More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3651 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3651  choline dehydrogenase  100 
 
 		 553 aa  1123    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3744  choline dehydrogenase  66.91 
 
 		 554 aa  731    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0339169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2644  choline dehydrogenase  55.96 
 
 		 574 aa  606  9.999999999999999e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3131  normal  0.995844 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6015  choline dehydrogenase  54.7 
 
 		 570 aa  598  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386009  normal  0.639563 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3840  choline dehydrogenase  48.43 
 
 		 561 aa  532  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0481  choline dehydrogenase  51.67 
 
 		 565 aa  530  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1196  choline dehydrogenase  47.36 
 
 		 565 aa  528  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000414657 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0715  choline dehydrogenase  48.22 
 
 		 572 aa  530  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00120252  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1119  choline dehydrogenase  47.44 
 
 		 564 aa  527  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2831  choline dehydrogenase  51.94 
 
 		 567 aa  526  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2917  choline dehydrogenase  51.94 
 
 		 567 aa  526  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.80885  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4732  choline dehydrogenase  51.48 
 
 		 568 aa  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5244  choline dehydrogenase  50.37 
 
 		 567 aa  523  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80037  normal  0.0658003 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8399  choline dehydrogenase  52.77 
 
 		 574 aa  522  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.553301  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0401  choline dehydrogenase  50.74 
 
 		 563 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.726855 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1515  choline dehydrogenase  52.04 
 
 		 555 aa  524  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.307618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2587  choline dehydrogenase  47.25 
 
 		 556 aa  523  1e-147  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.676646  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5064  choline dehydrogenase  50.19 
 
 		 565 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193049  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4010  choline dehydrogenase  47.6 
 
 		 561 aa  520  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0405578  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3226  choline dehydrogenase  51.3 
 
 		 556 aa  519  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.191345 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2604  choline dehydrogenase  48.61 
 
 		 562 aa  521  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142768 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1007  choline dehydrogenase  45.95 
 
 		 565 aa  520  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1832  choline dehydrogenase  51.57 
 
 		 560 aa  518  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.287087  normal  0.448798 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1514  choline dehydrogenase  50.18 
 
 		 560 aa  519  1e-146  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0264792  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0443  choline dehydrogenase  50.93 
 
 		 568 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.300865  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6157  choline dehydrogenase  50.74 
 
 		 561 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.103614  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3099  choline dehydrogenase  49.07 
 
 		 562 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70940  choline dehydrogenase  50.74 
 
 		 561 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.512014 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5115  choline dehydrogenase  50 
 
 		 565 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4937  choline dehydrogenase  50.19 
 
 		 565 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0991  choline dehydrogenase  49.44 
 
 		 552 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0436021  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2554  choline dehydrogenase  51.11 
 
 		 559 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0102453  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1334  choline dehydrogenase  47.04 
 
 		 560 aa  513  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02642  choline dehydrogenase  47.85 
 
 		 552 aa  512  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1946  choline dehydrogenase  46.3 
 
 		 560 aa  514  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2072  choline dehydrogenase  46.1 
 
 		 562 aa  511  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2709  choline dehydrogenase  47.11 
 
 		 549 aa  511  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3792  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50.09 
 
 		 535 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5058  choline dehydrogenase  50.73 
 
 		 561 aa  510  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0575159 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4716  choline dehydrogenase  51.76 
 
 		 561 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.959774  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0553  choline dehydrogenase  47.67 
 
 		 549 aa  508  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.93918  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0326  choline dehydrogenase  49.81 
 
 		 556 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0370  choline dehydrogenase  49.81 
 
 		 556 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1592  choline dehydrogenase  50.18 
 
 		 561 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.860333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0554  choline dehydrogenase  47.67 
 
 		 549 aa  508  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00267  choline dehydrogenase  49.63 
 
 		 556 aa  504  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3295  choline dehydrogenase  49.81 
 
 		 556 aa  504  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1315  choline dehydrogenase  45.86 
 
 		 561 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1351  choline dehydrogenase  45.86 
 
 		 561 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.875987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1325  choline dehydrogenase  45.86 
 
 		 561 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3312  choline dehydrogenase  49.81 
 
 		 556 aa  504  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00270  hypothetical protein  49.63 
 
 		 556 aa  504  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0373  choline dehydrogenase  49.26 
 
 		 562 aa  502  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.868243  normal  0.338212 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3035  choline dehydrogenase  45.86 
 
 		 561 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.82163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3536  choline dehydrogenase  50 
 
 		 566 aa  500  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5037  choline dehydrogenase  49.54 
 
 		 566 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3310  choline dehydrogenase  50.55 
 
 		 572 aa  499  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.903723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5834  choline dehydrogenase  49.54 
 
 		 577 aa  501  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3020  choline dehydrogenase  49.16 
 
 		 553 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4081  choline dehydrogenase  45.62 
 
 		 560 aa  500  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4512  choline dehydrogenase  49.54 
 
 		 566 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.422466 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5182  choline dehydrogenase  49.36 
 
 		 566 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.222705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5100  choline dehydrogenase  49.36 
 
 		 566 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50.75 
 
 		 534 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.917916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3268  choline dehydrogenase  49.36 
 
 		 566 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.121076  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0776  choline dehydrogenase  47.48 
 
 		 549 aa  495  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0802775 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2190  choline dehydrogenase, a flavoprotein  50 
 
 		 541 aa  494  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0553  choline dehydrogenase  49.36 
 
 		 566 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0342  choline dehydrogenase  49.07 
 
 		 562 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2458  glucose-methanol-choline oxidoreductase  49.81 
 
 		 554 aa  494  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.144677  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0856  choline dehydrogenase  48.16 
 
 		 548 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2184  choline dehydrogenase  47.98 
 
 		 548 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1072  choline dehydrogenase  49.44 
 
 		 565 aa  490  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00240234  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0889  choline dehydrogenase  47.29 
 
 		 549 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1925  choline dehydrogenase  49.26 
 
 		 565 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0217321  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0377  choline dehydrogenase  49.26 
 
 		 565 aa  488  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.119078  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1837  choline dehydrogenase  49.26 
 
 		 565 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1428  choline dehydrogenase  49.07 
 
 		 565 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.783226  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0130  choline dehydrogenase  46.34 
 
 		 547 aa  483  1e-135  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000105235  normal  0.777409 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0914  choline dehydrogenase  49.07 
 
 		 565 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267909  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0468  choline dehydrogenase  49.07 
 
 		 565 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0179  choline dehydrogenase  49.07 
 
 		 565 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1882  choline dehydrogenase  47.29 
 
 		 551 aa  483  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1882  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.87 
 
 		 534 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0530  choline dehydrogenase  48.79 
 
 		 570 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2310  choline dehydrogenase  47.61 
 
 		 548 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.568209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1199  glucose-methanol-choline oxidoreductase  51.21 
 
 		 530 aa  480  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1502  glucose-methanol-choline oxidoreductase  49.44 
 
 		 535 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1213  putative alcohol dehydrogenase (acceptor)  48.31 
 
 		 534 aa  481  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06179  choline dehydrogenase  43.82 
 
 		 569 aa  476  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4186  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.15 
 
 		 546 aa  478  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.296115 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6778  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.68 
 
 		 539 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0562  choline dehydrogenase  46.17 
 
 		 549 aa  476  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.55111 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000364  choline dehydrogenase  43.97 
 
 		 571 aa  473  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3680  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.92 
 
 		 534 aa  472  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2822  choline dehydrogenase  45.84 
 
 		 551 aa  472  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0728  choline dehydrogenase  46.49 
 
 		 566 aa  469  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1896  choline dehydrogenase  46.37 
 
 		 550 aa  470  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4282  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.14 
 
 		 541 aa  466  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0936618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5414  choline dehydrogenase, a flavoprotein  47.96 
 
 		 534 aa  467  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.269281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>