More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA3275 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A2148  GMC family oxidoreductase  100 
 
 		 613 aa  1115    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3275  GMC family oxidoreductase  100 
 
 		 547 aa  1114    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.183424  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3406  GMC family oxidoreductase  100 
 
 		 547 aa  1114    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3089  glucose-methanol-choline oxidoreductase  85.16 
 
 		 546 aa  940    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.203231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0411  GMC family oxidoreductase  100 
 
 		 547 aa  1114    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0216  GMC family oxidoreductase  99.63 
 
 		 547 aa  1111    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0487725  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6419  glucose-methanol-choline oxidoreductase  86.65 
 
 		 546 aa  935    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2941  GMC family oxidoreductase  100 
 
 		 547 aa  1114    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.44858  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0194  GMC family oxidoreductase  95.26 
 
 		 548 aa  1066    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3070  glucose-methanol-choline oxidoreductase  85.53 
 
 		 546 aa  944    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.606173  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0174  glucose-methanol-choline oxidoreductase  74.02 
 
 		 552 aa  832    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3067  glucose-methanol-choline oxidoreductase  85.9 
 
 		 546 aa  942    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.766547 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2456  glucose-methanol-choline oxidoreductase  85.53 
 
 		 546 aa  944    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101134  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0228  GMC family oxidoreductase  100 
 
 		 547 aa  1114    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3762  glucose-methanol-choline oxidoreductase  73.71 
 
 		 552 aa  839    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3115  glucose-methanol-choline oxidoreductase  86.26 
 
 		 546 aa  943    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2981  glucose-methanol-choline oxidoreductase  85.9 
 
 		 546 aa  939    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3313  glucose-methanol-choline oxidoreductase  57.35 
 
 		 576 aa  619  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3637  glucose-methanol-choline oxidoreductase  58.72 
 
 		 576 aa  618  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67419  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0123  putative alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  58.53 
 
 		 574 aa  615  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0203  glucose-methanol-choline oxidoreductase:GMC oxidoreductase  59.04 
 
 		 559 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4749  glucose-methanol-choline oxidoreductase:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  55.62 
 
 		 546 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769541  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6778  glucose-methanol-choline oxidoreductase  54.18 
 
 		 539 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2716  putative GMC oxidoreductase  53.3 
 
 		 562 aa  559  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3826  glucose-methanol-choline oxidoreductase:Beta-lactamase-like:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  54.34 
 
 		 1290 aa  557  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6848  glucose-methanol-choline oxidoreductase  55.22 
 
 		 556 aa  557  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.90225 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2513  glucose-methanol-choline oxidoreductase  55.87 
 
 		 571 aa  556  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0138495  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0159  glucose-methanol-choline oxidoreductase  55.82 
 
 		 560 aa  557  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3919  glucose-methanol-choline oxidoreductase  56.93 
 
 		 572 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.326511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4459  glucose-methanol-choline oxidoreductase  54.65 
 
 		 560 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0573714  hitchhiker  0.00237498 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5015  choline dehydrogenase, a flavoprotein  54.73 
 
 		 557 aa  553  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00654928  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3601  glucose-methanol-choline oxidoreductase  56.93 
 
 		 572 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3792  glucose-methanol-choline oxidoreductase  53.89 
 
 		 535 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  54.56 
 
 		 534 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.917916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5337  glucose-methanol-choline oxidoreductase  56.23 
 
 		 600 aa  548  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.231686 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3506  glucose-methanol-choline oxidoreductase  56.04 
 
 		 575 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145411  normal  0.0815254 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4186  glucose-methanol-choline oxidoreductase  52.61 
 
 		 546 aa  540  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.296115 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0477  Choline dehydrogenase  54.24 
 
 		 531 aa  536  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1213  putative alcohol dehydrogenase (acceptor)  52.25 
 
 		 534 aa  538  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3717  glucose-methanol-choline oxidoreductase  53.86 
 
 		 531 aa  534  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.975922 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1882  glucose-methanol-choline oxidoreductase  52.99 
 
 		 534 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1502  glucose-methanol-choline oxidoreductase  53.7 
 
 		 535 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1199  glucose-methanol-choline oxidoreductase  53.88 
 
 		 530 aa  535  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5414  choline dehydrogenase, a flavoprotein  50.47 
 
 		 534 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.269281 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50.37 
 
 		 563 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0279119  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0437  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50.47 
 
 		 532 aa  512  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.253187  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0572  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50.66 
 
 		 531 aa  499  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0931268  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  51.02 
 
 		 541 aa  498  1e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0882717  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5443  glucose-methanol-choline oxidoreductase  49.91 
 
 		 542 aa  495  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078996  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0670  GMC family oxidoreductase  46.42 
 
 		 534 aa  493  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2781  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.92 
 
 		 538 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0926901  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1846  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.13 
 
 		 547 aa  488  1e-136  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.845154 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2331  glucose-methanol-choline oxidoreductase  51.61 
 
 		 528 aa  487  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.745478 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1614  glucose-methanol-choline oxidoreductase:GMC oxidoreductase  46.93 
 
 		 547 aa  478  1e-133  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2644  choline dehydrogenase  46.18 
 
 		 574 aa  468  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3131  normal  0.995844 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01161  hypothetical alcohol dehydrogenase  46.38 
 
 		 550 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6015  choline dehydrogenase  46.65 
 
 		 570 aa  467  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386009  normal  0.639563 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5304  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.16 
 
 		 546 aa  459  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2190  choline dehydrogenase, a flavoprotein  45.76 
 
 		 541 aa  456  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3434  GMC family oxidoreductase  44.22 
 
 		 539 aa  454  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4961  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.98 
 
 		 529 aa  452  1.0000000000000001e-126  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0996  alcohol dehydrogenase  46.03 
 
 		 559 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0054  GMC oxidoreductase  46.47 
 
 		 556 aa  445  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.810146  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3651  choline dehydrogenase  46.73 
 
 		 553 aa  444  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10850  putative dehydrogenase  45.69 
 
 		 559 aa  443  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000202363  normal  0.801894 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0062  GMC oxidoreductase  45.93 
 
 		 556 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0061  GMC oxidoreductase  45.93 
 
 		 556 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0278  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase family protein  45.93 
 
 		 556 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914416  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4519  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.22 
 
 		 542 aa  435  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0149458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1348  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.67 
 
 		 555 aa  432  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0804  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.14 
 
 		 540 aa  429  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.271201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3144  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.42 
 
 		 521 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3840  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.22 
 
 		 544 aa  429  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397758  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4282  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.28 
 
 		 541 aa  427  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0936618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3744  choline dehydrogenase  45.03 
 
 		 554 aa  426  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0339169  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2659  GMC oxidoreductase  45.39 
 
 		 549 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1833  GMC oxidoreductase  45.39 
 
 		 549 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4810  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.7 
 
 		 534 aa  422  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3595  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.24 
 
 		 549 aa  423  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2719  GMC oxidoreductase  45.39 
 
 		 549 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.972032  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3294  GMC oxidoreductase  45.39 
 
 		 549 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.38455  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4657  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.76 
 
 		 537 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5947  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.78 
 
 		 550 aa  413  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3680  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.36 
 
 		 537 aa  414  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.979094 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3836  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.53 
 
 		 552 aa  411  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1635  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.42 
 
 		 534 aa  410  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.643208  normal  0.915824 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4211  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.14 
 
 		 559 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.94 
 
 		 536 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2005  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.91 
 
 		 551 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2890  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.11 
 
 		 534 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.561362  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4528  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.24 
 
 		 550 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.167866 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3245  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.96 
 
 		 541 aa  402  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1949  GMC family oxidoreductase  41.18 
 
 		 550 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0586145  unclonable  0.000000512241 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3020  choline dehydrogenase  43.9 
 
 		 553 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0884  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.36 
 
 		 553 aa  395  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.275807  normal  0.461656 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2604  choline dehydrogenase  40.53 
 
 		 562 aa  394  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142768 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2869  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.97 
 
 		 531 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2223  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.46 
 
 		 531 aa  390  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.487572  normal  0.417914 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0991  choline dehydrogenase  42.86 
 
 		 552 aa  390  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0436021  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4183  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.06 
 
 		 557 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000160741 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>