More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4369 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4369  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 		 556 aa  1129    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.535677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3226  choline dehydrogenase  44.73 
 
 		 556 aa  422  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.191345 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3708  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.93 
 
 		 543 aa  420  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2604  choline dehydrogenase  44.04 
 
 		 562 aa  417  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142768 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1334  choline dehydrogenase  40.6 
 
 		 560 aa  413  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3245  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.07 
 
 		 541 aa  414  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3840  choline dehydrogenase  42.91 
 
 		 561 aa  409  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2644  choline dehydrogenase  40.57 
 
 		 574 aa  408  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3131  normal  0.995844 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4081  choline dehydrogenase  39.49 
 
 		 560 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2587  choline dehydrogenase  39.75 
 
 		 556 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.676646  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3754  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.99 
 
 		 552 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3099  choline dehydrogenase  42.22 
 
 		 562 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4010  choline dehydrogenase  40.57 
 
 		 561 aa  404  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0405578  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3020  choline dehydrogenase  43.7 
 
 		 553 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2184  choline dehydrogenase  43.01 
 
 		 548 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1196  choline dehydrogenase  40.62 
 
 		 565 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000414657 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2310  choline dehydrogenase  44.1 
 
 		 548 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.568209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3744  choline dehydrogenase  43.58 
 
 		 554 aa  397  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0339169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0856  choline dehydrogenase  42.83 
 
 		 548 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0715  choline dehydrogenase  41.68 
 
 		 572 aa  397  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00120252  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1882  choline dehydrogenase  41.86 
 
 		 551 aa  397  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3651  choline dehydrogenase  42.62 
 
 		 553 aa  395  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2190  choline dehydrogenase, a flavoprotein  41.95 
 
 		 541 aa  395  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0889  choline dehydrogenase  41.87 
 
 		 549 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02642  choline dehydrogenase  39.6 
 
 		 552 aa  390  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0991  choline dehydrogenase  43.25 
 
 		 552 aa  390  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0436021  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0776  choline dehydrogenase  41.5 
 
 		 549 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0802775 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4810  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.47 
 
 		 534 aa  392  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1007  choline dehydrogenase  40.66 
 
 		 565 aa  392  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0996  alcohol dehydrogenase  42.09 
 
 		 559 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1035  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.22 
 
 		 609 aa  387  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.77377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4867  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.26 
 
 		 560 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.348286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2890  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.07 
 
 		 534 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.561362  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2072  choline dehydrogenase  39.96 
 
 		 562 aa  387  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4282  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.21 
 
 		 541 aa  388  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0936618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1946  choline dehydrogenase  39.01 
 
 		 560 aa  386  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1896  choline dehydrogenase  43.73 
 
 		 550 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2709  choline dehydrogenase  42.27 
 
 		 549 aa  385  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3836  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.38 
 
 		 552 aa  383  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2781  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.77 
 
 		 538 aa  385  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0926901  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10850  putative dehydrogenase  41.68 
 
 		 559 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000202363  normal  0.801894 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5947  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.15 
 
 		 550 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0554  choline dehydrogenase  41.51 
 
 		 549 aa  380  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4961  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.68 
 
 		 529 aa  381  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1119  choline dehydrogenase  39.6 
 
 		 564 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2458  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.36 
 
 		 554 aa  379  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.144677  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01161  hypothetical alcohol dehydrogenase  41.11 
 
 		 550 aa  380  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0477  Choline dehydrogenase  43.43 
 
 		 531 aa  376  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0553  choline dehydrogenase  41.37 
 
 		 549 aa  378  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.93918  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1325  choline dehydrogenase  39.78 
 
 		 561 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0082  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.96 
 
 		 578 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.96 
 
 		 577 aa  378  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.713026  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1315  choline dehydrogenase  39.78 
 
 		 561 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1543  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.81 
 
 		 530 aa  377  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0100  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.74 
 
 		 561 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0481  choline dehydrogenase  42.04 
 
 		 565 aa  375  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1351  choline dehydrogenase  39.78 
 
 		 561 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.875987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2973  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.14 
 
 		 578 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3035  choline dehydrogenase  39.78 
 
 		 561 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.82163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0082  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.14 
 
 		 578 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5443  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.47 
 
 		 542 aa  373  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3717  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.25 
 
 		 531 aa  374  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.975922 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1832  choline dehydrogenase  41.19 
 
 		 560 aa  373  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.287087  normal  0.448798 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0530  choline dehydrogenase  41.77 
 
 		 570 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1348  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.73 
 
 		 555 aa  375  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6126  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.74 
 
 		 569 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.939433 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4519  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.06 
 
 		 542 aa  373  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0149458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0073  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.77 
 
 		 561 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0084  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.59 
 
 		 561 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6414  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.19 
 
 		 569 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.981458 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3136  choline dehydrogenase  39.56 
 
 		 531 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5064  choline dehydrogenase  40.72 
 
 		 565 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5244  choline dehydrogenase  41.41 
 
 		 567 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80037  normal  0.0658003 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0562  choline dehydrogenase  40.37 
 
 		 549 aa  372  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.55111 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1492  choline dehydrogenase  41.3 
 
 		 556 aa  370  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0804  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.53 
 
 		 540 aa  369  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.271201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3840  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.75 
 
 		 544 aa  370  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397758  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0401  choline dehydrogenase  41.05 
 
 		 563 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.726855 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70940  choline dehydrogenase  41.8 
 
 		 561 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.512014 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1613  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.86 
 
 		 533 aa  366  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4732  choline dehydrogenase  41.08 
 
 		 568 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4937  choline dehydrogenase  40.54 
 
 		 565 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6157  choline dehydrogenase  41.62 
 
 		 561 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.103614  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5115  choline dehydrogenase  40.36 
 
 		 565 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2831  choline dehydrogenase  41.83 
 
 		 567 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0201  oxidoreductase, GMC family protein  40.62 
 
 		 561 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.260049  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2917  choline dehydrogenase  41.83 
 
 		 567 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.80885  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3910  Choline dehydrogenase  41.76 
 
 		 531 aa  368  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1515  choline dehydrogenase  41.45 
 
 		 555 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.307618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000364  choline dehydrogenase  37.94 
 
 		 571 aa  366  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0373  choline dehydrogenase  40.36 
 
 		 562 aa  365  1e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.868243  normal  0.338212 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4069  GMC family oxidoreductase  40.8 
 
 		 561 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2933  oxidoreductase, GMC family protein  40.8 
 
 		 561 aa  365  1e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1610  oxidoreductase, GMC family protein  40.8 
 
 		 561 aa  365  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2991  oxidoreductase, GMC family protein  40.8 
 
 		 561 aa  365  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3995  GMC family oxidoreductase  40.8 
 
 		 561 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.530618  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3378  oxidoreductase, GMC family protein  40.8 
 
 		 561 aa  365  1e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.869228  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4293  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.85 
 
 		 567 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.485972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0102  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.19 
 
 		 518 aa  365  2e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0370  choline dehydrogenase  40.36 
 
 		 556 aa  364  2e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>