More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5894 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5894  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 		 534 aa  1081    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5026  glucose-methanol-choline oxidoreductase  55.91 
 
 		 533 aa  622  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5319  glucose-methanol-choline oxidoreductase  56.29 
 
 		 533 aa  624  1e-177  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0918272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1255  glucose-methanol-choline oxidoreductase  57.04 
 
 		 535 aa  621  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000162528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4938  glucose-methanol-choline oxidoreductase  55.91 
 
 		 533 aa  622  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6890  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50.09 
 
 		 533 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0366  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.62 
 
 		 531 aa  435  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.136332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0946  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.81 
 
 		 538 aa  428  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6820  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.23 
 
 		 602 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2190  choline dehydrogenase, a flavoprotein  39.59 
 
 		 541 aa  363  3e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.6 
 
 		 536 aa  363  4e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4810  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.17 
 
 		 534 aa  363  6e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3434  GMC family oxidoreductase  36.26 
 
 		 539 aa  355  1e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6221  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.82 
 
 		 551 aa  355  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.768834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7484  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.84 
 
 		 540 aa  354  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6414  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.81 
 
 		 569 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.981458 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1942  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.22 
 
 		 533 aa  353  4e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4377  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.15 
 
 		 551 aa  353  5e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2644  choline dehydrogenase  38.25 
 
 		 574 aa  353  5.9999999999999994e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3131  normal  0.995844 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1348  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.82 
 
 		 555 aa  352  8.999999999999999e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3836  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.93 
 
 		 552 aa  352  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4278  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.62 
 
 		 546 aa  350  3e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.942105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0100  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.44 
 
 		 561 aa  350  4e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3554  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.3 
 
 		 540 aa  350  4e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.25 
 
 		 577 aa  349  9e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.713026  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0332  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.48 
 
 		 544 aa  348  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6126  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.88 
 
 		 569 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.939433 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2973  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.07 
 
 		 578 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0082  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.07 
 
 		 578 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4528  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.77 
 
 		 550 aa  347  3e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.167866 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0379  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.33 
 
 		 561 aa  346  6e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3708  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38 
 
 		 543 aa  346  7e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3680  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.74 
 
 		 537 aa  345  1e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.979094 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2890  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.45 
 
 		 534 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.561362  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1169  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.71 
 
 		 544 aa  344  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0698  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.15 
 
 		 551 aa  344  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.763915  decreased coverage  0.00316946 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0073  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.92 
 
 		 561 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0084  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.73 
 
 		 561 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3595  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.59 
 
 		 549 aa  343  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4010  choline dehydrogenase  37.85 
 
 		 561 aa  343  5e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0405578  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2005  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.51 
 
 		 551 aa  343  5e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0804  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.42 
 
 		 540 aa  342  7e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.271201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3035  choline dehydrogenase  37.97 
 
 		 561 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.82163  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2933  oxidoreductase, GMC family protein  39.85 
 
 		 561 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2991  oxidoreductase, GMC family protein  39.85 
 
 		 561 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1351  choline dehydrogenase  37.97 
 
 		 561 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.875987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1610  oxidoreductase, GMC family protein  39.85 
 
 		 561 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1196  choline dehydrogenase  38.59 
 
 		 565 aa  342  1e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000414657 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1325  choline dehydrogenase  37.97 
 
 		 561 aa  341  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3378  oxidoreductase, GMC family protein  39.85 
 
 		 561 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.869228  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1315  choline dehydrogenase  37.97 
 
 		 561 aa  341  1e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4069  GMC family oxidoreductase  39.85 
 
 		 561 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3995  GMC family oxidoreductase  39.85 
 
 		 561 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.530618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0201  oxidoreductase, GMC family protein  39.85 
 
 		 561 aa  340  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.260049  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4519  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.03 
 
 		 542 aa  337  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0149458  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1334  choline dehydrogenase  38.46 
 
 		 560 aa  337  5e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3332  oxidoreductase, GMC family protein  39.55 
 
 		 561 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2838  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.52 
 
 		 555 aa  335  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1007  choline dehydrogenase  38.55 
 
 		 565 aa  334  3e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2587  choline dehydrogenase  37.41 
 
 		 556 aa  333  3e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.676646  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0530  choline dehydrogenase  39.51 
 
 		 570 aa  333  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0082  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.13 
 
 		 578 aa  333  4e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2458  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.67 
 
 		 554 aa  333  4e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.144677  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5414  choline dehydrogenase, a flavoprotein  39.96 
 
 		 534 aa  333  4e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.269281 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10850  putative dehydrogenase  38.22 
 
 		 559 aa  333  5e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000202363  normal  0.801894 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3020  choline dehydrogenase  38.52 
 
 		 553 aa  333  6e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02642  choline dehydrogenase  37.83 
 
 		 552 aa  333  6e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1579  GMC family oxidoreductase  37.1 
 
 		 538 aa  332  8e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2072  choline dehydrogenase  37.15 
 
 		 562 aa  332  8e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1946  choline dehydrogenase  36.89 
 
 		 560 aa  332  8e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1119  choline dehydrogenase  37.78 
 
 		 564 aa  332  9e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0715  choline dehydrogenase  37.55 
 
 		 572 aa  331  2e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00120252  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3840  choline dehydrogenase  38.03 
 
 		 561 aa  330  4e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0996  alcohol dehydrogenase  38.39 
 
 		 559 aa  330  4e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6373  glucose-methanol-choline oxidoreductase:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  38.25 
 
 		 540 aa  329  8e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1543  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.42 
 
 		 530 aa  327  2.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2379  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.94 
 
 		 571 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3916  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.62 
 
 		 570 aa  327  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4282  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.89 
 
 		 541 aa  327  3e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0936618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.71 
 
 		 563 aa  327  3e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0279119  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3358  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.52 
 
 		 550 aa  327  5e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.442957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0016  GMC family oxidoreductase  36.62 
 
 		 571 aa  326  6e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3754  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.7 
 
 		 537 aa  326  8.000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.674224  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1613  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.39 
 
 		 533 aa  325  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1582  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.72 
 
 		 533 aa  325  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3680  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.09 
 
 		 534 aa  323  4e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0398  GMC family oxidoreductase  38.42 
 
 		 544 aa  323  6e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3214  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.38 
 
 		 544 aa  322  8e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2869  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.59 
 
 		 531 aa  322  8e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5265  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.8 
 
 		 546 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371791  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3245  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.96 
 
 		 541 aa  322  9.999999999999999e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3540  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.2 
 
 		 544 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.200796 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4865  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.64 
 
 		 539 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.69396  normal  0.438414 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0991  choline dehydrogenase  38.5 
 
 		 552 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0436021  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0075  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.66 
 
 		 548 aa  321  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0217236  hitchhiker  0.000000000166725 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3345  putative choline dehydrogenase lipoprotein oxidoreductase  37.57 
 
 		 544 aa  320  5e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3734  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.62 
 
 		 539 aa  320  5e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.569573  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5947  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.66 
 
 		 550 aa  319  7e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1993  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.55 
 
 		 553 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.689295 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3578  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.03 
 
 		 541 aa  319  7.999999999999999e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>