More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1255 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1255  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 		 535 aa  1088    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000162528 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5026  glucose-methanol-choline oxidoreductase  80.83 
 
 		 533 aa  900    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5319  glucose-methanol-choline oxidoreductase  80.64 
 
 		 533 aa  891    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0918272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4938  glucose-methanol-choline oxidoreductase  80.83 
 
 		 533 aa  900    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5894  glucose-methanol-choline oxidoreductase  57.04 
 
 		 534 aa  621  1e-177  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0946  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.57 
 
 		 538 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0366  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.91 
 
 		 531 aa  431  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.136332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6890  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.07 
 
 		 533 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1348  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.1 
 
 		 555 aa  404  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2190  choline dehydrogenase, a flavoprotein  42.72 
 
 		 541 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6820  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.37 
 
 		 602 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1169  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.8 
 
 		 544 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7484  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.83 
 
 		 540 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4377  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.96 
 
 		 551 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0698  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.48 
 
 		 551 aa  385  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.763915  decreased coverage  0.00316946 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3554  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.2 
 
 		 540 aa  380  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4278  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.82 
 
 		 546 aa  381  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.942105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3611  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.91 
 
 		 534 aa  376  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.4 
 
 		 577 aa  378  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.713026  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2005  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.18 
 
 		 551 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0100  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.21 
 
 		 561 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6414  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.68 
 
 		 569 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.981458 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6221  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42 
 
 		 551 aa  375  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.768834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6126  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.31 
 
 		 569 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.939433 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0084  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.51 
 
 		 561 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3680  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.16 
 
 		 537 aa  372  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.979094 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2973  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.03 
 
 		 578 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0073  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.51 
 
 		 561 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0082  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.03 
 
 		 578 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4282  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.7 
 
 		 541 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0936618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1579  GMC family oxidoreductase  39.47 
 
 		 538 aa  369  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1397  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.43 
 
 		 532 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3836  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.23 
 
 		 552 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4810  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.85 
 
 		 534 aa  371  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.26 
 
 		 536 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0899  GMC family oxidoreductase  40.87 
 
 		 532 aa  368  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.886406  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2869  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.67 
 
 		 531 aa  368  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6724  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.78 
 
 		 531 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.567592  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0958  GMC family oxidoreductase  40.87 
 
 		 532 aa  368  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3540  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.37 
 
 		 544 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.200796 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1733  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42 
 
 		 549 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0167412  normal  0.0176419 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2890  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.7 
 
 		 534 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.561362  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4518  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.46 
 
 		 550 aa  368  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.173052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4528  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.43 
 
 		 550 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.167866 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5162  Choline dehydrogenase  41.13 
 
 		 541 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0769143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3214  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.37 
 
 		 544 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2933  oxidoreductase, GMC family protein  41.46 
 
 		 561 aa  365  1e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3378  oxidoreductase, GMC family protein  41.46 
 
 		 561 aa  365  1e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.869228  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2991  oxidoreductase, GMC family protein  41.46 
 
 		 561 aa  365  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3995  GMC family oxidoreductase  41.46 
 
 		 561 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.530618  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1610  oxidoreductase, GMC family protein  41.46 
 
 		 561 aa  365  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1949  GMC family oxidoreductase  41.73 
 
 		 550 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0586145  unclonable  0.000000512241 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0082  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.76 
 
 		 578 aa  364  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4519  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.09 
 
 		 542 aa  364  2e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0149458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3708  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.75 
 
 		 543 aa  364  2e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1712  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.86 
 
 		 536 aa  364  2e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334858  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3345  putative choline dehydrogenase lipoprotein oxidoreductase  42.37 
 
 		 544 aa  363  3e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3245  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.54 
 
 		 556 aa  364  3e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3916  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.45 
 
 		 570 aa  363  4e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0201  oxidoreductase, GMC family protein  41.09 
 
 		 561 aa  363  6e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.260049  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4069  GMC family oxidoreductase  41.76 
 
 		 561 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0379  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.03 
 
 		 561 aa  361  1e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0016  GMC family oxidoreductase  40.89 
 
 		 571 aa  361  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3332  oxidoreductase, GMC family protein  41.09 
 
 		 561 aa  360  4e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5304  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.75 
 
 		 546 aa  360  5e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2458  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42 
 
 		 554 aa  359  6e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.144677  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2644  choline dehydrogenase  38.58 
 
 		 574 aa  358  9.999999999999999e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3131  normal  0.995844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4819  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.23 
 
 		 556 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2838  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.27 
 
 		 555 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0056  GMC family oxidoreductase  39.25 
 
 		 550 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000620913 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5818  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.26 
 
 		 531 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.673966  normal  0.0679471 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3566  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.05 
 
 		 539 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5265  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.89 
 
 		 546 aa  355  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371791  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0075  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.25 
 
 		 548 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0217236  hitchhiker  0.000000000166725 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0804  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.11 
 
 		 540 aa  354  2e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.271201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0072  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.25 
 
 		 548 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.010293  normal  0.0125106 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0072  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.25 
 
 		 548 aa  352  8e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000289824 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4293  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.56 
 
 		 567 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.485972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4961  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.13 
 
 		 529 aa  352  1e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3595  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.74 
 
 		 549 aa  351  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2587  choline dehydrogenase  39.41 
 
 		 556 aa  350  3e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.676646  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2379  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.77 
 
 		 571 aa  350  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3434  GMC family oxidoreductase  37.71 
 
 		 539 aa  350  4e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.75 
 
 		 563 aa  350  4e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0279119  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3358  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.7 
 
 		 550 aa  349  8e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.442957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3734  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.85 
 
 		 539 aa  349  8e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.569573  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3292  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.66 
 
 		 533 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4081  choline dehydrogenase  38.01 
 
 		 560 aa  348  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4024  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.66 
 
 		 533 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6272  putative choline (or alcohol) dehydrogenase  39.25 
 
 		 544 aa  348  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3050  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.07 
 
 		 564 aa  347  3e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16390  putative GMC-type oxidoreductase  39.74 
 
 		 557 aa  347  4e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3373  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.11 
 
 		 553 aa  346  5e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1942  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.52 
 
 		 533 aa  347  5e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3020  choline dehydrogenase  39.51 
 
 		 553 aa  346  6e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4251  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.11 
 
 		 539 aa  346  7e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.773505  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0437  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.19 
 
 		 532 aa  345  1e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.253187  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1487  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.55 
 
 		 551 aa  345  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.354481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5947  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.26 
 
 		 550 aa  344  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2981  GMC-type oxidoreductase  40.41 
 
 		 539 aa  345  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172421  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>