 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0370  choline dehydrogenase  36.04 
 
 		 556 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3020  choline dehydrogenase  34.19 
 
 		 553 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3295  choline dehydrogenase  36.04 
 
 		 556 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1949  GMC family oxidoreductase  36.5 
 
 		 550 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0586145  unclonable  0.000000512241 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0776  choline dehydrogenase  34.49 
 
 		 549 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0802775 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3312  choline dehydrogenase  36.04 
 
 		 556 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1258  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.55 
 
 		 571 aa  307  3e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564674  decreased coverage  0.00861873 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0159  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.4 
 
 		 560 aa  307  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3214  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.95 
 
 		 544 aa  307  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3540  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.13 
 
 		 544 aa  307  3e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.200796 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00267  choline dehydrogenase  36.04 
 
 		 556 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1031  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.62 
 
 		 539 aa  306  4.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00270  hypothetical protein  36.04 
 
 		 556 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2557  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.76 
 
 		 526 aa  306  6e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.261253  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3345  putative choline dehydrogenase lipoprotein oxidoreductase  36.01 
 
 		 544 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3651  choline dehydrogenase  35.09 
 
 		 553 aa  305  1.0000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5947  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.29 
 
 		 550 aa  305  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4081  choline dehydrogenase  33.83 
 
 		 560 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6322  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.96 
 
 		 556 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3595  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.45 
 
 		 549 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3164  choline dehydrogenase  35.06 
 
 		 551 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.637341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2716  putative GMC oxidoreductase  35 
 
 		 562 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4377  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.46 
 
 		 551 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6980  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.73 
 
 		 556 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0315325  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>